RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565787.1

CHTF18-216, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

TSL 5

Gene CHTF18, Length 607 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-216ENST00000565787 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa35.49■■■■□ 3.27
CHTF18-216ENST00000565787 HDGFP51858 240 aaKnown RBP35.48■■■■□ 3.27
CHTF18-216ENST00000565787 UBAP1LF5GYI3 381 aa35.46■■■■□ 3.27
CHTF18-216ENST00000565787 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP35.46■■■■□ 3.27
CHTF18-216ENST00000565787 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP35.45■■■■□ 3.27
CHTF18-216ENST00000565787 SLC26A8Q96RN1 970 aa35.45■■■■□ 3.27
CHTF18-216ENST00000565787 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP35.44■■■■□ 3.26
CHTF18-216ENST00000565787 KIF1BO60333 1816 aa35.43■■■■□ 3.26
CHTF18-216ENST00000565787 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP35.41■■■■□ 3.26
CHTF18-216ENST00000565787 SETD5Q9C0A6 1442 aa35.4■■■■□ 3.26
CHTF18-216ENST00000565787 BCANQ96GW7 911 aa35.39■■■■□ 3.26
CHTF18-216ENST00000565787 NWD1Q149M9 1564 aa35.38■■■■□ 3.25
CHTF18-216ENST00000565787 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP35.38■■■■□ 3.25
CHTF18-216ENST00000565787 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP35.37■■■■□ 3.25
CHTF18-216ENST00000565787 KCNA6P17658 529 aa35.36■■■■□ 3.25
CHTF18-216ENST00000565787 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP35.36■■■■□ 3.25
CHTF18-216ENST00000565787 ALKQ9UM73 1620 aa35.35■■■■□ 3.25
CHTF18-216ENST00000565787 DIP2AQ14689 1571 aa35.34■■■■□ 3.25
CHTF18-216ENST00000565787 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa35.33■■■■□ 3.25
CHTF18-216ENST00000565787 TOM1O60784 492 aa35.31■■■■□ 3.24
CHTF18-216ENST00000565787 MPHOSPH9Q99550 1183 aa35.31■■■■□ 3.24
CHTF18-216ENST00000565787 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa35.31■■■■□ 3.24
CHTF18-216ENST00000565787 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP35.31■■■■□ 3.24
CHTF18-216ENST00000565787 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP35.3■■■■□ 3.24
CHTF18-216ENST00000565787 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP35.3■■■■□ 3.24
CHTF18-216ENST00000565787 TBX22Q9Y458 520 aa35.3■■■■□ 3.24
CHTF18-216ENST00000565787 FOXD1Q16676 465 aa35.29■■■■□ 3.24
CHTF18-216ENST00000565787 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa35.28■■■■□ 3.24
CHTF18-216ENST00000565787 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa35.27■■■■□ 3.24
CHTF18-216ENST00000565787 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa35.25■■■■□ 3.23
CHTF18-216ENST00000565787 TMEM94Q12767 1356 aa35.24■■■■□ 3.23
CHTF18-216ENST00000565787 PIP4K2BP78356 416 aa35.21■■■■□ 3.23
CHTF18-216ENST00000565787 PIK3R4Q99570 1358 aa35.21■■■■□ 3.23
CHTF18-216ENST00000565787 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP35.2■■■■□ 3.23
CHTF18-216ENST00000565787 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP35.19■■■■□ 3.22
CHTF18-216ENST00000565787 PPLO60437 1756 aa35.18■■■■□ 3.22
CHTF18-216ENST00000565787 CCDC144AA2RUR9 1427 aa35.17■■■■□ 3.22
CHTF18-216ENST00000565787 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP35.13■■■■□ 3.21
CHTF18-216ENST00000565787 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa35.12■■■■□ 3.21
CHTF18-216ENST00000565787 PTPRUQ92729 1446 aa35.12■■■■□ 3.21
CHTF18-216ENST00000565787 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP35.1■■■■□ 3.21
CHTF18-216ENST00000565787 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa35.09■■■■□ 3.21
CHTF18-216ENST00000565787 VGFO15240 615 aaPredicted RBP35.07■■■■□ 3.2
CHTF18-216ENST00000565787 HSPA1LP34931 641 aa35.07■■■■□ 3.2
CHTF18-216ENST00000565787 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP35.06■■■■□ 3.2
CHTF18-216ENST00000565787 HRCP23327 699 aa35.06■■■■□ 3.2
