RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505490.2

ALYREF-202, Transcript of Aly/REF export factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ALYREF, Length 1,088 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREF-202ENST00000505490 HSFX1Q9UBD0 423 aa32.82■■■□□ 2.84
ALYREF-202ENST00000505490 ANK1P16157 1881 aa32.82■■■□□ 2.84
ALYREF-202ENST00000505490 A0A0B4J269 797 aa32.81■■■□□ 2.84
ALYREF-202ENST00000505490 HEPACAM2A8MVW5 462 aa32.81■■■□□ 2.84
ALYREF-202ENST00000505490 OGTO15294 1046 aa32.81■■■□□ 2.84
ALYREF-202ENST00000505490 XPOTO43592 962 aaKnown RBP32.81■■■□□ 2.84
ALYREF-202ENST00000505490 CHRNB1P11230 501 aa32.81■■■□□ 2.84
ALYREF-202ENST00000505490 PAX3P23760 479 aa32.81■■■□□ 2.84
ALYREF-202ENST00000505490 DUSP4Q13115 394 aa32.81■■■□□ 2.84
ALYREF-202ENST00000505490 MCTP1Q6DN14 999 aa32.81■■■□□ 2.84
ALYREF-202ENST00000505490 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP32.81■■■□□ 2.84
ALYREF-202ENST00000505490 NCDNQ9UBB6 729 aa32.81■■■□□ 2.84
ALYREF-202ENST00000505490 ZNF263O14978 683 aa32.8■■■□□ 2.84
ALYREF-202ENST00000505490 GUCY2FP51841 1108 aa32.8■■■□□ 2.84
ALYREF-202ENST00000505490 LILRA4P59901 499 aa32.8■■■□□ 2.84
ALYREF-202ENST00000505490 MSANTD3Q96H12 275 aa32.8■■■□□ 2.84
ALYREF-202ENST00000505490 PGLYRP2Q96PD5 576 aa32.8■■■□□ 2.84
ALYREF-202ENST00000505490 LMAN1LQ9HAT1 526 aa32.8■■■□□ 2.84
ALYREF-202ENST00000505490 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa32.8■■■□□ 2.84
ALYREF-202ENST00000505490 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP32.8■■■□□ 2.84
ALYREF-202ENST00000505490 ASB3Q9Y575 518 aa32.8■■■□□ 2.84
ALYREF-202ENST00000505490 MTMR11A4FU01 709 aa32.79■■■□□ 2.84
ALYREF-202ENST00000505490 PPEF2O14830 753 aa32.79■■■□□ 2.84
ALYREF-202ENST00000505490 CHADO15335 359 aa32.79■■■□□ 2.84
ALYREF-202ENST00000505490 LIG4P49917 911 aa32.79■■■□□ 2.84
ALYREF-202ENST00000505490 NRLP54845 237 aa32.79■■■□□ 2.84
ALYREF-202ENST00000505490 RABEP1Q15276 862 aa32.79■■■□□ 2.84
ALYREF-202ENST00000505490 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP32.79■■■□□ 2.84
ALYREF-202ENST00000505490 OVOS1Q6IE37 1185 aa32.79■■■□□ 2.84
ALYREF-202ENST00000505490 SLC39A4Q6P5W5 647 aa32.79■■■□□ 2.84
ALYREF-202ENST00000505490 USP37Q86T82 979 aa32.79■■■□□ 2.84
ALYREF-202ENST00000505490 CD302Q8IX05 232 aa32.79■■■□□ 2.84
ALYREF-202ENST00000505490 BICD1Q96G01 975 aa32.79■■■□□ 2.84
ALYREF-202ENST00000505490 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa32.79■■■□□ 2.84
ALYREF-202ENST00000505490 SCN1AP35498 2009 aa32.78■■■□□ 2.84
ALYREF-202ENST00000505490 A0A1W2PRU2 124 aa32.78■■■□□ 2.84
ALYREF-202ENST00000505490 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP32.78■■■□□ 2.84
ALYREF-202ENST00000505490 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP32.78■■■□□ 2.84
ALYREF-202ENST00000505490 EPHB3P54753 998 aa32.78■■■□□ 2.84
ALYREF-202ENST00000505490 GAS6Q14393 721 aa32.78■■■□□ 2.84
ALYREF-202ENST00000505490 C1orf228Q6PIY5 440 aa32.78■■■□□ 2.84
ALYREF-202ENST00000505490 GAREM2Q75VX8 874 aa32.78■■■□□ 2.84
ALYREF-202ENST00000505490 PSMG2Q969U7 264 aa32.78■■■□□ 2.84
ALYREF-202ENST00000505490 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP32.78■■■□□ 2.84
ALYREF-202ENST00000505490 PIRO00625 290 aa32.77■■■□□ 2.84
ALYREF-202ENST00000505490 CYP11A1P05108 521 aa32.77■■■□□ 2.84
ALYREF-202ENST00000505490 WEE1P30291 646 aa32.77■■■□□ 2.84
ALYREF-202ENST00000505490 CCR3P51677 355 aa32.77■■■□□ 2.84
ALYREF-202ENST00000505490 DSTYKQ6XUX3 929 aa32.77■■■□□ 2.84
ALYREF-202ENST00000505490 TMX3Q96JJ7 454 aa32.77■■■□□ 2.84
