RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557667.5

RBM23-233, Transcript of RNA binding motif protein 23, human

TSL 1 (best)

Gene RBM23, Length 4,240 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM23-233	ENST00000557667	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		11.51	□□□□□ -0.57
RBM23-233	ENST00000557667	IQGAP1	P46940	1657 aa		11.51	□□□□□ -0.57
RBM23-233	ENST00000557667	DIP2B	Q9P265	1576 aa		11.51	□□□□□ -0.57
RBM23-233	ENST00000557667	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		11.51	□□□□□ -0.57
RBM23-233	ENST00000557667	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		11.51	□□□□□ -0.57
RBM23-233	ENST00000557667	PLA2R1	Q13018	1463 aa		11.5	□□□□□ -0.57
RBM23-233	ENST00000557667	CLTCL1	P53675	1640 aa		11.5	□□□□□ -0.57
RBM23-233	ENST00000557667	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	11.5	□□□□□ -0.57
RBM23-233	ENST00000557667	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		11.49	□□□□□ -0.57
RBM23-233	ENST00000557667	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
RBM23-233	ENST00000557667	PDE3B	Q13370	1112 aa		11.49	□□□□□ -0.57
RBM23-233	ENST00000557667	IFT172	Q9UG01	1749 aa		11.49	□□□□□ -0.57
RBM23-233	ENST00000557667	ABCA6	Q8N139	1617 aa		11.48	□□□□□ -0.57
RBM23-233	ENST00000557667	NOS1	P29475	1434 aa		11.48	□□□□□ -0.57
RBM23-233	ENST00000557667	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	11.48	□□□□□ -0.57
RBM23-233	ENST00000557667	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	11.48	□□□□□ -0.57
RBM23-233	ENST00000557667	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	11.47	□□□□□ -0.57
RBM23-233	ENST00000557667	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	11.47	□□□□□ -0.57
RBM23-233	ENST00000557667	AFAP1	Q8N556	730 aa		11.46	□□□□□ -0.57
RBM23-233	ENST00000557667	BCAN	Q96GW7	911 aa		11.46	□□□□□ -0.57
RBM23-233	ENST00000557667	NSD2	O96028	1365 aa		11.46	□□□□□ -0.58
RBM23-233	ENST00000557667	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		11.46	□□□□□ -0.58
RBM23-233	ENST00000557667	PIK3C2B	O00750	1634 aa		11.46	□□□□□ -0.58
RBM23-233	ENST00000557667	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		11.45	□□□□□ -0.58
RBM23-233	ENST00000557667	FOXD1	Q16676	465 aa		11.45	□□□□□ -0.58
RBM23-233	ENST00000557667	NLRP13	Q86W25	1043 aa		11.44	□□□□□ -0.58
RBM23-233	ENST00000557667	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	11.44	□□□□□ -0.58
RBM23-233	ENST00000557667	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		11.44	□□□□□ -0.58
RBM23-233	ENST00000557667	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	11.43	□□□□□ -0.58
RBM23-233	ENST00000557667	GTF3C3	Q9Y5Q9	886 aa		11.43	□□□□□ -0.58
RBM23-233	ENST00000557667	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	11.43	□□□□□ -0.58
RBM23-233	ENST00000557667	MRS2	Q9HD23	443 aa		11.42	□□□□□ -0.58
RBM23-233	ENST00000557667	PPL	O60437	1756 aa		11.42	□□□□□ -0.58
RBM23-233	ENST00000557667	HOMEZ	Q8IX15	550 aa		11.42	□□□□□ -0.58
RBM23-233	ENST00000557667	MROH2A	A6NES4	1674 aa		11.42	□□□□□ -0.58
RBM23-233	ENST00000557667	USP32	Q8NFA0	1604 aa		11.41	□□□□□ -0.58
RBM23-233	ENST00000557667	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		11.41	□□□□□ -0.58
RBM23-233	ENST00000557667	TMC1	Q8TDI8	760 aa		11.4	□□□□□ -0.58
RBM23-233	ENST00000557667	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		11.4	□□□□□ -0.58
RBM23-233	ENST00000557667	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	11.4	□□□□□ -0.59
RBM23-233	ENST00000557667	NPAT	Q14207	1427 aa		11.39	□□□□□ -0.59
RBM23-233	ENST00000557667	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		11.39	□□□□□ -0.59
RBM23-233	ENST00000557667	DLC1	Q96QB1	1528 aa		11.39	□□□□□ -0.59
RBM23-233	ENST00000557667	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		11.38	□□□□□ -0.59
RBM23-233	ENST00000557667	PIK3C2G	O75747	1445 aa		11.38	□□□□□ -0.59
RBM23-233	ENST00000557667	ST20-MTHFS	A0A0A6YYL1	179 aa		11.38	□□□□□ -0.59
RBM23-233	ENST00000557667	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		11.38	□□□□□ -0.59
RBM23-233	ENST00000557667	SIRT1	Q96EB6	747 aa		11.38	□□□□□ -0.59
RBM23-233	ENST00000557667	PNN	Q9H307	717 aa	Known RBP	11.38	□□□□□ -0.59
RBM23-233	ENST00000557667	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	11.38	□□□□□ -0.59