CHTF18-216ENST00000565787 IFT172Q9UG01 1749 aa35.06■■■■□ 3.2
CHTF18-216ENST00000565787 METP08581 1390 aa35.05■■■■□ 3.2
CHTF18-216ENST00000565787 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa35.05■■■■□ 3.2
CHTF18-216ENST00000565787 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa35.05■■■■□ 3.2
CHTF18-216ENST00000565787 MSH6P52701 1360 aa35.02■■■■□ 3.2
CHTF18-216ENST00000565787 RGL3Q3MIN7 710 aa34.97■■■■□ 3.19
CHTF18-216ENST00000565787 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP34.95■■■■□ 3.19
CHTF18-216ENST00000565787 FAM135BQ49AJ0 1406 aa34.95■■■■□ 3.19
CHTF18-216ENST00000565787 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa34.93■■■■□ 3.18
CHTF18-216ENST00000565787 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa34.93■■■■□ 3.18
CHTF18-216ENST00000565787 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa34.91■■■■□ 3.18
CHTF18-216ENST00000565787 C14orf37Q86TY3 774 aa34.9■■■■□ 3.18
CHTF18-216ENST00000565787 C19orf44Q9H6X5 657 aa34.87■■■■□ 3.17
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CHTF18-216ENST00000565787 PRAG1Q86YV5 1406 aa34.85■■■■□ 3.17
CHTF18-216ENST00000565787 PIK3C2GO75747 1445 aa34.83■■■■□ 3.17
CHTF18-216ENST00000565787 PTCH1Q13635 1447 aa34.83■■■■□ 3.17
CHTF18-216ENST00000565787 DCCP43146 1447 aa34.82■■■■□ 3.17
CHTF18-216ENST00000565787 NALCNQ8IZF0 1738 aa34.81■■■■□ 3.16
CHTF18-216ENST00000565787 CADPS2Q86UW7 1296 aa34.81■■■■□ 3.16
CHTF18-216ENST00000565787 DISP3Q9P2K9 1392 aa34.81■■■■□ 3.16
CHTF18-216ENST00000565787 MYOM2P54296 1465 aa34.79■■■■□ 3.16
CHTF18-216ENST00000565787 ATF3P18847 181 aa34.79■■■■□ 3.16
CHTF18-216ENST00000565787 NRXN1Q9ULB1 1477 aa34.78■■■■□ 3.16
CHTF18-216ENST00000565787 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa34.78■■■■□ 3.16
CHTF18-216ENST00000565787 ROBO2Q9HCK4 1378 aa34.77■■■■□ 3.16
CHTF18-216ENST00000565787 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa34.76■■■■□ 3.16
CHTF18-216ENST00000565787 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP34.74■■■■□ 3.15
CHTF18-216ENST00000565787 PHLPP1O60346 1717 aa34.72■■■■□ 3.15
CHTF18-216ENST00000565787 LAMC1P11047 1609 aa34.72■■■■□ 3.15
CHTF18-216ENST00000565787 KNDC1Q76NI1 1749 aa34.71■■■■□ 3.15
CHTF18-216ENST00000565787 MST1RQ04912 1400 aa34.69■■■■□ 3.14
CHTF18-216ENST00000565787 TECPR2O15040 1411 aa34.68■■■■□ 3.14
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CHTF18-216ENST00000565787 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP34.64■■■■□ 3.14
CHTF18-216ENST00000565787 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP34.64■■■■□ 3.14
CHTF18-216ENST00000565787 TMEM132EQ6IEE7 984 aa34.64■■■■□ 3.14
CHTF18-216ENST00000565787 ABCC11Q96J66 1382 aa34.62■■■■□ 3.13
CHTF18-216ENST00000565787 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP34.62■■■■□ 3.13
CHTF18-216ENST00000565787 BRINP3Q76B58 766 aa34.61■■■■□ 3.13
CHTF18-216ENST00000565787 STK26Q9P289 416 aa34.61■■■■□ 3.13
CHTF18-216ENST00000565787 CFAP70Q5T0N1 1121 aa34.6■■■■□ 3.13
CHTF18-216ENST00000565787 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP34.59■■■■□ 3.13
CHTF18-216ENST00000565787 DCAF11Q8TEB1 546 aa34.57■■■■□ 3.12
CHTF18-216ENST00000565787 NHSL1Q5SYE7 1610 aa34.55■■■■□ 3.12
CHTF18-216ENST00000565787 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa34.55■■■■□ 3.12
CHTF18-216ENST00000565787 STAC3Q96MF2 364 aa34.54■■■■□ 3.12
CHTF18-216ENST00000565787 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa34.54■■■■□ 3.12
CHTF18-216ENST00000565787 C1orf167Q5SNV9 1468 aa34.53■■■■□ 3.12
CHTF18-216ENST00000565787 WAPLQ7Z5K2 1190 aa34.53■■■■□ 3.12
CHTF18-216ENST00000565787 ADGRB1O14514 1584 aa34.52■■■■□ 3.12
CHTF18-216ENST00000565787 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa34.51■■■■□ 3.12
CHTF18-216ENST00000565787 ILDR2Q71H61 639 aa34.51■■■■□ 3.12
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