RNA–Protein interactions for RNA: YLR349W

YLR349W, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YLR349W, Length 507 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLR349WYLR349W VMA10P48836 114 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
YLR349WYLR349W ERG25P53045 309 aa6.96□□□□□ -1.3
YLR349WYLR349W TAF3Q12297 353 aa6.96□□□□□ -1.3
YLR349WYLR349W QCR7P00128 127 aa6.95□□□□□ -1.3
YLR349WYLR349W URA3P03962 267 aa6.95□□□□□ -1.3
YLR349WYLR349W MRS3P10566 314 aa6.95□□□□□ -1.3
YLR349WYLR349W PET54P10834 293 aa6.95□□□□□ -1.3
YLR349WYLR349W URA6P15700 204 aa6.95□□□□□ -1.3
YLR349WYLR349W DIT1P21623 536 aa6.95□□□□□ -1.3
YLR349WYLR349W YUH1P35127 236 aa6.95□□□□□ -1.3
YLR349WYLR349W SRY1P36007 326 aa6.95□□□□□ -1.3
YLR349WYLR349W SMB1P40018 196 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
YLR349WYLR349W RFC2P40348 353 aa6.95□□□□□ -1.3
YLR349WYLR349W MDJ2P42834 146 aa6.95□□□□□ -1.3
YLR349WYLR349W YAE1P47118 141 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
YLR349WYLR349W YGR042WP53227 271 aa6.95□□□□□ -1.3
YLR349WYLR349W VHT1P53241 593 aa6.95□□□□□ -1.3
YLR349WYLR349W YGR219WP53307 113 aa6.95□□□□□ -1.3
YLR349WYLR349W CPD1P53314 239 aa6.95□□□□□ -1.3
YLR349WYLR349W MRPL22P53881 309 aa6.95□□□□□ -1.3
YLR349WYLR349W TRI1Q05024 226 aa6.95□□□□□ -1.3
YLR349WYLR349W PEX10Q05568 337 aa6.95□□□□□ -1.3
YLR349WYLR349W RDS3Q06835 107 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
YLR349WYLR349W YPR108W-AQ3E7B3 70 aa6.95□□□□□ -1.3
YLR349WYLR349W YLR365WQ7LIF2 110 aa6.95□□□□□ -1.3
YLR349WYLR349W SEN2P16658 377 aa6.94□□□□□ -1.3
YLR349WYLR349W YMR31P19955 123 aa6.94□□□□□ -1.3
YLR349WYLR349W IFM1P25038 676 aa6.94□□□□□ -1.3
YLR349WYLR349W YNL194CP40169 301 aa6.94□□□□□ -1.3
YLR349WYLR349W OTU1P43558 301 aa6.94□□□□□ -1.3
YLR349WYLR349W SOG2Q08817 791 aa6.94□□□□□ -1.3
YLR349WYLR349W MET17P06106 444 aa6.93□□□□□ -1.3
YLR349WYLR349W PET494P07390 489 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
YLR349WYLR349W CKA1P15790 372 aa6.93□□□□□ -1.3
YLR349WYLR349W QDR3P38227 689 aa6.93□□□□□ -1.3
YLR349WYLR349W MSS2P40990 351 aa6.93□□□□□ -1.3
YLR349WYLR349W YDR179W-AQ03983 463 aa6.93□□□□□ -1.3
YLR349WYLR349W DCP1Q12517 231 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
YLR349WYLR349W HUG1Q6Q5K6 68 aa6.93□□□□□ -1.3
YLR349WYLR349W CDC23P16522 626 aa6.92□□□□□ -1.3
YLR349WYLR349W ALK2P32789 676 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
YLR349WYLR349W YPT31P38555 223 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
YLR349WYLR349W MSE1P48525 536 aa6.92□□□□□ -1.3
YLR349WYLR349W ATG41Q12048 136 aa6.92□□□□□ -1.3
YLR349WYLR349W RKI1Q12189 258 aa6.92□□□□□ -1.3
YLR349WYLR349W BOL1Q3E793 110 aa6.92□□□□□ -1.3
YLR349WYLR349W CHO1P08456 276 aa6.91□□□□□ -1.3
YLR349WYLR349W NOP1P15646 327 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
YLR349WYLR349W ATP3P38077 311 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
YLR349WYLR349W MIC12P38341 106 aa6.91□□□□□ -1.3
