RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623324.1

CU638689.4-208, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CU638689.4, Length 936 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CU638689.4-208ENST00000623324 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa15.08■□□□□ 0.01
CU638689.4-208ENST00000623324 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0
CU638689.4-208ENST00000623324 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
CU638689.4-208ENST00000623324 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP15.05■□□□□ -0
CU638689.4-208ENST00000623324 LMTK3Q96Q04 1460 aa15.05■□□□□ -0
CU638689.4-208ENST00000623324 FANCAO15360 1455 aa15.02■□□□□ -0
CU638689.4-208ENST00000623324 CFAP74Q9C0B2 1584 aa15.02□□□□□ -0.01
CU638689.4-208ENST00000623324 AKNAQ7Z591 1439 aa15.01□□□□□ -0.01
CU638689.4-208ENST00000623324 RICTORQ6R327 1708 aa15.01□□□□□ -0.01
CU638689.4-208ENST00000623324 PLEKHD1A6NEE1 506 aa15.01□□□□□ -0.01
CU638689.4-208ENST00000623324 PBX2P40425 430 aa15.01□□□□□ -0.01
CU638689.4-208ENST00000623324 TTC37Q6PGP7 1564 aa15□□□□□ -0.01
CU638689.4-208ENST00000623324 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP15□□□□□ -0.01
CU638689.4-208ENST00000623324 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa14.99□□□□□ -0.01
CU638689.4-208ENST00000623324 HSPA2P54652 639 aa14.99□□□□□ -0.01
CU638689.4-208ENST00000623324 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa14.99□□□□□ -0.01
CU638689.4-208ENST00000623324 YEATS2Q9ULM3 1422 aa14.98□□□□□ -0.01
CU638689.4-208ENST00000623324 PTGER2P43116 358 aa14.97□□□□□ -0.01
CU638689.4-208ENST00000623324 POGZQ7Z3K3 1410 aa14.97□□□□□ -0.01
CU638689.4-208ENST00000623324 EFCAB5A4FU69 1503 aa14.97□□□□□ -0.01
CU638689.4-208ENST00000623324 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa14.97□□□□□ -0.01
CU638689.4-208ENST00000623324 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa14.96□□□□□ -0.01
CU638689.4-208ENST00000623324 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
CU638689.4-208ENST00000623324 MLECQ14165 292 aa14.96□□□□□ -0.01
CU638689.4-208ENST00000623324 EEA1Q15075 1411 aa14.96□□□□□ -0.01
CU638689.4-208ENST00000623324 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa14.96□□□□□ -0.01
CU638689.4-208ENST00000623324 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.02
CU638689.4-208ENST00000623324 PSEN2P49810 448 aa14.94□□□□□ -0.02
CU638689.4-208ENST00000623324 DMRTA1Q5VZB9 504 aa14.94□□□□□ -0.02
CU638689.4-208ENST00000623324 HECW1Q76N89 1606 aa14.94□□□□□ -0.02
CU638689.4-208ENST00000623324 ARHGAP33O14559 1287 aa14.93□□□□□ -0.02
CU638689.4-208ENST00000623324 OXER1Q8TDS5 423 aa14.93□□□□□ -0.02
CU638689.4-208ENST00000623324 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP14.92□□□□□ -0.02
CU638689.4-208ENST00000623324 SCAPERQ9BY12 1400 aa14.91□□□□□ -0.02
CU638689.4-208ENST00000623324 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa14.9□□□□□ -0.02
CU638689.4-208ENST00000623324 MAGI2Q86UL8 1455 aa14.9□□□□□ -0.02
CU638689.4-208ENST00000623324 ADGRD1Q6QNK2 874 aa14.9□□□□□ -0.02
CU638689.4-208ENST00000623324 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
CU638689.4-208ENST00000623324 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
CU638689.4-208ENST00000623324 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa14.88□□□□□ -0.03
CU638689.4-208ENST00000623324 PLCH2O75038 1416 aa14.88□□□□□ -0.03
CU638689.4-208ENST00000623324 C9orf84Q5VXU9 1444 aa14.86□□□□□ -0.03
CU638689.4-208ENST00000623324 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
CU638689.4-208ENST00000623324 ATP10AO60312 1499 aa14.85□□□□□ -0.03
CU638689.4-208ENST00000623324 CERKQ8TCT0 537 aa14.85□□□□□ -0.03
CU638689.4-208ENST00000623324 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa14.85□□□□□ -0.03
CU638689.4-208ENST00000623324 MYO5CQ9NQX4 1742 aa14.84□□□□□ -0.03
CU638689.4-208ENST00000623324 TBC1D12O60347 775 aa14.84□□□□□ -0.03
CU638689.4-208ENST00000623324 HRO43593 1189 aa14.83□□□□□ -0.04
