RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590194.5

SLC25A39-212, Transcript of solute carrier family 25 member 39, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene SLC25A39, Length 1,542 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A39-212ENST00000590194 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP30.04■■■□□ 2.4
SLC25A39-212ENST00000590194 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP30.03■■■□□ 2.4
SLC25A39-212ENST00000590194 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP30.03■■■□□ 2.4
SLC25A39-212ENST00000590194 HDGFP51858 240 aaKnown RBP30.03■■■□□ 2.4
SLC25A39-212ENST00000590194 ZFYVE9O95405 1425 aa30.03■■■□□ 2.4
SLC25A39-212ENST00000590194 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa30.03■■■□□ 2.4
SLC25A39-212ENST00000590194 SIN3AQ96ST3 1273 aa30.02■■■□□ 2.4
SLC25A39-212ENST00000590194 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP30■■■□□ 2.39
SLC25A39-212ENST00000590194 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP30■■■□□ 2.39
SLC25A39-212ENST00000590194 NEURL4Q96JN8 1562 aa30■■■□□ 2.39
SLC25A39-212ENST00000590194 NEUROD1Q13562 356 aa29.99■■■□□ 2.39
SLC25A39-212ENST00000590194 DMRT2Q9Y5R5 561 aa29.99■■■□□ 2.39
SLC25A39-212ENST00000590194 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP29.97■■■□□ 2.39
SLC25A39-212ENST00000590194 BCANQ96GW7 911 aa29.97■■■□□ 2.39
SLC25A39-212ENST00000590194 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa29.97■■■□□ 2.39
SLC25A39-212ENST00000590194 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa29.95■■■□□ 2.39
SLC25A39-212ENST00000590194 MED14O60244 1454 aa29.95■■■□□ 2.38
SLC25A39-212ENST00000590194 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP29.93■■■□□ 2.38
SLC25A39-212ENST00000590194 IQGAP1P46940 1657 aa29.91■■■□□ 2.38
SLC25A39-212ENST00000590194 VGFO15240 615 aaPredicted RBP29.9■■■□□ 2.38
SLC25A39-212ENST00000590194 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa29.89■■■□□ 2.38
SLC25A39-212ENST00000590194 PPLO60437 1756 aa29.89■■■□□ 2.38
SLC25A39-212ENST00000590194 SLC26A8Q96RN1 970 aa29.88■■■□□ 2.37
SLC25A39-212ENST00000590194 DCAF11Q8TEB1 546 aa29.87■■■□□ 2.37
SLC25A39-212ENST00000590194 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa29.86■■■□□ 2.37
SLC25A39-212ENST00000590194 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa29.85■■■□□ 2.37
SLC25A39-212ENST00000590194 IFT172Q9UG01 1749 aa29.84■■■□□ 2.37
SLC25A39-212ENST00000590194 L3MBTL2Q969R5 705 aa29.79■■■□□ 2.36
SLC25A39-212ENST00000590194 CLSPNQ9HAW4 1339 aa29.78■■■□□ 2.36
SLC25A39-212ENST00000590194 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa29.77■■■□□ 2.36
SLC25A39-212ENST00000590194 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP29.77■■■□□ 2.36
SLC25A39-212ENST00000590194 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa29.76■■■□□ 2.35
SLC25A39-212ENST00000590194 FBXO41Q8TF61 875 aa29.76■■■□□ 2.35
SLC25A39-212ENST00000590194 MYOM2P54296 1465 aa29.75■■■□□ 2.35
SLC25A39-212ENST00000590194 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa29.75■■■□□ 2.35
SLC25A39-212ENST00000590194 TBX22Q9Y458 520 aa29.75■■■□□ 2.35
SLC25A39-212ENST00000590194 TONSLQ96HA7 1378 aa29.74■■■□□ 2.35
SLC25A39-212ENST00000590194 CERKQ8TCT0 537 aa29.72■■■□□ 2.35
SLC25A39-212ENST00000590194 PIK3C2GO75747 1445 aa29.71■■■□□ 2.35
SLC25A39-212ENST00000590194 STAC3Q96MF2 364 aa29.71■■■□□ 2.35
SLC25A39-212ENST00000590194 DIP2AQ14689 1571 aa29.69■■■□□ 2.34
SLC25A39-212ENST00000590194 ALKQ9UM73 1620 aa29.69■■■□□ 2.34
SLC25A39-212ENST00000590194 NRXN1Q9ULB1 1477 aa29.69■■■□□ 2.34
SLC25A39-212ENST00000590194 METP08581 1390 aa29.67■■■□□ 2.34
SLC25A39-212ENST00000590194 CFAP70Q5T0N1 1121 aa29.66■■■□□ 2.34
SLC25A39-212ENST00000590194 KCNA6P17658 529 aa29.63■■■□□ 2.33
SLC25A39-212ENST00000590194 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP29.63■■■□□ 2.33
SLC25A39-212ENST00000590194 TMEM132EQ6IEE7 984 aa29.61■■■□□ 2.33