RBM23-233	ENST00000557667	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		11.38	□□□□□ -0.59
RBM23-233	ENST00000557667	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		11.37	□□□□□ -0.59
RBM23-233	ENST00000557667	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		11.37	□□□□□ -0.59
RBM23-233	ENST00000557667	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	11.37	□□□□□ -0.59
RBM23-233	ENST00000557667	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		11.36	□□□□□ -0.59
RBM23-233	ENST00000557667	EVC2	Q86UK5	1308 aa		11.36	□□□□□ -0.59
RBM23-233	ENST00000557667	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
RBM23-233	ENST00000557667	ATAD2	Q6PL18	1390 aa		11.36	□□□□□ -0.59
RBM23-233	ENST00000557667	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
RBM23-233	ENST00000557667	ERVK-7	P63135	1459 aa		11.36	□□□□□ -0.59
RBM23-233	ENST00000557667	RGL3	Q3MIN7	710 aa		11.35	□□□□□ -0.59
RBM23-233	ENST00000557667	NLRP1	Q9C000	1473 aa		11.34	□□□□□ -0.59
RBM23-233	ENST00000557667	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	11.34	□□□□□ -0.59
RBM23-233	ENST00000557667	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
RBM23-233	ENST00000557667	CFAP53	Q96M91	514 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RBM23-233	ENST00000557667	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RBM23-233	ENST00000557667	GGT6	Q6P531	493 aa		11.31	□□□□□ -0.6
RBM23-233	ENST00000557667	TESK2	Q96S53	571 aa		11.31	□□□□□ -0.6
RBM23-233	ENST00000557667	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		11.31	□□□□□ -0.6
RBM23-233	ENST00000557667	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
RBM23-233	ENST00000557667	MED14	O60244	1454 aa		11.31	□□□□□ -0.6
RBM23-233	ENST00000557667	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RBM23-233	ENST00000557667	DIP2A	Q14689	1571 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RBM23-233	ENST00000557667	AAMP	Q13685	434 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RBM23-233	ENST00000557667	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	11.3	□□□□□ -0.6
RBM23-233	ENST00000557667	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RBM23-233	ENST00000557667	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RBM23-233	ENST00000557667	NUDC	Q9Y266	331 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RBM23-233	ENST00000557667	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
RBM23-233	ENST00000557667	QRICH2	Q9H0J4	1663 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RBM23-233	ENST00000557667	BLM	P54132	1417 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
RBM23-233	ENST00000557667	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RBM23-233	ENST00000557667	KLHL34	Q8N239	644 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RBM23-233	ENST00000557667	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		11.27	□□□□□ -0.6
RBM23-233	ENST00000557667	ADGRB1	O14514	1584 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RBM23-233	ENST00000557667	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RBM23-233	ENST00000557667	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
RBM23-233	ENST00000557667	PPP4R2	Q9NY27	417 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RBM23-233	ENST00000557667	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
RBM23-233	ENST00000557667	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RBM23-233	ENST00000557667	ANKRD36B	Q8N2N9	1353 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RBM23-233	ENST00000557667	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
RBM23-233	ENST00000557667	HDGFL2	Q7Z4V5	671 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
RBM23-233	ENST00000557667	POLR3A	O14802	1390 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
RBM23-233	ENST00000557667	PANK3	Q9H999	370 aa		11.24	□□□□□ -0.61
RBM23-233	ENST00000557667	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		11.24	□□□□□ -0.61
RBM23-233	ENST00000557667	PLCB2	Q00722	1185 aa		11.24	□□□□□ -0.61
RBM23-233	ENST00000557667	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
RBM23-233	ENST00000557667	TNR	Q92752	1358 aa		11.24	□□□□□ -0.61
RBM23-233	ENST00000557667	ATP7B	P35670	1465 aa		11.23	□□□□□ -0.61

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