RNA–Protein interactions for RNA: YKL195W

MIA40, Transcript of Mitochondrial oxidoreductase, yeast

Gene MIA40, Length 1,212 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MIA40	YKL195W	SEC16	P48415	2195 aa	Known RBP	5.57	□□□□□ -1.52
MIA40	YKL195W	YKL162C	P36052	402 aa		5.57	□□□□□ -1.52
MIA40	YKL195W	SLM6	P38343	150 aa		5.57	□□□□□ -1.52
MIA40	YKL195W	RFC2	P40348	353 aa		5.57	□□□□□ -1.52
MIA40	YKL195W	EGT2	P42835	1041 aa		5.57	□□□□□ -1.52
MIA40	YKL195W	SIP18	P50263	79 aa		5.57	□□□□□ -1.52
MIA40	YKL195W	MSO1	P53604	210 aa	Known RBP	5.57	□□□□□ -1.52
MIA40	YKL195W	YNR066C	P53752	436 aa		5.57	□□□□□ -1.52
MIA40	YKL195W	CAF40	P53829	373 aa		5.57	□□□□□ -1.52
MIA40	YKL195W	YDC1	Q02896	317 aa		5.57	□□□□□ -1.52
MIA40	YKL195W	ADD37	Q03233	198 aa		5.57	□□□□□ -1.52
MIA40	YKL195W	RIM9	Q04734	239 aa		5.57	□□□□□ -1.52
MIA40	YKL195W	UPS1	Q05776	175 aa		5.57	□□□□□ -1.52
MIA40	YKL195W	PRP11	Q07350	266 aa	Predicted RBP	5.57	□□□□□ -1.52
MIA40	YKL195W	SDO1	Q07953	250 aa	Known RBP	5.57	□□□□□ -1.52
MIA40	YKL195W	ZEO1	Q08245	113 aa		5.57	□□□□□ -1.52
MIA40	YKL195W	SWT1	Q12104	458 aa		5.57	□□□□□ -1.52
MIA40	YKL195W	FCY22	Q12119	530 aa		5.57	□□□□□ -1.52
MIA40	YKL195W	RNH203	Q12338	110 aa		5.57	□□□□□ -1.52
MIA40	YKL195W	AIM45	Q12480	344 aa	Known RBP	5.57	□□□□□ -1.52
MIA40	YKL195W	YOR192C-C	Q3E736	78 aa		5.57	□□□□□ -1.52
MIA40	YKL195W	TDH1	P00360	332 aa	Known RBP	5.56	□□□□□ -1.52
MIA40	YKL195W	HEM4	P06174	275 aa		5.56	□□□□□ -1.52
MIA40	YKL195W	YBR292C	P38357	123 aa		5.56	□□□□□ -1.52
MIA40	YKL195W	SPC25	P40014	221 aa		5.56	□□□□□ -1.52
MIA40	YKL195W	POG1	P40473	351 aa		5.56	□□□□□ -1.52
MIA40	YKL195W	YIL024C	P40543	189 aa		5.56	□□□□□ -1.52
MIA40	YKL195W	TAF4	P50105	388 aa		5.56	□□□□□ -1.52
MIA40	YKL195W	UBC13	P52490	153 aa		5.56	□□□□□ -1.52
MIA40	YKL195W	YIP5	P53108	310 aa		5.56	□□□□□ -1.52
MIA40	YKL195W	RPN14	P53196	417 aa		5.56	□□□□□ -1.52
MIA40	YKL195W	YPL067C	Q02754	198 aa		5.56	□□□□□ -1.52
MIA40	YKL195W	TMA23	Q03525	211 aa		5.56	□□□□□ -1.52
MIA40	YKL195W	GMC1	Q04399	608 aa		5.56	□□□□□ -1.52
MIA40	YKL195W	HOF1	Q05080	669 aa		5.56	□□□□□ -1.52
MIA40	YKL195W	FOL3	Q12676	427 aa	Predicted RBP	5.56	□□□□□ -1.52
MIA40	YKL195W	CDC39	P25655	2108 aa	Known RBP	5.56	□□□□□ -1.52
MIA40	YKL195W	MRS4	P23500	304 aa		5.55	□□□□□ -1.52
MIA40	YKL195W	ATG15	P25641	520 aa		5.55	□□□□□ -1.52
MIA40	YKL195W	ERV1	P27882	189 aa		5.55	□□□□□ -1.52
MIA40	YKL195W	PCL7	P40186	285 aa		5.55	□□□□□ -1.52
MIA40	YKL195W	PGD1	P40356	397 aa		5.55	□□□□□ -1.52
MIA40	YKL195W	PRM5	P40476	318 aa		5.55	□□□□□ -1.52
MIA40	YKL195W	MOG1	P47123	218 aa		5.55	□□□□□ -1.52
MIA40	YKL195W	YMR279C	Q03263	540 aa		5.55	□□□□□ -1.52
MIA40	YKL195W	YMR082C	Q04276	118 aa		5.55	□□□□□ -1.52
MIA40	YKL195W	LIP2	Q06005	328 aa		5.55	□□□□□ -1.52
MIA40	YKL195W	YOL118C	Q08259	102 aa		5.55	□□□□□ -1.52
MIA40	YKL195W	YOR292C	Q08743	309 aa		5.55	□□□□□ -1.52
