RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570016.5

CDIPT-210, Transcript of CDP-diacylglycerol--inositol 3-phosphatidyltransferase, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CDIPT, Length 1,346 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDIPT-210ENST00000570016 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP32.62■■■□□ 2.81
CDIPT-210ENST00000570016 CHGAP10645 457 aaKnown RBP32.59■■■□□ 2.81
CDIPT-210ENST00000570016 TRIM52Q96A61 297 aa32.59■■■□□ 2.81
CDIPT-210ENST00000570016 SLC26A8Q96RN1 970 aa32.58■■■□□ 2.81
CDIPT-210ENST00000570016 KCNA6P17658 529 aa32.56■■■□□ 2.8
CDIPT-210ENST00000570016 CLTCL1P53675 1640 aa32.56■■■□□ 2.8
CDIPT-210ENST00000570016 NWD1Q149M9 1564 aa32.55■■■□□ 2.8
CDIPT-210ENST00000570016 TOM1O60784 492 aa32.54■■■□□ 2.8
CDIPT-210ENST00000570016 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP32.54■■■□□ 2.8
CDIPT-210ENST00000570016 ALKQ9UM73 1620 aa32.54■■■□□ 2.8
CDIPT-210ENST00000570016 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP32.53■■■□□ 2.8
CDIPT-210ENST00000570016 TBX22Q9Y458 520 aa32.51■■■□□ 2.8
CDIPT-210ENST00000570016 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP32.51■■■□□ 2.79
CDIPT-210ENST00000570016 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa32.5■■■□□ 2.79
CDIPT-210ENST00000570016 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP32.5■■■□□ 2.79
CDIPT-210ENST00000570016 DIP2AQ14689 1571 aa32.49■■■□□ 2.79
CDIPT-210ENST00000570016 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP32.49■■■□□ 2.79
CDIPT-210ENST00000570016 BCANQ96GW7 911 aa32.47■■■□□ 2.79
CDIPT-210ENST00000570016 SETD5Q9C0A6 1442 aa32.46■■■□□ 2.79
CDIPT-210ENST00000570016 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP32.45■■■□□ 2.79
CDIPT-210ENST00000570016 KIF1BO60333 1816 aa32.44■■■□□ 2.78
CDIPT-210ENST00000570016 PIK3R4Q99570 1358 aa32.43■■■□□ 2.78
CDIPT-210ENST00000570016 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP32.43■■■□□ 2.78
CDIPT-210ENST00000570016 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa32.42■■■□□ 2.78
CDIPT-210ENST00000570016 TMEM94Q12767 1356 aa32.42■■■□□ 2.78
CDIPT-210ENST00000570016 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa32.41■■■□□ 2.78
CDIPT-210ENST00000570016 MPHOSPH9Q99550 1183 aa32.41■■■□□ 2.78
CDIPT-210ENST00000570016 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa32.39■■■□□ 2.78
CDIPT-210ENST00000570016 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP32.38■■■□□ 2.77
CDIPT-210ENST00000570016 PIP4K2BP78356 416 aa32.37■■■□□ 2.77
CDIPT-210ENST00000570016 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP32.36■■■□□ 2.77
CDIPT-210ENST00000570016 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP32.35■■■□□ 2.77
CDIPT-210ENST00000570016 FOXD1Q16676 465 aa32.33■■■□□ 2.77
CDIPT-210ENST00000570016 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa32.33■■■□□ 2.77
CDIPT-210ENST00000570016 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa32.32■■■□□ 2.76
CDIPT-210ENST00000570016 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP32.32■■■□□ 2.76
CDIPT-210ENST00000570016 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa32.31■■■□□ 2.76
CDIPT-210ENST00000570016 PTPRUQ92729 1446 aa32.29■■■□□ 2.76
CDIPT-210ENST00000570016 CCDC144AA2RUR9 1427 aa32.28■■■□□ 2.76
CDIPT-210ENST00000570016 HSPA1LP34931 641 aa32.27■■■□□ 2.76
CDIPT-210ENST00000570016 VGFO15240 615 aaPredicted RBP32.26■■■□□ 2.75
CDIPT-210ENST00000570016 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP32.26■■■□□ 2.75
CDIPT-210ENST00000570016 HRCP23327 699 aa32.25■■■□□ 2.75
CDIPT-210ENST00000570016 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa32.24■■■□□ 2.75
CDIPT-210ENST00000570016 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP32.24■■■□□ 2.75
CDIPT-210ENST00000570016 PPLO60437 1756 aa32.23■■■□□ 2.75
