RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546585.1

CS-203, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 1,803 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-203ENST00000546585 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
CS-203ENST00000546585 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-203ENST00000546585 TESK2Q96S53 571 aa9.71□□□□□ -0.85
CS-203ENST00000546585 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
CS-203ENST00000546585 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa9.7□□□□□ -0.86
CS-203ENST00000546585 CCER2I3L3R5 266 aa9.7□□□□□ -0.86
CS-203ENST00000546585 CARD11Q9BXL7 1154 aa9.7□□□□□ -0.86
CS-203ENST00000546585 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
CS-203ENST00000546585 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa9.7□□□□□ -0.86
CS-203ENST00000546585 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa9.69□□□□□ -0.86
CS-203ENST00000546585 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa9.69□□□□□ -0.86
CS-203ENST00000546585 MYO3AQ8NEV4 1616 aa9.69□□□□□ -0.86
CS-203ENST00000546585 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
CS-203ENST00000546585 ADGRB1O14514 1584 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-203ENST00000546585 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-203ENST00000546585 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
CS-203ENST00000546585 STAC3Q96MF2 364 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-203ENST00000546585 MYOM1P52179 1685 aa9.67□□□□□ -0.86
CS-203ENST00000546585 DISP3Q9P2K9 1392 aa9.67□□□□□ -0.86
CS-203ENST00000546585 PIK3C2GO75747 1445 aa9.67□□□□□ -0.86
CS-203ENST00000546585 ERVK-7P63135 1459 aa9.67□□□□□ -0.86
CS-203ENST00000546585 C3P01024 1663 aa9.67□□□□□ -0.86
CS-203ENST00000546585 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
CS-203ENST00000546585 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa9.67□□□□□ -0.86
CS-203ENST00000546585 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
CS-203ENST00000546585 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
CS-203ENST00000546585 CCDC184Q52MB2 194 aa9.66□□□□□ -0.86
CS-203ENST00000546585 ANP32CO43423 234 aa9.65□□□□□ -0.86
CS-203ENST00000546585 ADAMTSL3P82987 1691 aa9.65□□□□□ -0.87
CS-203ENST00000546585 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-203ENST00000546585 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
CS-203ENST00000546585 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
CS-203ENST00000546585 SLC52A1Q9NWF4 448 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-203ENST00000546585 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-203ENST00000546585 MLECQ14165 292 aa9.63□□□□□ -0.87
CS-203ENST00000546585 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
CS-203ENST00000546585 ZMYM3Q14202 1370 aa9.63□□□□□ -0.87
CS-203ENST00000546585 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
CS-203ENST00000546585 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
CS-203ENST00000546585 ZFYVE9O95405 1425 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-203ENST00000546585 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
CS-203ENST00000546585 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
CS-203ENST00000546585 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
CS-203ENST00000546585 IDI1Q13907 227 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-203ENST00000546585 CFAP70Q5T0N1 1121 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-203ENST00000546585 UBR1Q8IWV7 1749 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-203ENST00000546585 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa9.6□□□□□ -0.87
CS-203ENST00000546585 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
CS-203ENST00000546585 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa9.59□□□□□ -0.87
CS-203ENST00000546585 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
CS-203ENST00000546585 QRICH2Q9H0J4 1663 aa9.59□□□□□ -0.87
CS-203ENST00000546585 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa9.58□□□□□ -0.88
CS-203ENST00000546585 A2ML1A8K2U0 1454 aa9.58□□□□□ -0.88
CS-203ENST00000546585 NLRP1Q9C000 1473 aa9.57□□□□□ -0.88
CS-203ENST00000546585 PARD3Q8TEW0 1356 aa9.57□□□□□ -0.88
CS-203ENST00000546585 TNRQ92752 1358 aa9.57□□□□□ -0.88
CS-203ENST00000546585 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
CS-203ENST00000546585 PTPRMP28827 1452 aa9.56□□□□□ -0.88
CS-203ENST00000546585 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa9.56□□□□□ -0.88
CS-203ENST00000546585 CHGAP10645 457 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
CS-203ENST00000546585 TULP4Q9NRJ4 1543 aa9.54□□□□□ -0.88
CS-203ENST00000546585 ALKQ9UM73 1620 aa9.54□□□□□ -0.88
CS-203ENST00000546585 VGFO15240 615 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
CS-203ENST00000546585 TMF1P82094 1093 aa9.54□□□□□ -0.88
CS-203ENST00000546585 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa9.54□□□□□ -0.88
CS-203ENST00000546585 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
CS-203ENST00000546585 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
CS-203ENST00000546585 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
CS-203ENST00000546585 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.88
CS-203ENST00000546585 STAG3Q9UJ98 1225 aa9.52□□□□□ -0.89
CS-203ENST00000546585 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
CS-203ENST00000546585 SLIT1O75093 1534 aa9.51□□□□□ -0.89
CS-203ENST00000546585 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
CS-203ENST00000546585 TMEM132EQ6IEE7 984 aa9.51□□□□□ -0.89
CS-203ENST00000546585 POLR3GLQ9BT43 218 aa9.51□□□□□ -0.89
CS-203ENST00000546585 PANK3Q9H999 370 aa9.51□□□□□ -0.89
CS-203ENST00000546585 RIMS2Q9UQ26 1411 aa9.51□□□□□ -0.89
CS-203ENST00000546585 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
CS-203ENST00000546585 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
CS-203ENST00000546585 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
CS-203ENST00000546585 MRS2Q9HD23 443 aa9.49□□□□□ -0.89
CS-203ENST00000546585 USP32Q8NFA0 1604 aa9.49□□□□□ -0.89
CS-203ENST00000546585 ARHGAP23Q9P227 1491 aa9.49□□□□□ -0.89
CS-203ENST00000546585 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
CS-203ENST00000546585 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
CS-203ENST00000546585 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa9.49□□□□□ -0.89
CS-203ENST00000546585 RALBP1Q15311 655 aa9.49□□□□□ -0.89
CS-203ENST00000546585 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP9.49□□□□□ -0.89
CS-203ENST00000546585 KNDC1Q76NI1 1749 aa9.49□□□□□ -0.89
CS-203ENST00000546585 DLC1Q96QB1 1528 aa9.49□□□□□ -0.89
CS-203ENST00000546585 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
CS-203ENST00000546585 TMEM2Q9UHN6 1383 aa9.48□□□□□ -0.89
CS-203ENST00000546585 HDGFP51858 240 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
CS-203ENST00000546585 MYT1Q01538 1121 aa9.48□□□□□ -0.89
CS-203ENST00000546585 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
CS-203ENST00000546585 TRAK1Q9UPV9 953 aa9.47□□□□□ -0.89
CS-203ENST00000546585 CARD14Q9BXL6 1004 aa9.47□□□□□ -0.89
CS-203ENST00000546585 MED14O60244 1454 aa9.46□□□□□ -0.9
CS-203ENST00000546585 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP9.45□□□□□ -0.9
CS-203ENST00000546585 CDCA8Q53HL2 280 aa9.45□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.2 ms