RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557569.1

CKB-217, Transcript of creatine kinase B, humanhuman

TSL 2

Gene CKB, Length 579 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKB-217ENST00000557569 ADGRL2O95490 1459 aa41.11■■■■■ 4.17
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CKB-217ENST00000557569 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP41.02■■■■■ 4.16
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CKB-217ENST00000557569 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa41■■■■■ 4.15
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CKB-217ENST00000557569 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP40.82■■■■■ 4.13
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CKB-217ENST00000557569 LRP6O75581 1613 aa40.79■■■■■ 4.12
CKB-217ENST00000557569 UNC13BO14795 1591 aa40.78■■■■■ 4.12
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CKB-217ENST00000557569 C19orf44Q9H6X5 657 aa40.7■■■■■ 4.11
CKB-217ENST00000557569 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP40.7■■■■■ 4.11
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CKB-217ENST00000557569 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa40.69■■■■■ 4.11
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CKB-217ENST00000557569 BRINP3Q76B58 766 aa40.59■■■■■ 4.09
CKB-217ENST00000557569 TRPM2O94759 1503 aa40.58■■■■■ 4.09
CKB-217ENST00000557569 SHPRHQ149N8 1683 aa40.57■■■■■ 4.09
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CKB-217ENST00000557569 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP40.52■■■■■ 4.08
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CKB-217ENST00000557569 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP40.32■■■■■ 4.05
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CKB-217ENST00000557569 C8orf37Q96NL8 207 aa40.21■■■■■ 4.03
CKB-217ENST00000557569 NALCNQ8IZF0 1738 aa40.2■■■■■ 4.03
CKB-217ENST00000557569 CLTCL1P53675 1640 aa40.2■■■■■ 4.03
CKB-217ENST00000557569 RGS12O14924 1447 aa40.18■■■■■ 4.02
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CKB-217ENST00000557569 VGFO15240 615 aaPredicted RBP39.95■■■■□ 3.99
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CKB-217ENST00000557569 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP39.85■■■■□ 3.97
CKB-217ENST00000557569 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa39.85■■■■□ 3.97
CKB-217ENST00000557569 ATAD2Q6PL18 1390 aa39.84■■■■□ 3.97
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