RNA–Protein interactions for RNA: YKL033W

TTI1, Transcript of Subunit of the ASTRA complex, involved in chromatin remodeling, yeast

Gene TTI1, Length 3,117 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TTI1	YKL033W	SOP4	P39543	234 aa	Predicted RBP	0.89	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	AIM20	P40451	204 aa		0.89	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	FMC1	P40491	155 aa		0.89	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	HSK3	P69852	69 aa		0.89	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	YDR248C	Q03786	193 aa		0.89	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	MPD1	Q12404	318 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	TAR1	Q8TGM6	124 aa		0.89	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	ADK1	P07170	222 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	SNF6	P18888	332 aa		0.89	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	YCR001W	P25347	104 aa		0.89	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	RRP7	P25368	297 aa	Predicted RBP	0.89	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	BUD23	P25627	275 aa	Predicted RBP	0.89	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	PUP2	P32379	260 aa		0.89	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	ASF2	P32448	525 aa	Predicted RBP	0.89	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	APE2	P32454	952 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	AGA2	P32781	87 aa		0.89	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	SRP102	P36057	244 aa	Predicted RBP	0.89	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	SRL3	P36167	246 aa		0.89	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	DLS1	P40366	167 aa		0.89	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	YJL027C	P47063	138 aa	Predicted RBP	0.89	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	YJR012C	P47087	207 aa		0.89	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	VPS55	P47111	140 aa		0.89	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	YJR085C	P47131	105 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	OST6	Q03723	332 aa		0.89	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	HEM25	Q07534	307 aa		0.89	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	YFH1	Q07540	174 aa		0.89	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	ADF1	Q2V2Q1	113 aa		0.89	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		0.89	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	CDC28	P00546	298 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	RPL24A	P04449	155 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	STF2	P16965	84 aa		0.89	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	ERV1	P27882	189 aa		0.89	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	ARO4	P32449	370 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	RAD23	P32628	398 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	ECT1	P33412	323 aa		0.89	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	YKL063C	P35725	167 aa		0.89	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	YBR137W	P38276	179 aa		0.89	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	MPC2	P38857	129 aa		0.89	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	CHL4	P38907	458 aa		0.89	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	PCL7	P40186	285 aa		0.89	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	AGP3	P43548	558 aa		0.89	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	TTI2	P47168	421 aa		0.89	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	CCC1	P47818	322 aa		0.89	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	RPL9B	P51401	191 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	YGR016W	P53209	190 aa		0.89	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	AAH1	P53909	347 aa		0.89	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	YDR274C	P87283	123 aa		0.89	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	ACL4	Q03771	387 aa		0.89	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	YMR315W	Q04869	349 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	YMR226C	Q05016	267 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	UPS1	Q05776	175 aa		0.89	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	HOR7	Q05827	59 aa		0.89	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	DGK1	Q12382	290 aa		0.89	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	VAM7	P32912	316 aa		0.88	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	RFC3	P38629	340 aa		0.88	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	YGL159W	P53110	370 aa		0.88	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	YGR050C	P53231	118 aa		0.88	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	YGR168C	P53293	376 aa		0.88	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	ERV25	P54837	211 aa	Known RBP	0.88	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	YKR005C	Q02203	525 aa		0.88	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	YOR186W	Q08560	144 aa		0.88	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	YPR013C	Q12145	317 aa		0.88	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	AGC1	Q12482	902 aa		0.88	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	YPL119C-A	Q3E751	87 aa		0.88	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	COX2	P00410	251 aa		0.88	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	MRP1	P10662	321 aa	Known RBP	0.88	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	ATG22	P25568	528 aa		0.88	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	PRP21	P32524	280 aa	Predicted RBP	0.88	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	NPL6	P32832	435 aa		0.88	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	MRPL6	P32904	214 aa		0.88	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	QDR3	P38227	689 aa		0.88	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	IES5	P40060	125 aa		0.88	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	HUA1	P40325	198 aa		0.88	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	YRB2	P40517	327 aa		0.88	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	CPD1	P53314	239 aa		0.88	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	YNR048W	P53740	393 aa		0.88	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	COG5	P53951	403 aa		0.88	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	DIG2	Q03373	323 aa	Known RBP	0.88	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	ELP6	Q04868	273 aa		0.88	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	PEX10	Q05568	337 aa		0.88	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	YOR011W-A	Q3E807	68 aa		0.88	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	CDC10	P25342	322 aa	Known RBP	0.87	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	POP5	P28005	173 aa		0.87	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	ERG3	P32353	365 aa		0.87	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	RNP1	P32385	249 aa		0.87	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	TMA19	P35691	167 aa	Known RBP	0.87	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	PRS4	P38063	326 aa	Predicted RBP	0.87	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	IPT1	P38954	527 aa		0.87	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	SPI1	P40092	148 aa		0.87	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	NRK1	P53915	240 aa		0.87	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	SUB1	P54000	292 aa	Known RBP	0.87	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	YPL067C	Q02754	198 aa		0.87	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	YMR099C	Q03161	297 aa	Known RBP	0.87	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	FIN1	Q03898	291 aa		0.87	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	ATG17	Q06410	417 aa		0.87	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	TDH1	P00360	332 aa	Known RBP	0.87	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	CYC3	P06182	269 aa		0.87	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	PHO85	P17157	305 aa		0.87	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	YCR101C	P25607	182 aa		0.87	□□□□□ -2.27
TTI1	YKL033W	TIP1	P27654	210 aa	Predicted RBP	0.87	□□□□□ -2.27

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