RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593061.5

ILF3-223, Transcript of interleukin enhancer binding factor 3, human

TSL 3

Gene ILF3, Length 475 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ILF3-223	ENST00000593061	ZFYVE9	O95405	1425 aa		29.14	■■■□□ 2.26
ILF3-223	ENST00000593061	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		29.14	■■■□□ 2.26
ILF3-223	ENST00000593061	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		29.13	■■■□□ 2.25
ILF3-223	ENST00000593061	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	29.12	■■■□□ 2.25
ILF3-223	ENST00000593061	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	29.12	■■■□□ 2.25
ILF3-223	ENST00000593061	ALK	Q9UM73	1620 aa		29.12	■■■□□ 2.25
ILF3-223	ENST00000593061	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		29.1	■■■□□ 2.25
ILF3-223	ENST00000593061	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	29.08	■■■□□ 2.25
ILF3-223	ENST00000593061	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		29.07	■■■□□ 2.24
ILF3-223	ENST00000593061	HSPA1L	P34931	641 aa		29.06	■■■□□ 2.24
ILF3-223	ENST00000593061	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	29.06	■■■□□ 2.24
ILF3-223	ENST00000593061	HFM1	A2PYH4	1435 aa		29.05	■■■□□ 2.24
ILF3-223	ENST00000593061	KCNA6	P17658	529 aa		29.05	■■■□□ 2.24
ILF3-223	ENST00000593061	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	29.04	■■■□□ 2.24
ILF3-223	ENST00000593061	NWD1	Q149M9	1564 aa		29.02	■■■□□ 2.24
ILF3-223	ENST00000593061	TRIM52	Q96A61	297 aa		29.01	■■■□□ 2.23
ILF3-223	ENST00000593061	TMEM94	Q12767	1356 aa		29.01	■■■□□ 2.23
ILF3-223	ENST00000593061	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	28.99	■■■□□ 2.23
ILF3-223	ENST00000593061	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	28.99	■■■□□ 2.23
ILF3-223	ENST00000593061	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	28.98	■■■□□ 2.23
ILF3-223	ENST00000593061	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	28.98	■■■□□ 2.23
ILF3-223	ENST00000593061	CLTCL1	P53675	1640 aa		28.97	■■■□□ 2.23
ILF3-223	ENST00000593061	TRPM2	O94759	1503 aa		28.95	■■■□□ 2.23
ILF3-223	ENST00000593061	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	28.94	■■■□□ 2.22
ILF3-223	ENST00000593061	TBX22	Q9Y458	520 aa		28.93	■■■□□ 2.22
ILF3-223	ENST00000593061	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		28.93	■■■□□ 2.22
ILF3-223	ENST00000593061	DIP2A	Q14689	1571 aa		28.92	■■■□□ 2.22
ILF3-223	ENST00000593061	KIF1B	O60333	1816 aa		28.92	■■■□□ 2.22
ILF3-223	ENST00000593061	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	28.9	■■■□□ 2.22
ILF3-223	ENST00000593061	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		28.85	■■■□□ 2.21
ILF3-223	ENST00000593061	ILDR2	Q71H61	639 aa		28.85	■■■□□ 2.21
ILF3-223	ENST00000593061	MSH6	P52701	1360 aa		28.85	■■■□□ 2.21
ILF3-223	ENST00000593061	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		28.83	■■■□□ 2.21
ILF3-223	ENST00000593061	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	28.83	■■■□□ 2.21
ILF3-223	ENST00000593061	PIK3R4	Q99570	1358 aa		28.82	■■■□□ 2.2
ILF3-223	ENST00000593061	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		28.82	■■■□□ 2.2
ILF3-223	ENST00000593061	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		28.8	■■■□□ 2.2
ILF3-223	ENST00000593061	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		28.78	■■■□□ 2.2
ILF3-223	ENST00000593061	FOXD1	Q16676	465 aa		28.78	■■■□□ 2.2
ILF3-223	ENST00000593061	C14orf37	Q86TY3	774 aa		28.78	■■■□□ 2.2
ILF3-223	ENST00000593061	PTPRU	Q92729	1446 aa		28.77	■■■□□ 2.2
ILF3-223	ENST00000593061	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		28.77	■■■□□ 2.2
ILF3-223	ENST00000593061	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	28.73	■■■□□ 2.19
ILF3-223	ENST00000593061	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		28.72	■■■□□ 2.19
ILF3-223	ENST00000593061	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	28.72	■■■□□ 2.19
ILF3-223	ENST00000593061	MET	P08581	1390 aa		28.71	■■■□□ 2.19
ILF3-223	ENST00000593061	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		28.7	■■■□□ 2.18
ILF3-223	ENST00000593061	SLAIN2	Q9P270	581 aa		28.7	■■■□□ 2.18
ILF3-223	ENST00000593061	PPL	O60437	1756 aa		28.68	■■■□□ 2.18
ILF3-223	ENST00000593061	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		28.68	■■■□□ 2.18
