RNA–Protein interactions for RNA: YBL011W

SCT1, Transcript of Glycerol 3-phosphate/dihydroxyacetone phosphate sn-1 acyltransferase, yeast

Gene SCT1, Length 2,280 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SCT1	YBL011W	MRPS9	P38120	278 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SCT1	YBL011W	BNA2	P47125	453 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SCT1	YBL011W	BNS1	P50084	137 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SCT1	YBL011W	HHT1	P61830	136 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SCT1	YBL011W	THI74	Q04083	370 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SCT1	YBL011W	YPR174C	Q06616	221 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
SCT1	YBL011W	COX1	P00401	534 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SCT1	YBL011W	SEC4	P07560	215 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
SCT1	YBL011W	YOL162W	P0CF19	215 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SCT1	YBL011W	STE18	P18852	110 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SCT1	YBL011W	GPI12	P23797	304 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SCT1	YBL011W	YCR100C	P25606	316 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SCT1	YBL011W	PUB1	P32588	453 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.04	□□□□□ -1.6	not detected
SCT1	YBL011W	SKN1	P33336	771 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SCT1	YBL011W	NNK1	P36003	928 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SCT1	YBL011W	IRC22	P40006	225 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SCT1	YBL011W	CAT5	P41735	233 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SCT1	YBL011W	YFR057W	P43625	151 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SCT1	YBL011W	PGA1	P53896	198 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SCT1	YBL011W	TSA2	Q04120	196 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SCT1	YBL011W	HRI1	Q05905	244 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
SCT1	YBL011W	ATG41	Q12048	136 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SCT1	YBL011W	YDL157C	Q12082	118 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SCT1	YBL011W	MCP1	Q12106	302 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SCT1	YBL011W	TIR4	Q12218	487 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
SCT1	YBL011W	ERV2	Q12284	196 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SCT1	YBL011W	YLR118C	Q12354	227 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SCT1	YBL011W	Q0182	Q9ZZW1	134 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SCT1	YBL011W	MSB2	P32334	1306 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SCT1	YBL011W	ADH1	P00330	348 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
SCT1	YBL011W	FCY2	P17064	533 aa		5.03	□□□□□ -1.6
SCT1	YBL011W	TRR1	P29509	319 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
SCT1	YBL011W	PAN3	P36102	679 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
SCT1	YBL011W	PAU24	P38155	120 aa		5.03	□□□□□ -1.6
SCT1	YBL011W	PSD1	P39006	500 aa		5.03	□□□□□ -1.6
SCT1	YBL011W	YFL065C	P43539	102 aa		5.03	□□□□□ -1.6
SCT1	YBL011W	TOS2	P50078	622 aa		5.03	□□□□□ -1.6
SCT1	YBL011W	AQR1	P53943	586 aa		5.03	□□□□□ -1.6
SCT1	YBL011W	YPR203W	Q08994	102 aa		5.03	□□□□□ -1.6
SCT1	YBL011W	PFA4	Q12006	378 aa		5.03	□□□□□ -1.6
SCT1	YBL011W	YBL112C	Q3E7Y4	105 aa		5.03	□□□□□ -1.6
SCT1	YBL011W	CPT1	P17898	393 aa		5.03	□□□□□ -1.6
SCT1	YBL011W	RAD23	P32628	398 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
SCT1	YBL011W	VHT1	P53241	593 aa		5.03	□□□□□ -1.6
