RNA–Protein interactions for RNA: YOL006C

TOP1, Transcript of Topoisomerase I, yeast

Gene TOP1, Length 2,310 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TOP1	YOL006C	YIL177C	P40434	1758 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TOP1	YOL006C	YJL225C	P40889	1758 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TOP1	YOL006C	PET9	P18239	318 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
TOP1	YOL006C	SEC17	P32602	292 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TOP1	YOL006C	YBR063C	P38083	404 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TOP1	YOL006C	CSH1	P38287	376 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TOP1	YOL006C	PHO89	P38361	574 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TOP1	YOL006C	TIM17	P39515	158 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TOP1	YOL006C	PTI1	P39927	425 aa	Predicted RBP	2.76	□□□□□ -1.97
TOP1	YOL006C	YNL208W	P40159	199 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
TOP1	YOL006C	YIL024C	P40543	189 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TOP1	YOL006C	CFD1	P40558	293 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TOP1	YOL006C	DIM1	P41819	318 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
TOP1	YOL006C	AVT1	P47082	602 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TOP1	YOL006C	YJR085C	P47131	105 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
TOP1	YOL006C	UFD1	P53044	361 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TOP1	YOL006C	YGR039W	P53225	103 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TOP1	YOL006C	YGR219W	P53307	113 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TOP1	YOL006C	ZEO1	Q08245	113 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TOP1	YOL006C	TDA8	Q6B2U8	126 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TOP1	YOL006C	Q0255	P03881	472 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TOP1	YOL006C	PHO85	P17157	305 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TOP1	YOL006C	ERG2	P32352	222 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TOP1	YOL006C	HYM1	P32464	399 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TOP1	YOL006C	COS8	P38723	381 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TOP1	YOL006C	SNO3	P43544	222 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TOP1	YOL006C	YGL088W	P53151	121 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TOP1	YOL006C	DIG2	Q03373	323 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
TOP1	YOL006C	YTH1	Q06102	208 aa	Predicted RBP	2.76	□□□□□ -1.97
TOP1	YOL006C	FCY1	Q12178	158 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TOP1	YOL006C	RPS8A	P0CX39	200 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
TOP1	YOL006C	RPS8B	P0CX40	200 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
TOP1	YOL006C	CPR1	P14832	162 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
TOP1	YOL006C	BGL2	P15703	313 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
TOP1	YOL006C	GLR1	P41921	483 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
TOP1	YOL006C	XPT1	P47165	209 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TOP1	YOL006C	RPS12	P48589	143 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
TOP1	YOL006C	YGR015C	P53208	328 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TOP1	YOL006C	TMA23	Q03525	211 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TOP1	YOL006C	GAS3	Q03655	524 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TOP1	YOL006C	CGI121	Q03705	181 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
TOP1	YOL006C	YDR391C	Q04170	232 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TOP1	YOL006C	YPL162C	Q12042	273 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TOP1	YOL006C	ATX2	Q12067	313 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TOP1	YOL006C	AYT1	Q12226	474 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TOP1	YOL006C	YAL063C-A	Q3E791	96 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TOP1	YOL006C	CDC25	P04821	1589 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TOP1	YOL006C	THO2	P53552	1597 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
TOP1	YOL006C	LDB16	P25587	256 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TOP1	YOL006C	YBL010C	P32788	280 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TOP1	YOL006C	TKL2	P33315	681 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TOP1	YOL006C	SNC2	P33328	115 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TOP1	YOL006C	YBR220C	P38318	560 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TOP1	YOL006C	IRC22	P40006	225 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TOP1	YOL006C	PRM5	P40476	318 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TOP1	YOL006C	SNM1	P40993	198 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TOP1	YOL006C	ALG9	P53868	555 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
TOP1	YOL006C	VPS71	Q03433	280 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TOP1	YOL006C	DML1	Q03652	475 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TOP1	YOL006C	AIM36	Q03798	255 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TOP1	YOL006C	LPP1	Q04396	274 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TOP1	YOL006C	GRH1	Q04410	372 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
TOP1	YOL006C	FMP42	Q04991	504 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TOP1	YOL006C	YPR114W	Q06107	315 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TOP1	YOL006C	YLR179C	Q06252	201 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
TOP1	YOL006C	HTL1	Q9URQ5	78 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TOP1	YOL006C	ESC1	Q03661	1658 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
TOP1	YOL006C	FMP49	A0A023PZB3	126 aa		2.74	□□□□□ -1.97
TOP1	YOL006C	TIR1	P10863	254 aa		2.74	□□□□□ -1.97
TOP1	YOL006C	RPB5	P20434	215 aa		2.74	□□□□□ -1.97
TOP1	YOL006C	SHE1	P38200	338 aa		2.74	□□□□□ -1.97
TOP1	YOL006C	YBR242W	P38331	238 aa		2.74	□□□□□ -1.97
TOP1	YOL006C	BAT1	P38891	393 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
TOP1	YOL006C	GGC1	P38988	300 aa		2.74	□□□□□ -1.97
TOP1	YOL006C	YER189W	P40104	122 aa		2.74	□□□□□ -1.97
TOP1	YOL006C	TTI2	P47168	421 aa		2.74	□□□□□ -1.97
TOP1	YOL006C	YGL262W	P53054	175 aa		2.74	□□□□□ -1.97
TOP1	YOL006C	EMI1	Q04406	187 aa		2.74	□□□□□ -1.97
TOP1	YOL006C	ATG39	Q06159	398 aa		2.74	□□□□□ -1.97
TOP1	YOL006C	CRC1	Q12289	327 aa		2.74	□□□□□ -1.97
TOP1	YOL006C	YPS3	Q12303	508 aa		2.74	□□□□□ -1.97
TOP1	YOL006C	YLR118C	Q12354	227 aa		2.74	□□□□□ -1.97
TOP1	YOL006C	YFR032C-B	Q8TGU2	87 aa		2.74	□□□□□ -1.97
TOP1	YOL006C	SPP41	P38904	1435 aa		2.74	□□□□□ -1.97
TOP1	YOL006C	ATS1	P31386	333 aa		2.74	□□□□□ -1.97
TOP1	YOL006C	OMA1	P36163	345 aa		2.74	□□□□□ -1.97
TOP1	YOL006C	TRS20	P38334	175 aa		2.74	□□□□□ -1.97
TOP1	YOL006C	CHS7	P38843	316 aa		2.74	□□□□□ -1.97
TOP1	YOL006C	AVT6	P40074	448 aa		2.74	□□□□□ -1.97
TOP1	YOL006C	RPR2	P40571	144 aa		2.74	□□□□□ -1.97
TOP1	YOL006C	STB1	P42845	420 aa		2.74	□□□□□ -1.97
TOP1	YOL006C	SER2	P42941	309 aa		2.74	□□□□□ -1.97
TOP1	YOL006C	YFL067W	P43537	175 aa		2.74	□□□□□ -1.97
TOP1	YOL006C	FIP1	P45976	327 aa		2.74	□□□□□ -1.97
TOP1	YOL006C	SKI6	P46948	246 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
TOP1	YOL006C	PAC10	P48363	199 aa		2.74	□□□□□ -1.97
TOP1	YOL006C	BNS1	P50084	137 aa		2.74	□□□□□ -1.97
TOP1	YOL006C	COS10	P52924	374 aa		2.74	□□□□□ -1.97
TOP1	YOL006C	MCH1	Q07376	486 aa		2.74	□□□□□ -1.97
TOP1	YOL006C	TIM22	Q12328	207 aa		2.74	□□□□□ -1.97

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