RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000053252.8

Ctxn1-201, Transcript of Cortexin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ctxn1, Length 1,212 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Kctd6Q8BNL5 237 aa23.39■■□□□ 1.33
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Frat2Q8K025 231 aa23.39■■□□□ 1.33
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tmem30aQ8VEK0 364 aa23.39■■□□□ 1.33
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Nlgn4lB0F2B4 945 aa23.38■■□□□ 1.33
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Adam19O35674 920 aa23.38■■□□□ 1.33
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Itgb3O54890 787 aa23.38■■□□□ 1.33
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Itm2bO89051 266 aa23.38■■□□□ 1.33
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 B3gat3P58158 335 aa23.38■■□□□ 1.33
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Lig3P97386 1015 aa23.38■■□□□ 1.33
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Flt3Q00342 1000 aa23.38■■□□□ 1.33
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Fam196aQ3USH1 422 aa23.38■■□□□ 1.33
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 CochQ62507 552 aa23.38■■□□□ 1.33
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cyp3a16Q64481 504 aa23.38■■□□□ 1.33
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cpa4Q6P8K8 420 aa23.38■■□□□ 1.33
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Zfp251Q6PCX8 632 aa23.38■■□□□ 1.33
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Arhgap10Q6Y5D8 786 aa23.38■■□□□ 1.33
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Olfr385Q8VGT1 312 aa23.38■■□□□ 1.33
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Nmnat1Q9EPA7 285 aa23.38■■□□□ 1.33
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Epm2aQ9WUA5 330 aa23.38■■□□□ 1.33
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Igkv17-121A0A0G2JFA8 117 aa23.37■■□□□ 1.33
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ppfia4B8QI36 1187 aa23.37■■□□□ 1.33
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Vmn2r111K7N674 857 aa23.37■■□□□ 1.33
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Aoc3O70423 765 aa23.37■■□□□ 1.33
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Rhox12Q4TU81 186 aa23.37■■□□□ 1.33
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Mysm1Q69Z66 819 aa23.37■■□□□ 1.33
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Mindy1Q76LS9 468 aa23.37■■□□□ 1.33
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Haus4Q8BFT2 363 aa23.37■■□□□ 1.33
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Lin9Q8C735 542 aa23.37■■□□□ 1.33
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tada2aQ8CHV6 443 aa23.37■■□□□ 1.33
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Olfr1499Q8VG65 314 aa23.37■■□□□ 1.33
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 4931423N10RikQ9D4J9 382 aa23.37■■□□□ 1.33
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tlr2Q9QUN7 784 aa23.37■■□□□ 1.33
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1700016G14RikA0A286YCZ6 238 aa23.36■■□□□ 1.33
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 ZxdbA2CE44 873 aa23.36■■□□□ 1.33
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm4302E9PX25 294 aa23.36■■□□□ 1.33
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ca8P28651 291 aa23.36■■□□□ 1.33
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Prdx5P99029 210 aa23.36■■□□□ 1.33
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 H2-Q2Q4KN81 360 aa23.36■■□□□ 1.33
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 UrgcpQ5NCI0 926 aa23.36■■□□□ 1.33
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Elavl4Q61701 385 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Q6GQV0 436 aa23.36■■□□□ 1.33
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Znf12Q7TSI0 686 aa23.36■■□□□ 1.33
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Nop9Q8BMC4 636 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 RtknQ8C6B2 564 aa23.36■■□□□ 1.33
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Rnf138rt1Q9D9M9 248 aa23.36■■□□□ 1.33
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Fzd2Q9JIP6 570 aa23.36■■□□□ 1.33
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cntnap5aQ0V8T9 1304 aa23.35■■□□□ 1.33
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Olfr663A0A1B0GSI9 319 aa23.35■■□□□ 1.33
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Plekhg4A0A1L1SU27 1217 aa23.35■■□□□ 1.33
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cyp2b13A6H6J2 491 aa23.35■■□□□ 1.33
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Apol6B7ZC55 329 aa23.35■■□□□ 1.33
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Olfr743L7N1Y2 311 aa23.35■■□□□ 1.33
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Itgb1P09055 798 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Slc10a3P21129 473 aa23.35■■□□□ 1.33
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Pbx1P41778 430 aa23.35■■□□□ 1.33
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Nub1P54729 614 aa23.35■■□□□ 1.33
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tmprss9P69525 1065 aa23.35■■□□□ 1.33
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Zcchc2Q69ZB8 1166 aa23.35■■□□□ 1.33
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ostm1Q8BGT0 338 aa23.35■■□□□ 1.33
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Wdr3Q8BHB4 942 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Slu7Q8BHJ9 585 aa23.35■■□□□ 1.33
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Uroc1Q8VC12 676 aa23.35■■□□□ 1.33
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Vps36Q91XD6 386 aa23.35■■□□□ 1.33
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Pip4k2cQ91XU3 421 aa23.35■■□□□ 1.33
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tlr3Q99MB1 905 aa23.35■■□□□ 1.33
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gdap2Q9DBL2 498 aa23.35■■□□□ 1.33
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Dkc1Q9ESX5 509 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Acp4D3YTS9 425 aa23.34■■□□□ 1.33
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Nr1i3O35627 358 aa23.34■■□□□ 1.33
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Actn3O88990 900 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tnnc1P19123 161 aa23.34■■□□□ 1.33
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Brcc3P46737 291 aa23.34■■□□□ 1.33
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Upf3bQ3ULL6 472 aa23.34■■□□□ 1.33
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gucy2cQ3UWA6 1072 aa23.34■■□□□ 1.33
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Dsg1aQ61495 1057 aa23.34■■□□□ 1.33
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Six2Q62232 296 aa23.34■■□□□ 1.33
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 ToporsQ80Z37 1033 aa23.34■■□□□ 1.33
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 SowahaQ8BLS7 548 aa23.34■■□□□ 1.33
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gnl3Q8CI11 538 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 FgbQ8K0E8 481 aa23.34■■□□□ 1.33
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gga1Q8R0H9 635 aa23.34■■□□□ 1.33
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 AdigQ8R400 80 aa23.34■■□□□ 1.33
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Erp44Q9D1Q6 406 aa23.34■■□□□ 1.33
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Rcan3Q9JKK0 239 aa23.34■■□□□ 1.33
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm13276A0A087WR18 182 aa23.33■■□□□ 1.33
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Prdm12A2AJ77 365 aa23.33■■□□□ 1.33
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 P01648 108 aa23.33■■□□□ 1.33
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Adcy5P84309 1262 aa23.33■■□□□ 1.33
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Trim72Q1XH17 477 aa23.33■■□□□ 1.33
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Rbm20Q3UQS8 1199 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tlr13Q6R5N8 991 aa23.33■■□□□ 1.33
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Usp1Q8BJQ2 784 aa23.33■■□□□ 1.33
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gtpbp10Q8K013 366 aa23.33■■□□□ 1.33
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Fam129bQ8R1F1 749 aa23.33■■□□□ 1.33
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Klhl20Q8VCK5 604 aa23.33■■□□□ 1.33
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Olfr805Q8VFI4 319 aa23.33■■□□□ 1.33
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Nmrk1Q91W63 195 aa23.33■■□□□ 1.33
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gstt4Q9D4P7 240 aa23.33■■□□□ 1.33
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Atg7Q9D906 698 aa23.33■■□□□ 1.33
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Mmel1Q9JLI3 765 aa23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 70.3 ms