MIA40	YKL195W	YOR015W	Q12169	119 aa		5.55	□□□□□ -1.52
MIA40	YKL195W	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.55	□□□□□ -1.52	not detected
MIA40	YKL195W	COX19	Q3E731	98 aa		5.55	□□□□□ -1.52
MIA40	YKL195W	Q0142	Q9ZZW4	58 aa		5.55	□□□□□ -1.52
MIA40	YKL195W	YMR262W	P38430	313 aa		5.54	□□□□□ -1.52
MIA40	YKL195W	PRS3	P38689	320 aa	Known RBP	5.54	□□□□□ -1.52
MIA40	YKL195W	IKI1	P38874	309 aa		5.54	□□□□□ -1.52
MIA40	YKL195W	YER158C	P40095	573 aa		5.54	□□□□□ -1.52
MIA40	YKL195W	XPT1	P47165	209 aa		5.54	□□□□□ -1.52
MIA40	YKL195W	ERG25	P53045	309 aa		5.54	□□□□□ -1.52
MIA40	YKL195W	PEF1	P53238	335 aa		5.54	□□□□□ -1.52
MIA40	YKL195W	HSK3	P69852	69 aa		5.54	□□□□□ -1.52
MIA40	YKL195W	ACS1	Q01574	713 aa		5.54	□□□□□ -1.52
MIA40	YKL195W	SNO1	Q03144	224 aa		5.54	□□□□□ -1.52
MIA40	YKL195W	COA2	Q3E823	68 aa		5.54	□□□□□ -1.52
MIA40	YKL195W	UPS2	P35200	230 aa		5.53	□□□□□ -1.52
MIA40	YKL195W	TOK1	P40310	691 aa		5.53	□□□□□ -1.52
MIA40	YKL195W	PDR17	P53844	350 aa		5.53	□□□□□ -1.52
MIA40	YKL195W	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	5.53	□□□□□ -1.52
MIA40	YKL195W	YPD1	Q07688	167 aa		5.53	□□□□□ -1.52
MIA40	YKL195W	YDL242W	Q07746	117 aa		5.53	□□□□□ -1.52
MIA40	YKL195W	ATG5	Q12380	294 aa		5.53	□□□□□ -1.52
MIA40	YKL195W	DGK1	Q12382	290 aa		5.53	□□□□□ -1.52
MIA40	YKL195W	CSF1	Q12150	2958 aa		5.53	□□□□□ -1.52
MIA40	YKL195W	IPP1	P00817	287 aa	Known RBP	5.52	□□□□□ -1.53
MIA40	YKL195W	LSB5	P25369	354 aa		5.52	□□□□□ -1.53
MIA40	YKL195W	AFR1	P33304	620 aa		5.52	□□□□□ -1.53
MIA40	YKL195W	SHM2	P37291	469 aa	Known RBP	5.52	□□□□□ -1.53
MIA40	YKL195W	GEP7	P53171	287 aa		5.52	□□□□□ -1.53
MIA40	YKL195W	HHO1	P53551	258 aa		5.52	□□□□□ -1.53
MIA40	YKL195W	WSC2	P53832	503 aa		5.52	□□□□□ -1.53
MIA40	YKL195W	ASM4	Q05166	528 aa		5.52	□□□□□ -1.53
MIA40	YKL195W	CRR1	Q05790	422 aa		5.52	□□□□□ -1.53
MIA40	YKL195W	YLR179C	Q06252	201 aa	Known RBP	5.52	□□□□□ -1.53
MIA40	YKL195W	YDL218W	Q07629	317 aa		5.52	□□□□□ -1.53
MIA40	YKL195W	HRD1	Q08109	551 aa		5.52	□□□□□ -1.53
MIA40	YKL195W	YPL264C	Q08980	353 aa		5.52	□□□□□ -1.53
MIA40	YKL195W	RFM1	Q12192	310 aa		5.52	□□□□□ -1.53
MIA40	YKL195W	SEN1	Q00416	2231 aa	Known RBP	5.51	□□□□□ -1.53
MIA40	YKL195W	ELO2	P25358	347 aa		5.51	□□□□□ -1.53
MIA40	YKL195W	YHR138C	P38841	114 aa	Predicted RBP	5.51	□□□□□ -1.53
MIA40	YKL195W	FLO5	P38894	1075 aa		5.51	□□□□□ -1.53
MIA40	YKL195W	RMD6	P39975	231 aa		5.51	□□□□□ -1.53
MIA40	YKL195W	HXT14	P42833	540 aa		5.51	□□□□□ -1.53
MIA40	YKL195W	YGL260W	P53056	76 aa		5.51	□□□□□ -1.53
MIA40	YKL195W	SUR7	P54003	302 aa		5.51	□□□□□ -1.53
MIA40	YKL195W	YPL278C	Q08990	100 aa		5.51	□□□□□ -1.53
MIA40	YKL195W	COX17	Q12287	69 aa		5.51	□□□□□ -1.53
MIA40	YKL195W	PRR2	Q12310	699 aa		5.51	□□□□□ -1.53
MIA40	YKL195W	YBR255C-A	Q3E776	120 aa		5.51	□□□□□ -1.53
MIA40	YKL195W	ADH3	P07246	375 aa	Known RBP	5.5	□□□□□ -1.53

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 103.3 ms