CDIPT-210ENST00000570016 MSH6P52701 1360 aa32.23■■■□□ 2.75
CDIPT-210ENST00000570016 FAM135BQ49AJ0 1406 aa32.23■■■□□ 2.75
CDIPT-210ENST00000570016 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa32.23■■■□□ 2.75
CDIPT-210ENST00000570016 METP08581 1390 aa32.22■■■□□ 2.75
CDIPT-210ENST00000570016 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP32.17■■■□□ 2.74
CDIPT-210ENST00000570016 IFT172Q9UG01 1749 aa32.13■■■□□ 2.73
CDIPT-210ENST00000570016 C19orf44Q9H6X5 657 aa32.12■■■□□ 2.73
CDIPT-210ENST00000570016 PRAG1Q86YV5 1406 aa32.11■■■□□ 2.73
CDIPT-210ENST00000570016 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa32.11■■■□□ 2.73
CDIPT-210ENST00000570016 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP32.1■■■□□ 2.73
CDIPT-210ENST00000570016 SLAIN2Q9P270 581 aa32.09■■■□□ 2.73
CDIPT-210ENST00000570016 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa32.09■■■□□ 2.73
CDIPT-210ENST00000570016 DCCP43146 1447 aa32.08■■■□□ 2.73
CDIPT-210ENST00000570016 DISP3Q9P2K9 1392 aa32.08■■■□□ 2.73
CDIPT-210ENST00000570016 RGL3Q3MIN7 710 aa32.06■■■□□ 2.72
CDIPT-210ENST00000570016 CADPS2Q86UW7 1296 aa32.06■■■□□ 2.72
CDIPT-210ENST00000570016 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa32.06■■■□□ 2.72
CDIPT-210ENST00000570016 PTCH1Q13635 1447 aa32.05■■■□□ 2.72
CDIPT-210ENST00000570016 C14orf37Q86TY3 774 aa32.03■■■□□ 2.72
CDIPT-210ENST00000570016 PIK3C2GO75747 1445 aa32■■■□□ 2.71
CDIPT-210ENST00000570016 ATF3P18847 181 aa32■■■□□ 2.71
CDIPT-210ENST00000570016 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa31.99■■■□□ 2.71
CDIPT-210ENST00000570016 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP31.98■■■□□ 2.71
CDIPT-210ENST00000570016 NRXN1Q9ULB1 1477 aa31.97■■■□□ 2.71
CDIPT-210ENST00000570016 MYOM2P54296 1465 aa31.97■■■□□ 2.71
CDIPT-210ENST00000570016 ROBO2Q9HCK4 1378 aa31.95■■■□□ 2.71
CDIPT-210ENST00000570016 NALCNQ8IZF0 1738 aa31.93■■■□□ 2.7
CDIPT-210ENST00000570016 TECPR2O15040 1411 aa31.92■■■□□ 2.7
CDIPT-210ENST00000570016 MST1RQ04912 1400 aa31.91■■■□□ 2.7
CDIPT-210ENST00000570016 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa31.91■■■□□ 2.7
CDIPT-210ENST00000570016 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP31.88■■■□□ 2.69
CDIPT-210ENST00000570016 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP31.87■■■□□ 2.69
CDIPT-210ENST00000570016 PHLPP1O60346 1717 aa31.87■■■□□ 2.69
CDIPT-210ENST00000570016 ABCC11Q96J66 1382 aa31.86■■■□□ 2.69
CDIPT-210ENST00000570016 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP31.86■■■□□ 2.69
CDIPT-210ENST00000570016 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP31.85■■■□□ 2.69
CDIPT-210ENST00000570016 BRINP3Q76B58 766 aa31.85■■■□□ 2.69
CDIPT-210ENST00000570016 LAMC1P11047 1609 aa31.85■■■□□ 2.69
CDIPT-210ENST00000570016 KNDC1Q76NI1 1749 aa31.84■■■□□ 2.69
CDIPT-210ENST00000570016 ILDR2Q71H61 639 aa31.83■■■□□ 2.69
CDIPT-210ENST00000570016 STAC3Q96MF2 364 aa31.82■■■□□ 2.68
CDIPT-210ENST00000570016 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP31.8■■■□□ 2.68
CDIPT-210ENST00000570016 TMEM132EQ6IEE7 984 aa31.79■■■□□ 2.68
CDIPT-210ENST00000570016 JCADQ9P266 1359 aa31.77■■■□□ 2.68
CDIPT-210ENST00000570016 SIRT1Q96EB6 747 aa31.77■■■□□ 2.68
CDIPT-210ENST00000570016 C1orf167Q5SNV9 1468 aa31.77■■■□□ 2.68
CDIPT-210ENST00000570016 CFAP70Q5T0N1 1121 aa31.76■■■□□ 2.68
CDIPT-210ENST00000570016 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa31.76■■■□□ 2.67
CDIPT-210ENST00000570016 NHSL1Q5SYE7 1610 aa31.75■■■□□ 2.67
CDIPT-210ENST00000570016 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP31.75■■■□□ 2.67
CDIPT-210ENST00000570016 STK26Q9P289 416 aa31.74■■■□□ 2.67
CDIPT-210ENST00000570016 DCAF11Q8TEB1 546 aa31.71■■■□□ 2.67
CDIPT-210ENST00000570016 ADGRB1O14514 1584 aa31.7■■■□□ 2.67
CDIPT-210ENST00000570016 WAPLQ7Z5K2 1190 aa31.7■■■□□ 2.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.5 ms