ALYREF-202ENST00000505490 PARVGQ9HBI0 331 aa32.77■■■□□ 2.84
ALYREF-202ENST00000505490 SPTBN2O15020 2390 aa32.76■■■□□ 2.84
ALYREF-202ENST00000505490 ANO9A1A5B4 782 aa32.76■■■□□ 2.83
ALYREF-202ENST00000505490 GTF2BQ00403 316 aa32.76■■■□□ 2.83
ALYREF-202ENST00000505490 C9orf57Q5W0N0 161 aa32.76■■■□□ 2.83
ALYREF-202ENST00000505490 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP32.76■■■□□ 2.83
ALYREF-202ENST00000505490 ATAD1Q8NBU5 361 aa32.76■■■□□ 2.83
ALYREF-202ENST00000505490 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP32.76■■■□□ 2.83
ALYREF-202ENST00000505490 SENP8Q96LD8 212 aa32.76■■■□□ 2.83
ALYREF-202ENST00000505490 LRRC3BQ96PB8 259 aa32.76■■■□□ 2.83
ALYREF-202ENST00000505490 DERAQ9Y315 318 aa32.76■■■□□ 2.83
ALYREF-202ENST00000505490 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP32.75■■■□□ 2.83
ALYREF-202ENST00000505490 SDHBP21912 280 aa32.75■■■□□ 2.83
ALYREF-202ENST00000505490 CCNE1P24864 410 aa32.75■■■□□ 2.83
ALYREF-202ENST00000505490 ALDH1A3P47895 512 aa32.75■■■□□ 2.83
ALYREF-202ENST00000505490 WDR44Q5JSH3 913 aa32.75■■■□□ 2.83
ALYREF-202ENST00000505490 STXBP5Q5T5C0 1151 aa32.75■■■□□ 2.83
ALYREF-202ENST00000505490 JADE1Q6IE81 842 aa32.75■■■□□ 2.83
ALYREF-202ENST00000505490 GPBP1Q86WP2 473 aa32.75■■■□□ 2.83
ALYREF-202ENST00000505490 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP32.75■■■□□ 2.83
ALYREF-202ENST00000505490 TTC9BQ8N6N2 239 aa32.75■■■□□ 2.83
ALYREF-202ENST00000505490 TMEM209Q96SK2 561 aa32.75■■■□□ 2.83
ALYREF-202ENST00000505490 OBP2AQ9NY56 170 aa32.75■■■□□ 2.83
ALYREF-202ENST00000505490 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa32.75■■■□□ 2.83
ALYREF-202ENST00000505490 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP32.74■■■□□ 2.83
ALYREF-202ENST00000505490 K7ENM7 598 aa32.74■■■□□ 2.83
ALYREF-202ENST00000505490 TRAK2O60296 914 aa32.74■■■□□ 2.83
ALYREF-202ENST00000505490 GJB2P29033 226 aa32.74■■■□□ 2.83
ALYREF-202ENST00000505490 PPP2R5DQ14738 602 aa32.74■■■□□ 2.83
ALYREF-202ENST00000505490 MYCT1Q8N699 235 aa32.74■■■□□ 2.83
ALYREF-202ENST00000505490 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP32.74■■■□□ 2.83
ALYREF-202ENST00000505490 OR10T2Q8NGX3 314 aa32.74■■■□□ 2.83
ALYREF-202ENST00000505490 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP32.74■■■□□ 2.83
ALYREF-202ENST00000505490 STYXL1Q9Y6J8 313 aa32.74■■■□□ 2.83
ALYREF-202ENST00000505490 MYBPHLA2RUH7 354 aa32.73■■■□□ 2.83
ALYREF-202ENST00000505490 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa32.73■■■□□ 2.83
ALYREF-202ENST00000505490 FGF19O95750 216 aa32.73■■■□□ 2.83
ALYREF-202ENST00000505490 ODC1P11926 461 aa32.73■■■□□ 2.83
ALYREF-202ENST00000505490 ABCD1P33897 745 aa32.73■■■□□ 2.83
ALYREF-202ENST00000505490 ARHGAP8P85298 464 aa32.73■■■□□ 2.83
ALYREF-202ENST00000505490 SPEM1Q8N4L4 309 aa32.73■■■□□ 2.83
ALYREF-202ENST00000505490 CALML4Q96GE6 196 aa32.73■■■□□ 2.83
ALYREF-202ENST00000505490 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa32.73■■■□□ 2.83
ALYREF-202ENST00000505490 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa32.73■■■□□ 2.83
ALYREF-202ENST00000505490 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP32.72■■■□□ 2.83
ALYREF-202ENST00000505490 NFICP08651 508 aa32.72■■■□□ 2.83
ALYREF-202ENST00000505490 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP32.72■■■□□ 2.83
ALYREF-202ENST00000505490 RAD54LQ92698 747 aa32.72■■■□□ 2.83
ALYREF-202ENST00000505490 MSTO1Q9BUK6 570 aa32.72■■■□□ 2.83
ALYREF-202ENST00000505490 ASB7Q9H672 318 aa32.72■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 79.4 ms