RNA–Protein interactions for RNA: YPR080W

TEF1, Transcript of Translational elongation factor EF-1 alpha, yeast

Gene TEF1, Length 1,377 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TEF1	YPR080W	FIT1	Q04433	528 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TEF1	YPR080W	PAM18	Q07914	168 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TEF1	YPR080W	BOL1	Q3E793	110 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TEF1	YPR080W	LSB5	P25369	354 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TEF1	YPR080W	ERV1	P27882	189 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TEF1	YPR080W	COQ2	P32378	372 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TEF1	YPR080W	YBR292C	P38357	123 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TEF1	YPR080W	RTC3	P38804	111 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TEF1	YPR080W	IKI1	P38874	309 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TEF1	YPR080W	RMD6	P39975	231 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TEF1	YPR080W	EMC5	P40540	141 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TEF1	YPR080W	GON7	P46984	123 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TEF1	YPR080W	YHC3	P47040	408 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TEF1	YPR080W	INN1	P53901	409 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TEF1	YPR080W	ODC1	Q03028	310 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TEF1	YPR080W	YMR082C	Q04276	118 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TEF1	YPR080W	RIM9	Q04734	239 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TEF1	YPR080W	YLR179C	Q06252	201 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TEF1	YPR080W	YDR215C	Q12240	137 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TEF1	YPR080W	PRS5	Q12265	496 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TEF1	YPR080W	RNH203	Q12338	110 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TEF1	YPR080W	HUG1	Q6Q5K6	68 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TEF1	YPR080W	TDH1	P00360	332 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TEF1	YPR080W	ACP1	P32463	125 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TEF1	YPR080W	SPS18	P32572	300 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TEF1	YPR080W	YKL107W	P34251	309 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TEF1	YPR080W	SRY1	P36007	326 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TEF1	YPR080W	YKL162C	P36052	402 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TEF1	YPR080W	SHM2	P37291	469 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TEF1	YPR080W	YGP1	P38616	354 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TEF1	YPR080W	PCL7	P40186	285 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TEF1	YPR080W	TOK1	P40310	691 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TEF1	YPR080W	SNN1	P48232	102 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TEF1	YPR080W	YNR066C	P53752	436 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TEF1	YPR080W	HSK3	P69852	69 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TEF1	YPR080W	YPL077C	Q02831	240 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TEF1	YPR080W	GAT3	Q07928	141 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TEF1	YPR080W	VMA9	Q3E7B6	73 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TEF1	YPR080W	GDH1	P07262	454 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TEF1	YPR080W	YMR31	P19955	123 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TEF1	YPR080W	SIP1	P32578	815 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TEF1	YPR080W	SOR1	P35497	357 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TEF1	YPR080W	YHR138C	P38841	114 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TEF1	YPR080W	PET100	P38958	111 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TEF1	YPR080W	SPC25	P40014	221 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TEF1	YPR080W	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TEF1	YPR080W	FMP41	P53889	259 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TEF1	YPR080W	YDR415C	Q04033	374 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TEF1	YPR080W	YPD1	Q07688	167 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TEF1	YPR080W	SOR2	Q07786	357 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TEF1	YPR080W	YPL264C	Q08980	353 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TEF1	YPR080W	SWT1	Q12104	458 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TEF1	YPR080W	AGC1	Q12482	902 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TEF1	YPR080W	COX19	Q3E731	98 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TEF1	YPR080W	YOR192C-C	Q3E736	78 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TEF1	YPR080W	MEC1	P38111	2368 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TEF1	YPR080W	VPS63	O13549	108 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TEF1	YPR080W	ROX3	P25046	220 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TEF1	YPR080W	CNB1	P25296	175 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TEF1	YPR080W	PEX7	P39108	375 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TEF1	YPR080W	COX15	P40086	486 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TEF1	YPR080W	CAF16	P43569	289 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TEF1	YPR080W	TTI2	P47168	421 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TEF1	YPR080W	GEP7	P53171	287 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TEF1	YPR080W	YGR050C	P53231	118 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TEF1	YPR080W	SED1	Q01589	338 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TEF1	YPR080W	SKO1	Q02100	647 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TEF1	YPR080W	YFH1	Q07540	174 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TEF1	YPR080W	YOL118C	Q08259	102 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TEF1	YPR080W	COA2	Q3E823	68 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TEF1	YPR080W	UTP20	P35194	2493 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TEF1	YPR080W	DAL80	P26343	269 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TEF1	YPR080W	MSK1	P32048	576 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TEF1	YPR080W	RFC2	P40348	353 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TEF1	YPR080W	POG1	P40473	351 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TEF1	YPR080W	YJL118W	P47022	219 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TEF1	YPR080W	BNA2	P47125	453 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TEF1	YPR080W	PEF1	P53238	335 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TEF1	YPR080W	CAF40	P53829	373 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TEF1	YPR080W	PDR17	P53844	350 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TEF1	YPR080W	RPL21A	Q02753	160 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TEF1	YPR080W	LPP1	Q04396	274 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TEF1	YPR080W	HOF1	Q05080	669 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TEF1	YPR080W	PML1	Q07930	204 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TEF1	YPR080W	PRR2	Q12310	699 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TEF1	YPR080W	RPL21B	Q12672	160 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TEF1	YPR080W	HBN1	Q96VH4	193 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TEF1	YPR080W	RPL9A	P05738	191 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TEF1	YPR080W	SHB17	P36136	271 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TEF1	YPR080W	PSD1	P39006	500 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TEF1	YPR080W	YIL024C	P40543	189 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TEF1	YPR080W	SGN1	P40561	250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.58	□□□□□ -1.68	not detected
TEF1	YPR080W	SMD3	P43321	101 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TEF1	YPR080W	MCM22	P47167	239 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TEF1	YPR080W	GNP1	P48813	663 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TEF1	YPR080W	RPL9B	P51401	191 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TEF1	YPR080W	CWC25	P53854	179 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TEF1	YPR080W	RFM1	Q12192	310 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TEF1	YPR080W	YPS3	Q12303	508 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TEF1	YPR080W	TRA1	P38811	3744 aa		4.57	□□□□□ -1.68

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