RNA–Protein interactions for RNA: YML035C

AMD1, Transcript of AMP deaminase, yeast

Gene AMD1, Length 2,433 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AMD1	YML035C	RAT1	Q02792	1006 aa	Known RBP	7	□□□□□ -1.29
AMD1	YML035C	PUF6	Q04373	656 aa	Known RBP	7	□□□□□ -1.29
AMD1	YML035C	GCD7	P32502	381 aa	Predicted RBP	6.99	□□□□□ -1.29
AMD1	YML035C	LPD1	P09624	499 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
AMD1	YML035C	DIB1	Q06819	143 aa	Predicted RBP	6.99	□□□□□ -1.29
AMD1	YML035C	RPC31	P17890	251 aa		6.98	□□□□□ -1.29
AMD1	YML035C	UBP12	P39538	1254 aa		6.98	□□□□□ -1.29
AMD1	YML035C	HAT1	Q12341	374 aa		6.98	□□□□□ -1.29
AMD1	YML035C	PKH1	Q03407	766 aa		6.98	□□□□□ -1.29
AMD1	YML035C	SAC3	P46674	1301 aa		6.98	□□□□□ -1.29
AMD1	YML035C	SWC3	P31376	625 aa		6.97	□□□□□ -1.29
AMD1	YML035C	ITC1	P53125	1264 aa		6.97	□□□□□ -1.29
AMD1	YML035C	SPO1	P53541	631 aa		6.97	□□□□□ -1.29
AMD1	YML035C	MTC5	Q03897	1148 aa		6.97	□□□□□ -1.29
AMD1	YML035C	TFA1	P36100	482 aa		6.97	□□□□□ -1.29
AMD1	YML035C	ILV3	P39522	585 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
AMD1	YML035C	HPC2	Q01448	625 aa		6.97	□□□□□ -1.29
AMD1	YML035C	RIX7	Q07844	837 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
AMD1	YML035C	PSH1	Q12161	406 aa		6.96	□□□□□ -1.3
AMD1	YML035C	PMD1	P32634	1753 aa		6.95	□□□□□ -1.3
AMD1	YML035C	FCP1	Q03254	732 aa		6.95	□□□□□ -1.3
AMD1	YML035C	SUP35	P05453	685 aa	Known RBP	6.95	□□□□□ -1.3
AMD1	YML035C	CTI6	Q08923	506 aa		6.95	□□□□□ -1.3
AMD1	YML035C	SSF1	P38789	453 aa	Predicted RBP	6.94	□□□□□ -1.3
AMD1	YML035C	ECM16	Q04217	1267 aa	Known RBP	6.94	□□□□□ -1.3
AMD1	YML035C	DUR1,2	P32528	1835 aa	Known RBP	6.94	□□□□□ -1.3
AMD1	YML035C	BDF2	Q07442	638 aa		6.93	□□□□□ -1.3
AMD1	YML035C	PFF1	P38244	976 aa		6.93	□□□□□ -1.3
AMD1	YML035C	SYF1	Q04048	859 aa	Predicted RBP	6.92	□□□□□ -1.3
AMD1	YML035C	FIG2	P25653	1609 aa		6.92	□□□□□ -1.3
AMD1	YML035C	NMD2	P38798	1089 aa	Known RBP	6.92	□□□□□ -1.3
AMD1	YML035C	UBP16	Q02863	499 aa		6.91	□□□□□ -1.3
AMD1	YML035C	ERT1	P38140	529 aa		6.91	□□□□□ -1.3
AMD1	YML035C	HKR1	P41809	1802 aa		6.91	□□□□□ -1.3
AMD1	YML035C	HXT10	P43581	546 aa		6.9	□□□□□ -1.3
AMD1	YML035C	ERO1	Q03103	563 aa		6.9	□□□□□ -1.3
AMD1	YML035C	SNU66	Q12420	587 aa	Predicted RBP	6.9	□□□□□ -1.3
AMD1	YML035C	NCB2	Q92317	146 aa		6.9	□□□□□ -1.3
AMD1	YML035C	ADR1	P07248	1323 aa		6.9	□□□□□ -1.3
AMD1	YML035C	SIT4	P20604	311 aa		6.9	□□□□□ -1.31
AMD1	YML035C	MSN5	P52918	1224 aa		6.9	□□□□□ -1.31
AMD1	YML035C	IRC3	Q06683	689 aa		6.9	□□□□□ -1.31
AMD1	YML035C	CDC16	P09798	840 aa		6.89	□□□□□ -1.31
AMD1	YML035C	YKL222C	P35995	705 aa		6.89	□□□□□ -1.31
AMD1	YML035C	GYP5	Q12344	894 aa		6.89	□□□□□ -1.31
AMD1	YML035C	DPH6	Q12429	685 aa		6.88	□□□□□ -1.31
AMD1	YML035C	RAD50	P12753	1312 aa		6.88	□□□□□ -1.31
AMD1	YML035C	CTT1	P06115	562 aa		6.88	□□□□□ -1.31
AMD1	YML035C	NKP2	Q06162	153 aa		6.88	□□□□□ -1.31