ILF3-223	ENST00000593061	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		28.67	■■■□□ 2.18
ILF3-223	ENST00000593061	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	28.66	■■■□□ 2.18
ILF3-223	ENST00000593061	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		28.65	■■■□□ 2.18
ILF3-223	ENST00000593061	PHLPP1	O60346	1717 aa		28.64	■■■□□ 2.18
ILF3-223	ENST00000593061	ATF3	P18847	181 aa		28.64	■■■□□ 2.18
ILF3-223	ENST00000593061	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	28.64	■■■□□ 2.18
ILF3-223	ENST00000593061	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		28.64	■■■□□ 2.17
ILF3-223	ENST00000593061	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		28.63	■■■□□ 2.17
ILF3-223	ENST00000593061	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	28.63	■■■□□ 2.17
ILF3-223	ENST00000593061	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		28.59	■■■□□ 2.17
ILF3-223	ENST00000593061	SOCS7	O14512	581 aa		28.58	■■■□□ 2.17
ILF3-223	ENST00000593061	RGL3	Q3MIN7	710 aa		28.58	■■■□□ 2.17
ILF3-223	ENST00000593061	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	28.57	■■■□□ 2.16
ILF3-223	ENST00000593061	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		28.55	■■■□□ 2.16
ILF3-223	ENST00000593061	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		28.55	■■■□□ 2.16
ILF3-223	ENST00000593061	IFT172	Q9UG01	1749 aa		28.55	■■■□□ 2.16
ILF3-223	ENST00000593061	DCC	P43146	1447 aa		28.54	■■■□□ 2.16
ILF3-223	ENST00000593061	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		28.52	■■■□□ 2.16
ILF3-223	ENST00000593061	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	28.52	■■■□□ 2.16
ILF3-223	ENST00000593061	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		28.5	■■■□□ 2.15
ILF3-223	ENST00000593061	PTCH1	Q13635	1447 aa		28.5	■■■□□ 2.15
ILF3-223	ENST00000593061	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	28.48	■■■□□ 2.15
ILF3-223	ENST00000593061	MST1R	Q04912	1400 aa		28.48	■■■□□ 2.15
ILF3-223	ENST00000593061	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		28.48	■■■□□ 2.15
ILF3-223	ENST00000593061	BRINP3	Q76B58	766 aa		28.47	■■■□□ 2.15
ILF3-223	ENST00000593061	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		28.47	■■■□□ 2.15
ILF3-223	ENST00000593061	JCAD	Q9P266	1359 aa		28.47	■■■□□ 2.15
ILF3-223	ENST00000593061	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		28.44	■■■□□ 2.14
ILF3-223	ENST00000593061	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		28.42	■■■□□ 2.14
ILF3-223	ENST00000593061	PIK3C2G	O75747	1445 aa		28.39	■■■□□ 2.14
ILF3-223	ENST00000593061	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	28.39	■■■□□ 2.14
ILF3-223	ENST00000593061	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		28.39	■■■□□ 2.13
ILF3-223	ENST00000593061	STK26	Q9P289	416 aa		28.38	■■■□□ 2.13
ILF3-223	ENST00000593061	SHPRH	Q149N8	1683 aa		28.37	■■■□□ 2.13
ILF3-223	ENST00000593061	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		28.35	■■■□□ 2.13
ILF3-223	ENST00000593061	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		28.34	■■■□□ 2.13
ILF3-223	ENST00000593061	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		28.33	■■■□□ 2.13
ILF3-223	ENST00000593061	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	28.32	■■■□□ 2.12
ILF3-223	ENST00000593061	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	28.32	■■■□□ 2.12
ILF3-223	ENST00000593061	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		28.31	■■■□□ 2.12
ILF3-223	ENST00000593061	MYOM2	P54296	1465 aa		28.31	■■■□□ 2.12
ILF3-223	ENST00000593061	LRP6	O75581	1613 aa		28.31	■■■□□ 2.12
ILF3-223	ENST00000593061	TECPR2	O15040	1411 aa		28.3	■■■□□ 2.12
ILF3-223	ENST00000593061	HRC	P23327	699 aa		28.29	■■■□□ 2.12
ILF3-223	ENST00000593061	LAMC1	P11047	1609 aa		28.29	■■■□□ 2.12
ILF3-223	ENST00000593061	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		28.28	■■■□□ 2.12
ILF3-223	ENST00000593061	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		28.28	■■■□□ 2.12
ILF3-223	ENST00000593061	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		28.28	■■■□□ 2.12
ILF3-223	ENST00000593061	YTHDC2	Q9H6S0	1430 aa	Known RBP	28.27	■■■□□ 2.12
ILF3-223	ENST00000593061	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	28.27	■■■□□ 2.12

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