YLR349WYLR349W YJL218WP40892 196 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
YLR349WYLR349W LST8P41318 303 aa6.91□□□□□ -1.3
YLR349WYLR349W FSH2Q05015 223 aa6.91□□□□□ -1.3
YLR349WYLR349W YPR013CQ12145 317 aa6.91□□□□□ -1.3
YLR349WYLR349W RTT105P40063 208 aa6.9□□□□□ -1.3
YLR349WYLR349W GIS2P53849 153 aaKnown RBP RIP-Chip data6.9□□□□□ -1.3 RIP-Chip
YLR349WYLR349W ERV25P54837 211 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
YLR349WYLR349W TY1A-MR1Q04215 440 aa6.9□□□□□ -1.3
YLR349WYLR349W YCP4P25349 247 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
YLR349WYLR349W MED4Q12343 284 aa6.89□□□□□ -1.31
YLR349WYLR349W RPL3P14126 387 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
YLR349WYLR349W MED8P38304 223 aa6.88□□□□□ -1.31
YLR349WYLR349W YHR138CP38841 114 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
YLR349WYLR349W SIM1P40472 476 aa6.88□□□□□ -1.31
YLR349WYLR349W AGX1P43567 385 aa6.88□□□□□ -1.31
YLR349WYLR349W YPI1P43587 155 aa6.88□□□□□ -1.31
YLR349WYLR349W BNA6P43619 295 aa6.88□□□□□ -1.31
YLR349WYLR349W GPN3Q06543 272 aa6.88□□□□□ -1.31
YLR349WYLR349W TY1A-DR3Q12441 440 aa6.88□□□□□ -1.31
YLR349WYLR349W SOD1P00445 154 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
YLR349WYLR349W PCL6P40038 420 aa6.87□□□□□ -1.31
YLR349WYLR349W NCE103P53615 221 aa6.87□□□□□ -1.31
YLR349WYLR349W HBN1Q96VH4 193 aa6.87□□□□□ -1.31
YLR349WYLR349W UBA3Q99344 299 aa6.87□□□□□ -1.31
YLR349WYLR349W VPS63O13549 108 aa6.86□□□□□ -1.31
YLR349WYLR349W CDC34P14682 295 aa6.86□□□□□ -1.31
YLR349WYLR349W RIB7P33312 244 aa6.86□□□□□ -1.31
YLR349WYLR349W MST28P39552 234 aa6.86□□□□□ -1.31
YLR349WYLR349W YAR068WP39564 161 aa6.86□□□□□ -1.31
YLR349WYLR349W MST27P53176 234 aa6.86□□□□□ -1.31
YLR349WYLR349W YML018CQ03730 393 aa6.86□□□□□ -1.31
YLR349WYLR349W YMR130WQ04223 302 aa6.86□□□□□ -1.31
YLR349WYLR349W MRPL35Q06678 367 aa6.86□□□□□ -1.31
YLR349WYLR349W TRR1P29509 319 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
YLR349WYLR349W RNP1P32385 249 aa6.85□□□□□ -1.31
YLR349WYLR349W POP2P39008 433 aa6.85□□□□□ -1.31
YLR349WYLR349W RPA34P47006 233 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
YLR349WYLR349W ILM1P47155 203 aa6.85□□□□□ -1.31
YLR349WYLR349W ALG13P53178 202 aa6.85□□□□□ -1.31
YLR349WYLR349W SWT21P53873 357 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
YLR349WYLR349W COX12Q01519 83 aa6.85□□□□□ -1.31
YLR349WYLR349W RRG8Q06109 277 aa6.85□□□□□ -1.31
YLR349WYLR349W HRD1Q08109 551 aa6.85□□□□□ -1.31
YLR349WYLR349W MLF3P32047 452 aa6.84□□□□□ -1.31
YLR349WYLR349W DFG10P40526 253 aa6.84□□□□□ -1.31
YLR349WYLR349W YFR035CP43608 114 aa6.84□□□□□ -1.31
YLR349WYLR349W YLR031WQ07978 186 aa6.84□□□□□ -1.31
YLR349WYLR349W RPL24BP24000 155 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
YLR349WYLR349W HTD2P38790 280 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
YLR349WYLR349W ERV29P53337 310 aa6.83□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 93.7 ms