RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000053252.8

Ctxn1-201, Transcript of Cortexin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ctxn1, Length 1,212 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Brpf3B2KF05 1204 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Smcr8Q3UMB5 935 aa23.44■■□□□ 1.34
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 B3glctQ8BHT6 489 aa23.44■■□□□ 1.34
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm11238F2Z478 360 aa23.43■■□□□ 1.34
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm428Q3UTE2 360 aa23.43■■□□□ 1.34
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Arl5cQ6P068 179 aa23.43■■□□□ 1.34
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Pkn2Q8BWW9 983 aa23.43■■□□□ 1.34
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Vps51Q3UVL4 782 aa23.42■■□□□ 1.34
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 4933416C03RikQ3V063 378 aa23.42■■□□□ 1.34
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tgs1Q923W1 853 aa23.42■■□□□ 1.34
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Chst12Q99LL3 419 aa23.42■■□□□ 1.34
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Rbm31yQ9D3U4 565 aa23.42■■□□□ 1.34
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 PirQ9D711 290 aa23.42■■□□□ 1.34
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Fgf22Q9ESS2 162 aa23.42■■□□□ 1.34
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ankrd40Q5SUE8 363 aa23.41■■□□□ 1.34
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Smad2Q62432 467 aa23.41■■□□□ 1.34
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Arhgap11aQ80Y19 987 aa23.41■■□□□ 1.34
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ces1fQ91WU0 561 aa23.41■■□□□ 1.34
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Pcdha9Q91Y11 979 aa23.41■■□□□ 1.34
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Klra10Q9R1G6 266 aa23.41■■□□□ 1.34
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Plin4O88492 1403 aa23.41■■□□□ 1.34
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Fgfr1P16092 822 aa23.4■■□□□ 1.34
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gnl1P36916 607 aa23.4■■□□□ 1.34
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Nrp1P97333 923 aa23.4■■□□□ 1.34
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Pax3P24610 479 aa23.39■■□□□ 1.33
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gdf6P43028 454 aa23.39■■□□□ 1.33
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 March5Q3KNM2 278 aa23.39■■□□□ 1.33
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tmem35bQ3U0Y2 150 aa23.39■■□□□ 1.33
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Zscan4fQ3URS2 506 aa23.39■■□□□ 1.33
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Dmc1Q61880 340 aa23.39■■□□□ 1.33
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Olfr389Q7TRX7 312 aa23.39■■□□□ 1.33
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Spata20Q80YT5 790 aa23.39■■□□□ 1.33
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