RNA–Protein interactions for RNA: YHR106W

TRR2, Transcript of Mitochondrial thioredoxin reductase, yeast

Gene TRR2, Length 1,029 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TRR2	YHR106W	HOF1	Q05080	669 aa		5.72	□□□□□ -1.49
TRR2	YHR106W	YOS1	Q3E834	85 aa		5.72	□□□□□ -1.49
TRR2	YHR106W	GPM1	P00950	247 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
TRR2	YHR106W	RNA14	P25298	677 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
TRR2	YHR106W	YKL075C	P36083	450 aa		5.71	□□□□□ -1.5
TRR2	YHR106W	YHR138C	P38841	114 aa	Predicted RBP	5.71	□□□□□ -1.5
TRR2	YHR106W	IMD3	P50095	523 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
TRR2	YHR106W	ARO8	P53090	500 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
TRR2	YHR106W	YGR151C	P53287	111 aa		5.71	□□□□□ -1.5
TRR2	YHR106W	HUG1	Q6Q5K6	68 aa		5.71	□□□□□ -1.5
TRR2	YHR106W	NHP6B	P11633	99 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
TRR2	YHR106W	RNP1	P32385	249 aa		5.7	□□□□□ -1.5
TRR2	YHR106W	PHM8	P40025	321 aa		5.7	□□□□□ -1.5
TRR2	YHR106W	YJL163C	P46996	555 aa		5.7	□□□□□ -1.5
TRR2	YHR106W	ERG25	P53045	309 aa		5.7	□□□□□ -1.5
TRR2	YHR106W	COX18	P53239	316 aa		5.7	□□□□□ -1.5
TRR2	YHR106W	NRG1	Q03125	231 aa		5.7	□□□□□ -1.5
TRR2	YHR106W	THI74	Q04083	370 aa		5.7	□□□□□ -1.5
TRR2	YHR106W	TSA2	Q04120	196 aa		5.7	□□□□□ -1.5
TRR2	YHR106W	MRPL23	Q12487	163 aa	Predicted RBP	5.7	□□□□□ -1.5
TRR2	YHR106W	HTZ1	Q12692	134 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
TRR2	YHR106W	HBN1	Q96VH4	193 aa		5.7	□□□□□ -1.5
TRR2	YHR106W	QCR2	P07257	368 aa		5.69	□□□□□ -1.5
TRR2	YHR106W	DIT1	P21623	536 aa		5.69	□□□□□ -1.5
TRR2	YHR106W	PUP1	P25043	261 aa		5.69	□□□□□ -1.5
TRR2	YHR106W	YCR016W	P25617	290 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
TRR2	YHR106W	POP8	P38208	133 aa		5.69	□□□□□ -1.5
TRR2	YHR106W	AGE2	P40529	298 aa		5.69	□□□□□ -1.5
TRR2	YHR106W	IRC24	P40580	263 aa		5.69	□□□□□ -1.5
TRR2	YHR106W	FIP1	P45976	327 aa		5.69	□□□□□ -1.5
TRR2	YHR106W	GPG1	P53130	126 aa		5.69	□□□□□ -1.5
TRR2	YHR106W	CWC25	P53854	179 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
TRR2	YHR106W	RTT103	Q05543	409 aa		5.69	□□□□□ -1.5
TRR2	YHR106W	HOR7	Q05827	59 aa		5.69	□□□□□ -1.5
TRR2	YHR106W	YFH1	Q07540	174 aa		5.69	□□□□□ -1.5
TRR2	YHR106W	JID1	Q12350	301 aa		5.69	□□□□□ -1.5
TRR2	YHR106W	LAS17	Q12446	633 aa		5.69	□□□□□ -1.5
TRR2	YHR106W	PAN3	P36102	679 aa	Predicted RBP	5.68	□□□□□ -1.5
TRR2	YHR106W	YKR045C	P36138	183 aa		5.68	□□□□□ -1.5
TRR2	YHR106W	MRPL3	P36516	390 aa		5.68	□□□□□ -1.5
TRR2	YHR106W	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
TRR2	YHR106W	RFC2	P40348	353 aa		5.68	□□□□□ -1.5
TRR2	YHR106W	YJL213W	P40896	331 aa		5.68	□□□□□ -1.5
TRR2	YHR106W	VPS55	P47111	140 aa		5.68	□□□□□ -1.5
TRR2	YHR106W	NIF3	P53081	288 aa		5.68	□□□□□ -1.5
TRR2	YHR106W	CAB5	Q03941	241 aa		5.68	□□□□□ -1.5
TRR2	YHR106W	RKI1	Q12189	258 aa		5.68	□□□□□ -1.5
TRR2	YHR106W	TRM13	Q12383	476 aa		5.68	□□□□□ -1.5
