RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592576.5

EFTUD2-223, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, human

TSL 2 BASIC

Gene EFTUD2, Length 3,364 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFTUD2-223	ENST00000592576	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		13.08	□□□□□ -0.31
EFTUD2-223	ENST00000592576	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
EFTUD2-223	ENST00000592576	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
EFTUD2-223	ENST00000592576	IFT172	Q9UG01	1749 aa		13.07	□□□□□ -0.32
EFTUD2-223	ENST00000592576	PPL	O60437	1756 aa		13.07	□□□□□ -0.32
EFTUD2-223	ENST00000592576	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	13.07	□□□□□ -0.32
EFTUD2-223	ENST00000592576	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		13.07	□□□□□ -0.32
EFTUD2-223	ENST00000592576	MYOM2	P54296	1465 aa		13.07	□□□□□ -0.32
EFTUD2-223	ENST00000592576	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		13.07	□□□□□ -0.32
EFTUD2-223	ENST00000592576	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	13.07	□□□□□ -0.32
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZFYVE9	O95405	1425 aa		13.06	□□□□□ -0.32
EFTUD2-223	ENST00000592576	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	13.06	□□□□□ -0.32
EFTUD2-223	ENST00000592576	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		13.04	□□□□□ -0.32
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	13.04	□□□□□ -0.32
EFTUD2-223	ENST00000592576	LTK	P29376	864 aa		13.03	□□□□□ -0.32
EFTUD2-223	ENST00000592576	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	13.03	□□□□□ -0.32
EFTUD2-223	ENST00000592576	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	13.03	□□□□□ -0.32
EFTUD2-223	ENST00000592576	PIK3C2G	O75747	1445 aa		13.03	□□□□□ -0.32
EFTUD2-223	ENST00000592576	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		13.03	□□□□□ -0.32
EFTUD2-223	ENST00000592576	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		13.03	□□□□□ -0.32
EFTUD2-223	ENST00000592576	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		13.02	□□□□□ -0.32
EFTUD2-223	ENST00000592576	SLIT1	O75093	1534 aa		13.02	□□□□□ -0.32
EFTUD2-223	ENST00000592576	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		13.02	□□□□□ -0.32
EFTUD2-223	ENST00000592576	EID1	Q9Y6B2	187 aa		13.02	□□□□□ -0.33
EFTUD2-223	ENST00000592576	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		13.02	□□□□□ -0.33
EFTUD2-223	ENST00000592576	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	13.01	□□□□□ -0.33
EFTUD2-223	ENST00000592576	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		13.01	□□□□□ -0.33
EFTUD2-223	ENST00000592576	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	13	□□□□□ -0.33
EFTUD2-223	ENST00000592576	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		12.99	□□□□□ -0.33
EFTUD2-223	ENST00000592576	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	12.98	□□□□□ -0.33
EFTUD2-223	ENST00000592576	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		12.98	□□□□□ -0.33
EFTUD2-223	ENST00000592576	BCAN	Q96GW7	911 aa		12.98	□□□□□ -0.33
EFTUD2-223	ENST00000592576	HSPA2	P54652	639 aa		12.98	□□□□□ -0.33
EFTUD2-223	ENST00000592576	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		12.97	□□□□□ -0.33
EFTUD2-223	ENST00000592576	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		12.97	□□□□□ -0.33
EFTUD2-223	ENST00000592576	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		12.97	□□□□□ -0.33
EFTUD2-223	ENST00000592576	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		12.97	□□□□□ -0.33
EFTUD2-223	ENST00000592576	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		12.96	□□□□□ -0.33
EFTUD2-223	ENST00000592576	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	12.95	□□□□□ -0.34
EFTUD2-223	ENST00000592576	ALK	Q9UM73	1620 aa		12.95	□□□□□ -0.34
EFTUD2-223	ENST00000592576	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		12.95	□□□□□ -0.34
EFTUD2-223	ENST00000592576	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		12.95	□□□□□ -0.34
EFTUD2-223	ENST00000592576	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		12.95	□□□□□ -0.34
EFTUD2-223	ENST00000592576	USP47	Q96K76	1375 aa		12.94	□□□□□ -0.34
EFTUD2-223	ENST00000592576	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	12.94	□□□□□ -0.34
EFTUD2-223	ENST00000592576	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		12.94	□□□□□ -0.34
EFTUD2-223	ENST00000592576	ADGRB1	O14514	1584 aa		12.94	□□□□□ -0.34