CU638689.4-208ENST00000623324 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa14.83□□□□□ -0.04
CU638689.4-208ENST00000623324 KIF14Q15058 1648 aa14.83□□□□□ -0.04
CU638689.4-208ENST00000623324 PREX1Q8TCU6 1659 aa14.82□□□□□ -0.04
CU638689.4-208ENST00000623324 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
CU638689.4-208ENST00000623324 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa14.82□□□□□ -0.04
CU638689.4-208ENST00000623324 FMN1Q68DA7 1419 aa14.82□□□□□ -0.04
CU638689.4-208ENST00000623324 ARHGAP5Q13017 1502 aa14.82□□□□□ -0.04
CU638689.4-208ENST00000623324 UBTFP17480 764 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
CU638689.4-208ENST00000623324 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa14.8□□□□□ -0.04
CU638689.4-208ENST00000623324 PDE4AP27815 886 aa14.79□□□□□ -0.04
CU638689.4-208ENST00000623324 KCNK17Q96T54 332 aa14.79□□□□□ -0.04
CU638689.4-208ENST00000623324 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa14.79□□□□□ -0.04
CU638689.4-208ENST00000623324 TK2O00142 265 aa14.78□□□□□ -0.04
CU638689.4-208ENST00000623324 CADPS2Q86UW7 1296 aa14.78□□□□□ -0.04
CU638689.4-208ENST00000623324 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
CU638689.4-208ENST00000623324 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
CU638689.4-208ENST00000623324 CLIP1P30622 1438 aa14.77□□□□□ -0.04
CU638689.4-208ENST00000623324 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.04
CU638689.4-208ENST00000623324 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa14.77□□□□□ -0.04
CU638689.4-208ENST00000623324 AFAP1Q8N556 730 aa14.77□□□□□ -0.05
CU638689.4-208ENST00000623324 KDM5CP41229 1560 aa14.77□□□□□ -0.05
CU638689.4-208ENST00000623324 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa14.77□□□□□ -0.05
CU638689.4-208ENST00000623324 ZNF454Q8N9F8 522 aa14.76□□□□□ -0.05
CU638689.4-208ENST00000623324 ABCA6Q8N139 1617 aa14.74□□□□□ -0.05
CU638689.4-208ENST00000623324 FOSBP53539 338 aa14.73□□□□□ -0.05
CU638689.4-208ENST00000623324 MFSD10Q14728 455 aa14.73□□□□□ -0.05
CU638689.4-208ENST00000623324 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
CU638689.4-208ENST00000623324 EMILIN3Q9NT22 766 aa14.72□□□□□ -0.05
CU638689.4-208ENST00000623324 STRCQ7RTU9 1775 aa14.72□□□□□ -0.05
CU638689.4-208ENST00000623324 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa14.72□□□□□ -0.05
CU638689.4-208ENST00000623324 DISP3Q9P2K9 1392 aa14.72□□□□□ -0.05
CU638689.4-208ENST00000623324 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
CU638689.4-208ENST00000623324 REREQ9P2R6 1566 aa14.7□□□□□ -0.06
CU638689.4-208ENST00000623324 EVI5O60447 810 aa14.7□□□□□ -0.06
CU638689.4-208ENST00000623324 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
CU638689.4-208ENST00000623324 C3P01024 1663 aa14.7□□□□□ -0.06
CU638689.4-208ENST00000623324 ABCC1P33527 1531 aa14.7□□□□□ -0.06
CU638689.4-208ENST00000623324 PREX2Q70Z35 1606 aa14.7□□□□□ -0.06
CU638689.4-208ENST00000623324 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa14.69□□□□□ -0.06
CU638689.4-208ENST00000623324 BCL2L12Q9HB09 334 aa14.69□□□□□ -0.06
CU638689.4-208ENST00000623324 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa14.69□□□□□ -0.06
CU638689.4-208ENST00000623324 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa14.69□□□□□ -0.06
CU638689.4-208ENST00000623324 MLH3Q9UHC1 1453 aa14.69□□□□□ -0.06
CU638689.4-208ENST00000623324 ITSN2Q9NZM3 1697 aa14.68□□□□□ -0.06
CU638689.4-208ENST00000623324 AGLP35573 1532 aa14.66□□□□□ -0.06
CU638689.4-208ENST00000623324 HCSTQ9UBK5 93 aa14.66□□□□□ -0.06
CU638689.4-208ENST00000623324 CCDC18Q5T9S5 1454 aa14.65□□□□□ -0.06
CU638689.4-208ENST00000623324 ILDR2Q71H61 639 aa14.65□□□□□ -0.06
CU638689.4-208ENST00000623324 PTPRTO14522 1441 aa14.65□□□□□ -0.06
CU638689.4-208ENST00000623324 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CU638689.4-208ENST00000623324 ADAM33Q9BZ11 813 aa14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 121.8 ms