RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568209.5

UBE2I-217, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 I, humanhuman

TSL 5

Gene UBE2I, Length 266 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2I-217ENST00000568209 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
UBE2I-217ENST00000568209 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
UBE2I-217ENST00000568209 LRRC7Q96NW7 1537 aa25.45■■□□□ 1.66
UBE2I-217ENST00000568209 PIK3C2BO00750 1634 aa25.44■■□□□ 1.66
UBE2I-217ENST00000568209 TXNDC2Q86VQ3 553 aa25.43■■□□□ 1.66
UBE2I-217ENST00000568209 STAG3Q9UJ98 1225 aa25.43■■□□□ 1.66
UBE2I-217ENST00000568209 ALKQ9UM73 1620 aa25.43■■□□□ 1.66
UBE2I-217ENST00000568209 CLTCL1P53675 1640 aa25.41■■□□□ 1.66
UBE2I-217ENST00000568209 EID1Q9Y6B2 187 aa25.41■■□□□ 1.66
UBE2I-217ENST00000568209 SLIT1O75093 1534 aa25.41■■□□□ 1.66
UBE2I-217ENST00000568209 LTKP29376 864 aa25.4■■□□□ 1.66
UBE2I-217ENST00000568209 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
UBE2I-217ENST00000568209 ARHGAP23Q9P227 1491 aa25.39■■□□□ 1.65
UBE2I-217ENST00000568209 CCDC144AA2RUR9 1427 aa25.37■■□□□ 1.65
UBE2I-217ENST00000568209 IDI1Q13907 227 aa25.36■■□□□ 1.65
UBE2I-217ENST00000568209 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
UBE2I-217ENST00000568209 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
UBE2I-217ENST00000568209 SLC52A1Q9NWF4 448 aa25.35■■□□□ 1.65
UBE2I-217ENST00000568209 CLSPNQ9HAW4 1339 aa25.34■■□□□ 1.65
UBE2I-217ENST00000568209 SIN3AQ96ST3 1273 aa25.33■■□□□ 1.65
UBE2I-217ENST00000568209 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
UBE2I-217ENST00000568209 TMEM2Q9UHN6 1383 aa25.32■■□□□ 1.64
UBE2I-217ENST00000568209 ADGRB3O60242 1522 aa25.29■■□□□ 1.64
UBE2I-217ENST00000568209 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa25.29■■□□□ 1.64
UBE2I-217ENST00000568209 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa25.28■■□□□ 1.64
UBE2I-217ENST00000568209 BCANQ96GW7 911 aa25.24■■□□□ 1.63
UBE2I-217ENST00000568209 MYO5BQ9ULV0 1848 aa25.23■■□□□ 1.63
UBE2I-217ENST00000568209 NEUROD1Q13562 356 aa25.23■■□□□ 1.63
UBE2I-217ENST00000568209 SLC26A8Q96RN1 970 aa25.23■■□□□ 1.63
UBE2I-217ENST00000568209 KIF1BO60333 1816 aa25.23■■□□□ 1.63
UBE2I-217ENST00000568209 CHGAP10645 457 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
UBE2I-217ENST00000568209 TMEM94Q12767 1356 aa25.18■■□□□ 1.62
UBE2I-217ENST00000568209 KCNA6P17658 529 aa25.18■■□□□ 1.62
UBE2I-217ENST00000568209 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
UBE2I-217ENST00000568209 RGL3Q3MIN7 710 aa25.16■■□□□ 1.62
UBE2I-217ENST00000568209 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
UBE2I-217ENST00000568209 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa25.14■■□□□ 1.62
UBE2I-217ENST00000568209 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa25.13■■□□□ 1.61
UBE2I-217ENST00000568209 ZFYVE9O95405 1425 aa25.13■■□□□ 1.61
UBE2I-217ENST00000568209 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
UBE2I-217ENST00000568209 NWD1Q149M9 1564 aa25.11■■□□□ 1.61
UBE2I-217ENST00000568209 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
UBE2I-217ENST00000568209 IFT172Q9UG01 1749 aa25.11■■□□□ 1.61
UBE2I-217ENST00000568209 FAM135BQ49AJ0 1406 aa25.11■■□□□ 1.61
UBE2I-217ENST00000568209 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
UBE2I-217ENST00000568209 L3MBTL2Q969R5 705 aa25.1■■□□□ 1.61
UBE2I-217ENST00000568209 RIMS2Q9UQ26 1411 aa25.1■■□□□ 1.61
UBE2I-217ENST00000568209 TONSLQ96HA7 1378 aa25.09■■□□□ 1.61
UBE2I-217ENST00000568209 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa25.09■■□□□ 1.61
UBE2I-217ENST00000568209 PPLO60437 1756 aa25.08■■□□□ 1.61
UBE2I-217ENST00000568209 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