SLC25A39-212ENST00000590194 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP29.61■■■□□ 2.33
SLC25A39-212ENST00000590194 STRCP1A6NGW2 1772 aa29.61■■■□□ 2.33
SLC25A39-212ENST00000590194 PRAG1Q86YV5 1406 aa29.6■■■□□ 2.33
SLC25A39-212ENST00000590194 PIK3R4Q99570 1358 aa29.6■■■□□ 2.33
SLC25A39-212ENST00000590194 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa29.6■■■□□ 2.33
SLC25A39-212ENST00000590194 PTPRUQ92729 1446 aa29.59■■■□□ 2.33
SLC25A39-212ENST00000590194 LTBP4Q8N2S1 1624 aa29.59■■■□□ 2.33
SLC25A39-212ENST00000590194 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP29.58■■■□□ 2.33
SLC25A39-212ENST00000590194 LAMC1P11047 1609 aa29.55■■■□□ 2.32
SLC25A39-212ENST00000590194 STK26Q9P289 416 aa29.55■■■□□ 2.32
SLC25A39-212ENST00000590194 NWD1Q149M9 1564 aa29.54■■■□□ 2.32
SLC25A39-212ENST00000590194 CPS1P31327 1500 aa29.53■■■□□ 2.32
SLC25A39-212ENST00000590194 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa29.53■■■□□ 2.32
SLC25A39-212ENST00000590194 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP29.53■■■□□ 2.32
SLC25A39-212ENST00000590194 NBPF8Q3BBV2 869 aa29.52■■■□□ 2.32
SLC25A39-212ENST00000590194 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP29.52■■■□□ 2.32
SLC25A39-212ENST00000590194 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa29.52■■■□□ 2.32
SLC25A39-212ENST00000590194 NBPF1Q3BBV0 1214 aa29.5■■■□□ 2.31
SLC25A39-212ENST00000590194 LRRC7Q96NW7 1537 aa29.48■■■□□ 2.31
SLC25A39-212ENST00000590194 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP29.48■■■□□ 2.31
SLC25A39-212ENST00000590194 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP29.48■■■□□ 2.31
SLC25A39-212ENST00000590194 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP29.47■■■□□ 2.31
SLC25A39-212ENST00000590194 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP29.47■■■□□ 2.31
SLC25A39-212ENST00000590194 ADGRB1O14514 1584 aa29.46■■■□□ 2.31
SLC25A39-212ENST00000590194 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa29.45■■■□□ 2.3
SLC25A39-212ENST00000590194 TMEM94Q12767 1356 aa29.44■■■□□ 2.3
SLC25A39-212ENST00000590194 TRAK1Q9UPV9 953 aa29.43■■■□□ 2.3
SLC25A39-212ENST00000590194 ROBO2Q9HCK4 1378 aa29.43■■■□□ 2.3
SLC25A39-212ENST00000590194 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa29.43■■■□□ 2.3
SLC25A39-212ENST00000590194 ABCC11Q96J66 1382 aa29.41■■■□□ 2.3
SLC25A39-212ENST00000590194 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP29.41■■■□□ 2.3
SLC25A39-212ENST00000590194 C14orf37Q86TY3 774 aa29.4■■■□□ 2.3
SLC25A39-212ENST00000590194 WAPLQ7Z5K2 1190 aa29.39■■■□□ 2.3
SLC25A39-212ENST00000590194 PTCH1Q13635 1447 aa29.38■■■□□ 2.29
SLC25A39-212ENST00000590194 TECPR2O15040 1411 aa29.37■■■□□ 2.29
SLC25A39-212ENST00000590194 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP29.36■■■□□ 2.29
SLC25A39-212ENST00000590194 KNDC1Q76NI1 1749 aa29.35■■■□□ 2.29
SLC25A39-212ENST00000590194 IQSEC2Q5JU85 1478 aa29.35■■■□□ 2.29
SLC25A39-212ENST00000590194 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP29.34■■■□□ 2.29
SLC25A39-212ENST00000590194 PRAM1Q96QH2 718 aa29.34■■■□□ 2.29
SLC25A39-212ENST00000590194 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa29.34■■■□□ 2.29
SLC25A39-212ENST00000590194 RALGAPBQ86X10 1494 aa29.33■■■□□ 2.29
SLC25A39-212ENST00000590194 CARD11Q9BXL7 1154 aa29.32■■■□□ 2.28
SLC25A39-212ENST00000590194 POGKQ9P215 609 aa29.32■■■□□ 2.28
SLC25A39-212ENST00000590194 SIRT1Q96EB6 747 aa29.3■■■□□ 2.28
SLC25A39-212ENST00000590194 FAM135BQ49AJ0 1406 aa29.29■■■□□ 2.28
SLC25A39-212ENST00000590194 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa29.29■■■□□ 2.28
SLC25A39-212ENST00000590194 MSH6P52701 1360 aa29.29■■■□□ 2.28
SLC25A39-212ENST00000590194 DLC1Q96QB1 1528 aa29.29■■■□□ 2.28
SLC25A39-212ENST00000590194 GPRASP1Q5JY77 1395 aa29.27■■■□□ 2.28
SLC25A39-212ENST00000590194 C19orf44Q9H6X5 657 aa29.27■■■□□ 2.28
SLC25A39-212ENST00000590194 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP29.25■■■□□ 2.27
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