EFTUD2-223	ENST00000592576	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		12.94	□□□□□ -0.34
EFTUD2-223	ENST00000592576	IQGAP1	P46940	1657 aa		12.93	□□□□□ -0.34
EFTUD2-223	ENST00000592576	LAMC1	P11047	1609 aa		12.93	□□□□□ -0.34
EFTUD2-223	ENST00000592576	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	12.93	□□□□□ -0.34
EFTUD2-223	ENST00000592576	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		12.92	□□□□□ -0.34
EFTUD2-223	ENST00000592576	MET	P08581	1390 aa		12.92	□□□□□ -0.34
EFTUD2-223	ENST00000592576	MED14	O60244	1454 aa		12.91	□□□□□ -0.34
EFTUD2-223	ENST00000592576	STK26	Q9P289	416 aa		12.91	□□□□□ -0.34
EFTUD2-223	ENST00000592576	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		12.91	□□□□□ -0.34
EFTUD2-223	ENST00000592576	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	12.91	□□□□□ -0.34
EFTUD2-223	ENST00000592576	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	12.9	□□□□□ -0.34
EFTUD2-223	ENST00000592576	ST20-MTHFS	A0A0A6YYL1	179 aa		12.9	□□□□□ -0.34
EFTUD2-223	ENST00000592576	TBX22	Q9Y458	520 aa		12.9	□□□□□ -0.34
EFTUD2-223	ENST00000592576	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	12.9	□□□□□ -0.34
EFTUD2-223	ENST00000592576	YTHDC2	Q9H6S0	1430 aa	Known RBP	12.89	□□□□□ -0.35
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	12.88	□□□□□ -0.35
EFTUD2-223	ENST00000592576	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
EFTUD2-223	ENST00000592576	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
EFTUD2-223	ENST00000592576	DIP2A	Q14689	1571 aa		12.86	□□□□□ -0.35
EFTUD2-223	ENST00000592576	ABCC11	Q96J66	1382 aa		12.85	□□□□□ -0.35
EFTUD2-223	ENST00000592576	PTPRU	Q92729	1446 aa		12.85	□□□□□ -0.35
EFTUD2-223	ENST00000592576	STRC	Q7RTU9	1775 aa		12.85	□□□□□ -0.35
EFTUD2-223	ENST00000592576	TESK2	Q96S53	571 aa		12.84	□□□□□ -0.35
EFTUD2-223	ENST00000592576	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		12.84	□□□□□ -0.35
EFTUD2-223	ENST00000592576	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	12.84	□□□□□ -0.35
EFTUD2-223	ENST00000592576	PRAM1	Q96QH2	718 aa		12.84	□□□□□ -0.35
EFTUD2-223	ENST00000592576	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
EFTUD2-223	ENST00000592576	PIK3R4	Q99570	1358 aa		12.84	□□□□□ -0.35
EFTUD2-223	ENST00000592576	ARHGEF28	Q8N1W1	1705 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
EFTUD2-223	ENST00000592576	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
EFTUD2-223	ENST00000592576	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
EFTUD2-223	ENST00000592576	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		12.83	□□□□□ -0.36
EFTUD2-223	ENST00000592576	TECPR2	O15040	1411 aa		12.82	□□□□□ -0.36
EFTUD2-223	ENST00000592576	POGK	Q9P215	609 aa		12.82	□□□□□ -0.36
EFTUD2-223	ENST00000592576	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		12.82	□□□□□ -0.36
EFTUD2-223	ENST00000592576	KCNA6	P17658	529 aa		12.81	□□□□□ -0.36
EFTUD2-223	ENST00000592576	DLC1	Q96QB1	1528 aa		12.81	□□□□□ -0.36
EFTUD2-223	ENST00000592576	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		12.81	□□□□□ -0.36
EFTUD2-223	ENST00000592576	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		12.79	□□□□□ -0.36
EFTUD2-223	ENST00000592576	CPS1	P31327	1500 aa		12.79	□□□□□ -0.36
EFTUD2-223	ENST00000592576	SIRT1	Q96EB6	747 aa		12.79	□□□□□ -0.36
EFTUD2-223	ENST00000592576	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		12.79	□□□□□ -0.36
EFTUD2-223	ENST00000592576	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		12.79	□□□□□ -0.36
EFTUD2-223	ENST00000592576	SBNO2	Q9Y2G9	1366 aa		12.79	□□□□□ -0.36
EFTUD2-223	ENST00000592576	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
EFTUD2-223	ENST00000592576	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		12.79	□□□□□ -0.36
EFTUD2-223	ENST00000592576	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
EFTUD2-223	ENST00000592576	QRICH2	Q9H0J4	1663 aa		12.78	□□□□□ -0.36
EFTUD2-223	ENST00000592576	MINK1	Q8N4C8	1332 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
EFTUD2-223	ENST00000592576	TMF1	P82094	1093 aa		12.78	□□□□□ -0.36
EFTUD2-223	ENST00000592576	PTCH1	Q13635	1447 aa		12.78	□□□□□ -0.36
EFTUD2-223	ENST00000592576	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		12.78	□□□□□ -0.36
EFTUD2-223	ENST00000592576	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		12.77	□□□□□ -0.36

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71 ms