SCT1	YBL011W	APJ1	P53940	528 aa		5.03	□□□□□ -1.6
SCT1	YBL011W	PRM3	Q08931	133 aa		5.03	□□□□□ -1.6
SCT1	YBL011W	YLR111W	Q12528	110 aa		5.03	□□□□□ -1.6
SCT1	YBL011W	SLC1	P33333	303 aa		5.02	□□□□□ -1.61
SCT1	YBL011W	UME6	P39001	836 aa		5.02	□□□□□ -1.61
SCT1	YBL011W	PEX7	P39108	375 aa		5.02	□□□□□ -1.61
SCT1	YBL011W	YNL198C	P40166	100 aa		5.02	□□□□□ -1.61
SCT1	YBL011W	PRE5	P40302	234 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
SCT1	YBL011W	ATG27	P46989	271 aa		5.02	□□□□□ -1.61
SCT1	YBL011W	PAU12	P53343	120 aa		5.02	□□□□□ -1.61
SCT1	YBL011W	DUG3	P53871	357 aa		5.02	□□□□□ -1.61
SCT1	YBL011W	RPL7B	Q12213	244 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
SCT1	YBL011W	RPS21B	Q3E754	87 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
SCT1	YBL011W	YLR415C	O13578	112 aa		5.02	□□□□□ -1.61
SCT1	YBL011W	CDC43	P18898	376 aa		5.02	□□□□□ -1.61
SCT1	YBL011W	MIX23	P38162	196 aa		5.02	□□□□□ -1.61
SCT1	YBL011W	ECM34	P38728	170 aa		5.02	□□□□□ -1.61
SCT1	YBL011W	TRR2	P38816	342 aa		5.02	□□□□□ -1.61
SCT1	YBL011W	SDP1	P40479	209 aa		5.02	□□□□□ -1.61
SCT1	YBL011W	SMM1	P53720	384 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
SCT1	YBL011W	YNR048W	P53740	393 aa		5.02	□□□□□ -1.61
SCT1	YBL011W	YHM2	Q04013	314 aa		5.02	□□□□□ -1.61
SCT1	YBL011W	YMR252C	Q04814	134 aa		5.02	□□□□□ -1.61
SCT1	YBL011W	MRPL51	Q06090	140 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
SCT1	YBL011W	RRG8	Q06109	277 aa		5.02	□□□□□ -1.61
SCT1	YBL011W	PRS5	Q12265	496 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
SCT1	YBL011W	POM34	Q12445	299 aa		5.02	□□□□□ -1.61
SCT1	YBL011W	SEN1	Q00416	2231 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
SCT1	YBL011W	CTA1	P15202	515 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SCT1	YBL011W	FPR1	P20081	114 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
SCT1	YBL011W	SPC25	P40014	221 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SCT1	YBL011W	SNO2	P53823	222 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SCT1	YBL011W	EST3	Q03096	181 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SCT1	YBL011W	GRH1	Q04410	372 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
SCT1	YBL011W	LIP2	Q06005	328 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SCT1	YBL011W	YOR029W	Q12243	111 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SCT1	YBL011W	ORT1	Q12375	292 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SCT1	YBL011W	MDM35	O60200	86 aa		5	□□□□□ -1.61
SCT1	YBL011W	ECM33	P38248	429 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
SCT1	YBL011W	SNO3	P43544	222 aa		5	□□□□□ -1.61
SCT1	YBL011W	TTI2	P47168	421 aa		5	□□□□□ -1.61
SCT1	YBL011W	RNH201	P53942	307 aa		5	□□□□□ -1.61
SCT1	YBL011W	NUP53	Q03790	475 aa		5	□□□□□ -1.61
SCT1	YBL011W	HLR1	Q04429	423 aa		5	□□□□□ -1.61
SCT1	YBL011W	OPI10	Q08202	246 aa		5	□□□□□ -1.61
SCT1	YBL011W	RFA3	P26755	122 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
SCT1	YBL011W	KTI12	P34253	313 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
SCT1	YBL011W	FRM2	P37261	193 aa		5	□□□□□ -1.61
SCT1	YBL011W	PTH1	P38876	190 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
SCT1	YBL011W	YNL195C	P40168	261 aa		5	□□□□□ -1.61
SCT1	YBL011W	PAU5	P43575	122 aa		5	□□□□□ -1.61
SCT1	YBL011W	PDR17	P53844	350 aa		5	□□□□□ -1.61
SCT1	YBL011W	ABF2	Q02486	183 aa		5	□□□□□ -1.61
SCT1	YBL011W	COX19	Q3E731	98 aa		5	□□□□□ -1.61
SCT1	YBL011W	SOD2	P00447	233 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SCT1	YBL011W	HMRA1	P0CY11	126 aa		4.99	□□□□□ -1.61

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