RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590367.5

EFTUD2-218, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 3,638 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-218ENST00000590367 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa9.99□□□□□ -0.81
EFTUD2-218ENST00000590367 BCORL1Q5H9F3 1711 aa9.99□□□□□ -0.81
EFTUD2-218ENST00000590367 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
EFTUD2-218ENST00000590367 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
EFTUD2-218ENST00000590367 STAG3Q9UJ98 1225 aa9.98□□□□□ -0.81
EFTUD2-218ENST00000590367 A2MP01023 1474 aa9.98□□□□□ -0.81
EFTUD2-218ENST00000590367 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
EFTUD2-218ENST00000590367 ADAMTSL3P82987 1691 aa9.97□□□□□ -0.81
EFTUD2-218ENST00000590367 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa9.97□□□□□ -0.81
EFTUD2-218ENST00000590367 PREX2Q70Z35 1606 aa9.97□□□□□ -0.81
EFTUD2-218ENST00000590367 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa9.96□□□□□ -0.81
EFTUD2-218ENST00000590367 TAF3Q5VWG9 929 aa9.96□□□□□ -0.81
EFTUD2-218ENST00000590367 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
EFTUD2-218ENST00000590367 MPHOSPH9Q99550 1183 aa9.96□□□□□ -0.81
EFTUD2-218ENST00000590367 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa9.96□□□□□ -0.81
EFTUD2-218ENST00000590367 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa9.96□□□□□ -0.82
EFTUD2-218ENST00000590367 ESPNB1AK53 854 aa9.95□□□□□ -0.82
EFTUD2-218ENST00000590367 FBXO41Q8TF61 875 aa9.95□□□□□ -0.82
EFTUD2-218ENST00000590367 LMTK3Q96Q04 1460 aa9.95□□□□□ -0.82
EFTUD2-218ENST00000590367 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP9.95□□□□□ -0.82
EFTUD2-218ENST00000590367 HOMEZQ8IX15 550 aa9.95□□□□□ -0.82
EFTUD2-218ENST00000590367 CERKQ8TCT0 537 aa9.95□□□□□ -0.82
EFTUD2-218ENST00000590367 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa9.95□□□□□ -0.82
EFTUD2-218ENST00000590367 PTPRKQ15262 1439 aa9.95□□□□□ -0.82
EFTUD2-218ENST00000590367 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
EFTUD2-218ENST00000590367 CNTLNQ9NXG0 1405 aa9.94□□□□□ -0.82
EFTUD2-218ENST00000590367 TERF1P54274 439 aa9.94□□□□□ -0.82
EFTUD2-218ENST00000590367 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
EFTUD2-218ENST00000590367 ATP7AQ04656 1500 aa9.94□□□□□ -0.82
EFTUD2-218ENST00000590367 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP9.94□□□□□ -0.82
EFTUD2-218ENST00000590367 TEX2Q8IWB9 1127 aa9.94□□□□□ -0.82
EFTUD2-218ENST00000590367 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa9.94□□□□□ -0.82
EFTUD2-218ENST00000590367 CCDC141Q6ZP82 1450 aa9.94□□□□□ -0.82
EFTUD2-218ENST00000590367 KDM5CP41229 1560 aa9.94□□□□□ -0.82
EFTUD2-218ENST00000590367 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-218ENST00000590367 HFM1A2PYH4 1435 aa9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-218ENST00000590367 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-218ENST00000590367 MYH16Q9H6N6 1097 aa9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-218ENST00000590367 NAIPQ13075 1403 aa9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-218ENST00000590367 NUDCQ9Y266 331 aa9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-218ENST00000590367 KIF20AO95235 890 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-218ENST00000590367 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-218ENST00000590367 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-218ENST00000590367 L3MBTL2Q969R5 705 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-218ENST00000590367 CHMP4AQ9BY43 222 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-218ENST00000590367 PPP6R1Q9UPN7 881 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-218ENST00000590367 ABCA6Q8N139 1617 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-218ENST00000590367 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-218ENST00000590367 CHGAP10645 457 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-218ENST00000590367 MBD5Q9P267 1494 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-218ENST00000590367 MRE11P49959 708 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-218ENST00000590367 DMTNQ08495 405 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-218ENST00000590367 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-218ENST00000590367 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-218ENST00000590367 FAM9BQ8IZU0 186 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-218ENST00000590367 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-218ENST00000590367 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-218ENST00000590367 RNF123Q5XPI4 1314 aa9.9□□□□□ -0.82
EFTUD2-218ENST00000590367 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
EFTUD2-218ENST00000590367 POGKQ9P215 609 aa9.9□□□□□ -0.82
EFTUD2-218ENST00000590367 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
EFTUD2-218ENST00000590367 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.83
EFTUD2-218ENST00000590367 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.83
EFTUD2-218ENST00000590367 KIF15Q9NS87 1388 aa9.9□□□□□ -0.83
EFTUD2-218ENST00000590367 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-218ENST00000590367 ITSN2Q9NZM3 1697 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-218ENST00000590367 ANKLE2Q86XL3 938 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-218ENST00000590367 FAM13BQ9NYF5 915 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-218ENST00000590367 TNRQ92752 1358 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-218ENST00000590367 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-218ENST00000590367 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP9.89□□□□□ -0.838e-6■■□□□ 12.6
EFTUD2-218ENST00000590367 MRS2Q9HD23 443 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-218ENST00000590367 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-218ENST00000590367 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-218ENST00000590367 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-218ENST00000590367 AGLP35573 1532 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-218ENST00000590367 VGFO15240 615 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-218ENST00000590367 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-218ENST00000590367 SLC4A3P48751 1232 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-218ENST00000590367 BECN1Q14457 450 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-218ENST00000590367 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-218ENST00000590367 UBAP1LF5GYI3 381 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-218ENST00000590367 KANK1Q14678 1352 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-218ENST00000590367 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-218ENST00000590367 PIP4K2BP78356 416 aa9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-218ENST00000590367 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-218ENST00000590367 MIA2Q96PC5 1412 aa9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-218ENST00000590367 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
EFTUD2-218ENST00000590367 PTPN23Q9H3S7 1636 aa9.86□□□□□ -0.83
EFTUD2-218ENST00000590367 PKD2Q13563 968 aa9.86□□□□□ -0.83
EFTUD2-218ENST00000590367 PLCD3Q8N3E9 789 aa9.86□□□□□ -0.83
EFTUD2-218ENST00000590367 TMEM51Q9NW97 253 aa9.86□□□□□ -0.83
EFTUD2-218ENST00000590367 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
EFTUD2-218ENST00000590367 TXNDC2Q86VQ3 553 aa9.84□□□□□ -0.83
EFTUD2-218ENST00000590367 EID1Q9Y6B2 187 aa9.84□□□□□ -0.83
EFTUD2-218ENST00000590367 MSNP26038 577 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
EFTUD2-218ENST00000590367 FSD2A1L4K1 749 aa9.84□□□□□ -0.83
EFTUD2-218ENST00000590367 OFD1O75665 1012 aa9.83□□□□□ -0.84
EFTUD2-218ENST00000590367 ABCC5O15440 1437 aa9.83□□□□□ -0.84
EFTUD2-218ENST00000590367 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.2 ms