AMD1	YML035C	SMY1	P32364	656 aa	Known RBP	6.87	□□□□□ -1.31
AMD1	YML035C	EAF6	P47128	113 aa		6.87	□□□□□ -1.31
AMD1	YML035C	POM152	P39685	1337 aa		6.87	□□□□□ -1.31
AMD1	YML035C	ICP55	P40051	511 aa		6.87	□□□□□ -1.31
AMD1	YML035C	BDP1	P46678	594 aa		6.87	□□□□□ -1.31
AMD1	YML035C	MLC1	P53141	149 aa		6.87	□□□□□ -1.31
AMD1	YML035C	RFC1	P38630	861 aa	Known RBP	6.86	□□□□□ -1.31
AMD1	YML035C	YGL242C	P53066	181 aa		6.86	□□□□□ -1.31
AMD1	YML035C	FAS2	P19097	1887 aa	Known RBP	6.86	□□□□□ -1.31
AMD1	YML035C	FRD1	P32614	470 aa	Known RBP	6.86	□□□□□ -1.31
AMD1	YML035C	ECM21	P38167	1117 aa	Known RBP	6.86	□□□□□ -1.31
AMD1	YML035C	OPY1	P38271	328 aa		6.86	□□□□□ -1.31
AMD1	YML035C	RPN1	P38764	993 aa	Known RBP	6.86	□□□□□ -1.31
AMD1	YML035C	PDR18	P53756	1333 aa		6.86	□□□□□ -1.31
AMD1	YML035C	NOT3	P06102	836 aa	Known RBP	6.85	□□□□□ -1.31
AMD1	YML035C	SEC18	P18759	758 aa	Known RBP	6.85	□□□□□ -1.31
AMD1	YML035C	MGM1	P32266	881 aa		6.85	□□□□□ -1.31
AMD1	YML035C	IME2	P32581	645 aa		6.85	□□□□□ -1.31
AMD1	YML035C	NGR1	P32831	672 aa	Known RBP	6.85	□□□□□ -1.31
AMD1	YML035C	NUG1	P40010	520 aa	Known RBP	6.85	□□□□□ -1.31
AMD1	YML035C	SAS4	Q04003	481 aa		6.85	□□□□□ -1.31
AMD1	YML035C	UBX2	Q04228	584 aa		6.85	□□□□□ -1.31
AMD1	YML035C	THI3	Q07471	609 aa		6.85	□□□□□ -1.31
AMD1	YML035C	GRX6	Q12438	231 aa		6.85	□□□□□ -1.31
AMD1	YML035C	CWH41	P53008	833 aa		6.85	□□□□□ -1.31
AMD1	YML035C	KTR3	P38130	404 aa	Predicted RBP	6.84	□□□□□ -1.31
AMD1	YML035C	YER156C	P40093	338 aa	Known RBP	6.84	□□□□□ -1.31
AMD1	YML035C	KIN4	Q01919	800 aa		6.84	□□□□□ -1.31
AMD1	YML035C	SRC1	Q03707	834 aa		6.84	□□□□□ -1.31
AMD1	YML035C	PIF1	P07271	859 aa		6.84	□□□□□ -1.32
AMD1	YML035C	SLA1	P32790	1244 aa		6.84	□□□□□ -1.32
AMD1	YML035C	RPS9B	P05755	195 aa	Known RBP	6.83	□□□□□ -1.32
AMD1	YML035C	CAF20	P12962	161 aa	Known RBP	6.83	□□□□□ -1.32
AMD1	YML035C	KRE2	P27809	442 aa		6.83	□□□□□ -1.32
AMD1	YML035C	CAB3	P36076	571 aa		6.83	□□□□□ -1.32
AMD1	YML035C	BRE1	Q07457	700 aa	Known RBP	6.83	□□□□□ -1.32
AMD1	YML035C	ALO1	P54783	526 aa	Known RBP	6.82	□□□□□ -1.32
AMD1	YML035C	YPR148C	Q06523	435 aa		6.82	□□□□□ -1.32
AMD1	YML035C	SPL2	P38839	148 aa		6.82	□□□□□ -1.32
AMD1	YML035C	YNL193W	P53870	558 aa		6.82	□□□□□ -1.32
AMD1	YML035C	AI2	P03876	854 aa		6.81	□□□□□ -1.32
AMD1	YML035C	GLO3	P38682	493 aa	Known RBP	6.81	□□□□□ -1.32
AMD1	YML035C	RPT4	P53549	437 aa	Known RBP	6.81	□□□□□ -1.32
AMD1	YML035C	RPN7	Q06103	429 aa	Known RBP	6.81	□□□□□ -1.32
AMD1	YML035C	EPS1	P40557	701 aa		6.81	□□□□□ -1.32
AMD1	YML035C	PSF3	Q12146	194 aa		6.81	□□□□□ -1.32
AMD1	YML035C	OSH3	P38713	996 aa	Known RBP	6.8	□□□□□ -1.32
AMD1	YML035C	HAL5	P38970	855 aa	Known RBP	6.8	□□□□□ -1.32
AMD1	YML035C	MRPS35	P53292	345 aa		6.8	□□□□□ -1.32
AMD1	YML035C	RRI2	Q12348	645 aa		6.8	□□□□□ -1.32
AMD1	YML035C	RET1	P22276	1149 aa	Known RBP	6.79	□□□□□ -1.32

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