TRR2	YHR106W	MDN1	Q12019	4910 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
TRR2	YHR106W	ARG80	P07249	177 aa		5.67	□□□□□ -1.5
TRR2	YHR106W	YCP4	P25349	247 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
TRR2	YHR106W	GEP4	P38812	185 aa		5.67	□□□□□ -1.5
TRR2	YHR106W	RPA43	P46669	326 aa		5.67	□□□□□ -1.5
TRR2	YHR106W	MRPS16	Q02608	121 aa		5.67	□□□□□ -1.5
TRR2	YHR106W	HED1	Q03937	162 aa		5.67	□□□□□ -1.5
TRR2	YHR106W	MCH1	Q07376	486 aa		5.67	□□□□□ -1.5
TRR2	YHR106W	HTB1	P02293	131 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
TRR2	YHR106W	SPS2	P08459	502 aa		5.66	□□□□□ -1.5
TRR2	YHR106W	PUT1	P09368	476 aa		5.66	□□□□□ -1.5
TRR2	YHR106W	YPC1	P38298	316 aa		5.66	□□□□□ -1.5
TRR2	YHR106W	MSE1	P48525	536 aa		5.66	□□□□□ -1.5
TRR2	YHR106W	PEX10	Q05568	337 aa		5.66	□□□□□ -1.5
TRR2	YHR106W	PAM18	Q07914	168 aa		5.66	□□□□□ -1.5
TRR2	YHR106W	RAD28	Q12021	506 aa		5.66	□□□□□ -1.5
TRR2	YHR106W	ATG31	Q12421	196 aa		5.66	□□□□□ -1.5
TRR2	YHR106W	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	5.65	□□□□□ -1.5
TRR2	YHR106W	RPD3	P32561	433 aa		5.65	□□□□□ -1.5
TRR2	YHR106W	ATP3	P38077	311 aa	Known RBP	5.65	□□□□□ -1.5
TRR2	YHR106W	UBP8	P50102	471 aa		5.65	□□□□□ -1.5
TRR2	YHR106W	SSU72	P53538	206 aa	Predicted RBP	5.65	□□□□□ -1.5
TRR2	YHR106W	YML122C	Q03207	126 aa		5.65	□□□□□ -1.5
TRR2	YHR106W	PRM3	Q08931	133 aa		5.65	□□□□□ -1.5
TRR2	YHR106W	YCT1	Q12235	531 aa		5.65	□□□□□ -1.5
TRR2	YHR106W	RDI1	Q12434	202 aa		5.65	□□□□□ -1.5
TRR2	YHR106W	MRP17	P28778	131 aa		5.64	□□□□□ -1.51
TRR2	YHR106W	UTR5	P32630	166 aa		5.64	□□□□□ -1.51
TRR2	YHR106W	GLY1	P37303	387 aa	Known RBP	5.64	□□□□□ -1.51
TRR2	YHR106W	ERV15	P38312	142 aa		5.64	□□□□□ -1.51
TRR2	YHR106W	YBR242W	P38331	238 aa		5.64	□□□□□ -1.51
TRR2	YHR106W	COS8	P38723	381 aa		5.64	□□□□□ -1.51
TRR2	YHR106W	LSM12	P38828	187 aa	Known RBP	5.64	□□□□□ -1.51
TRR2	YHR106W	YNL194C	P40169	301 aa		5.64	□□□□□ -1.51
TRR2	YHR106W	RPL13B	P40212	199 aa	Known RBP	5.64	□□□□□ -1.51
TRR2	YHR106W	YKE4	P40544	346 aa		5.64	□□□□□ -1.51
TRR2	YHR106W	WWM1	P43582	211 aa	Known RBP	5.64	□□□□□ -1.51
TRR2	YHR106W	ARP3	P47117	449 aa	Known RBP	5.64	□□□□□ -1.51
TRR2	YHR106W	VPS71	Q03433	280 aa		5.64	□□□□□ -1.51
TRR2	YHR106W	ENV7	Q12003	364 aa		5.64	□□□□□ -1.51
TRR2	YHR106W	RPL13A	Q12690	199 aa	Predicted RBP	5.64	□□□□□ -1.51
TRR2	YHR106W	YGL258W-A	Q3E740	77 aa		5.64	□□□□□ -1.51
TRR2	YHR106W	NOP1	P15646	327 aa	Known RBP	5.63	□□□□□ -1.51
TRR2	YHR106W	STF2	P16965	84 aa		5.63	□□□□□ -1.51
TRR2	YHR106W	ELO2	P25358	347 aa		5.63	□□□□□ -1.51
TRR2	YHR106W	SUA5	P32579	426 aa		5.63	□□□□□ -1.51
TRR2	YHR106W	BFR1	P38934	470 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.63	□□□□□ -1.51	not detected
TRR2	YHR106W	YJR012C	P47087	207 aa		5.63	□□□□□ -1.51
TRR2	YHR106W	YGR219W	P53307	113 aa		5.63	□□□□□ -1.51
TRR2	YHR106W	YHP1	Q04116	353 aa		5.63	□□□□□ -1.51
TRR2	YHR106W	FSH2	Q05015	223 aa		5.63	□□□□□ -1.51
TRR2	YHR106W	AEP3	Q12089	606 aa		5.63	□□□□□ -1.51

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