UBE2I-217ENST00000568209 HDGFP51858 240 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
UBE2I-217ENST00000568209 MSH6P52701 1360 aa25.06■■□□□ 1.6
UBE2I-217ENST00000568209 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa25.05■■□□□ 1.6
UBE2I-217ENST00000568209 MYOM2P54296 1465 aa25.04■■□□□ 1.6
UBE2I-217ENST00000568209 DCAF11Q8TEB1 546 aa25.04■■□□□ 1.6
UBE2I-217ENST00000568209 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa25.04■■□□□ 1.6
UBE2I-217ENST00000568209 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
UBE2I-217ENST00000568209 PHLPP1O60346 1717 aa25.02■■□□□ 1.6
UBE2I-217ENST00000568209 NRXN1Q9ULB1 1477 aa25.02■■□□□ 1.6
UBE2I-217ENST00000568209 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa25.01■■□□□ 1.59
UBE2I-217ENST00000568209 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP25■■□□□ 1.59
UBE2I-217ENST00000568209 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
UBE2I-217ENST00000568209 C14orf37Q86TY3 774 aa24.99■■□□□ 1.59
UBE2I-217ENST00000568209 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa24.99■■□□□ 1.59
UBE2I-217ENST00000568209 VGFO15240 615 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
UBE2I-217ENST00000568209 STAC3Q96MF2 364 aa24.97■■□□□ 1.59
UBE2I-217ENST00000568209 SLAIN2Q9P270 581 aa24.97■■□□□ 1.59
UBE2I-217ENST00000568209 PIK3C2GO75747 1445 aa24.95■■□□□ 1.59
UBE2I-217ENST00000568209 PRAG1Q86YV5 1406 aa24.95■■□□□ 1.59
UBE2I-217ENST00000568209 TBX22Q9Y458 520 aa24.94■■□□□ 1.58
UBE2I-217ENST00000568209 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa24.94■■□□□ 1.58
UBE2I-217ENST00000568209 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa24.93■■□□□ 1.58
UBE2I-217ENST00000568209 DIP2AQ14689 1571 aa24.93■■□□□ 1.58
UBE2I-217ENST00000568209 NBPF8Q3BBV2 869 aa24.92■■□□□ 1.58
UBE2I-217ENST00000568209 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
UBE2I-217ENST00000568209 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa24.9■■□□□ 1.58
UBE2I-217ENST00000568209 POTEAQ6S8J7 498 aa24.88■■□□□ 1.57
UBE2I-217ENST00000568209 JCADQ9P266 1359 aa24.88■■□□□ 1.57
UBE2I-217ENST00000568209 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa24.86■■□□□ 1.57
UBE2I-217ENST00000568209 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
UBE2I-217ENST00000568209 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
UBE2I-217ENST00000568209 ATF3P18847 181 aa24.85■■□□□ 1.57
UBE2I-217ENST00000568209 PIK3R4Q99570 1358 aa24.84■■□□□ 1.57
UBE2I-217ENST00000568209 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa24.84■■□□□ 1.57
UBE2I-217ENST00000568209 CFAP70Q5T0N1 1121 aa24.84■■□□□ 1.57
UBE2I-217ENST00000568209 CADPS2Q86UW7 1296 aa24.84■■□□□ 1.57
UBE2I-217ENST00000568209 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
UBE2I-217ENST00000568209 LAMC1P11047 1609 aa24.83■■□□□ 1.56
UBE2I-217ENST00000568209 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa24.82■■□□□ 1.56
UBE2I-217ENST00000568209 C19orf44Q9H6X5 657 aa24.82■■□□□ 1.56
UBE2I-217ENST00000568209 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa24.82■■□□□ 1.56
UBE2I-217ENST00000568209 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa24.82■■□□□ 1.56
UBE2I-217ENST00000568209 RALGAPBQ86X10 1494 aa24.81■■□□□ 1.56
UBE2I-217ENST00000568209 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
UBE2I-217ENST00000568209 ADGRB1O14514 1584 aa24.8■■□□□ 1.56
UBE2I-217ENST00000568209 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
UBE2I-217ENST00000568209 METP08581 1390 aa24.79■■□□□ 1.56
UBE2I-217ENST00000568209 NBPF1Q3BBV0 1214 aa24.78■■□□□ 1.56
UBE2I-217ENST00000568209 PTPRUQ92729 1446 aa24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.3 ms