RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539477.5

MLH1-222, Transcript of mutL homolog 1, human

TSL 2 BASIC

Gene MLH1, Length 2,366 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MLH1-222	ENST00000539477	HRC	P23327	699 aa		13.64	□□□□□ -0.23
MLH1-222	ENST00000539477	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		13.64	□□□□□ -0.23
MLH1-222	ENST00000539477	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		13.64	□□□□□ -0.23
MLH1-222	ENST00000539477	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		13.64	□□□□□ -0.23
MLH1-222	ENST00000539477	IFT172	Q9UG01	1749 aa		13.63	□□□□□ -0.23
MLH1-222	ENST00000539477	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		13.63	□□□□□ -0.23
MLH1-222	ENST00000539477	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		13.63	□□□□□ -0.23
MLH1-222	ENST00000539477	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		13.62	□□□□□ -0.23
MLH1-222	ENST00000539477	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
MLH1-222	ENST00000539477	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		13.61	□□□□□ -0.23
MLH1-222	ENST00000539477	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
MLH1-222	ENST00000539477	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		13.61	□□□□□ -0.23
MLH1-222	ENST00000539477	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		13.61	□□□□□ -0.23
MLH1-222	ENST00000539477	BCAN	Q96GW7	911 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MLH1-222	ENST00000539477	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
MLH1-222	ENST00000539477	NEUROD1	Q13562	356 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MLH1-222	ENST00000539477	EID1	Q9Y6B2	187 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MLH1-222	ENST00000539477	MED14	O60244	1454 aa		13.57	□□□□□ -0.24
MLH1-222	ENST00000539477	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MLH1-222	ENST00000539477	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
MLH1-222	ENST00000539477	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
MLH1-222	ENST00000539477	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MLH1-222	ENST00000539477	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
MLH1-222	ENST00000539477	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MLH1-222	ENST00000539477	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MLH1-222	ENST00000539477	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.24
MLH1-222	ENST00000539477	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MLH1-222	ENST00000539477	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
MLH1-222	ENST00000539477	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		13.51	□□□□□ -0.25
MLH1-222	ENST00000539477	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		13.51	□□□□□ -0.25
MLH1-222	ENST00000539477	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		13.51	□□□□□ -0.25
MLH1-222	ENST00000539477	ALK	Q9UM73	1620 aa		13.5	□□□□□ -0.25
MLH1-222	ENST00000539477	MET	P08581	1390 aa		13.5	□□□□□ -0.25
MLH1-222	ENST00000539477	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	13.49	□□□□□ -0.25
MLH1-222	ENST00000539477	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
MLH1-222	ENST00000539477	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MLH1-222	ENST00000539477	PIK3C2G	O75747	1445 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MLH1-222	ENST00000539477	PTPRU	Q92729	1446 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MLH1-222	ENST00000539477	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
MLH1-222	ENST00000539477	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		13.47	□□□□□ -0.25
MLH1-222	ENST00000539477	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		13.47	□□□□□ -0.25
MLH1-222	ENST00000539477	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
MLH1-222	ENST00000539477	MYOM2	P54296	1465 aa		13.46	□□□□□ -0.26
MLH1-222	ENST00000539477	DIP2A	Q14689	1571 aa		13.45	□□□□□ -0.26
MLH1-222	ENST00000539477	KCNA6	P17658	529 aa		13.45	□□□□□ -0.26
MLH1-222	ENST00000539477	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		13.45	□□□□□ -0.26
MLH1-222	ENST00000539477	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
MLH1-222	ENST00000539477	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		13.45	□□□□□ -0.26
MLH1-222	ENST00000539477	NWD1	Q149M9	1564 aa		13.44	□□□□□ -0.26
MLH1-222	ENST00000539477	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		13.44	□□□□□ -0.26
MLH1-222	ENST00000539477	STK26	Q9P289	416 aa		13.43	□□□□□ -0.26
MLH1-222	ENST00000539477	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MLH1-222	ENST00000539477	TONSL	Q96HA7	1378 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MLH1-222	ENST00000539477	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MLH1-222	ENST00000539477	TBX22	Q9Y458	520 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MLH1-222	ENST00000539477	LAMC1	P11047	1609 aa		13.41	□□□□□ -0.26
MLH1-222	ENST00000539477	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		13.41	□□□□□ -0.26
MLH1-222	ENST00000539477	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		13.41	□□□□□ -0.26
MLH1-222	ENST00000539477	CERK	Q8TCT0	537 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MLH1-222	ENST00000539477	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MLH1-222	ENST00000539477	TMEM94	Q12767	1356 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MLH1-222	ENST00000539477	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		13.39	□□□□□ -0.27
MLH1-222	ENST00000539477	ADGRB1	O14514	1584 aa		13.39	□□□□□ -0.27
MLH1-222	ENST00000539477	CPS1	P31327	1500 aa		13.39	□□□□□ -0.27
MLH1-222	ENST00000539477	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		13.39	□□□□□ -0.27
MLH1-222	ENST00000539477	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	13.38	□□□□□ -0.27
MLH1-222	ENST00000539477	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		13.38	□□□□□ -0.27
MLH1-222	ENST00000539477	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
MLH1-222	ENST00000539477	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
MLH1-222	ENST00000539477	ARHGEF28	Q8N1W1	1705 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
MLH1-222	ENST00000539477	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		13.37	□□□□□ -0.27
MLH1-222	ENST00000539477	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		13.37	□□□□□ -0.27
MLH1-222	ENST00000539477	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
MLH1-222	ENST00000539477	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
MLH1-222	ENST00000539477	YTHDC2	Q9H6S0	1430 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
MLH1-222	ENST00000539477	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		13.36	□□□□□ -0.27
MLH1-222	ENST00000539477	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		13.36	□□□□□ -0.27
MLH1-222	ENST00000539477	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		13.35	□□□□□ -0.27
MLH1-222	ENST00000539477	C14orf37	Q86TY3	774 aa		13.35	□□□□□ -0.27
MLH1-222	ENST00000539477	PIK3R4	Q99570	1358 aa		13.34	□□□□□ -0.27
MLH1-222	ENST00000539477	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
MLH1-222	ENST00000539477	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.27
MLH1-222	ENST00000539477	PIP4K2B	P78356	416 aa		13.32	□□□□□ -0.28
MLH1-222	ENST00000539477	PTCH1	Q13635	1447 aa		13.31	□□□□□ -0.28
MLH1-222	ENST00000539477	NUTM2F	A1L443	756 aa		13.31	□□□□□ -0.28
MLH1-222	ENST00000539477	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		13.31	□□□□□ -0.28
MLH1-222	ENST00000539477	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	13.31	□□□□□ -0.28
MLH1-222	ENST00000539477	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	13.31	□□□□□ -0.28
MLH1-222	ENST00000539477	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	13.31	□□□□□ -0.28
MLH1-222	ENST00000539477	PRAM1	Q96QH2	718 aa		13.3	□□□□□ -0.28
MLH1-222	ENST00000539477	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		13.3	□□□□□ -0.28
MLH1-222	ENST00000539477	TECPR2	O15040	1411 aa		13.29	□□□□□ -0.28
MLH1-222	ENST00000539477	QRICH2	Q9H0J4	1663 aa		13.29	□□□□□ -0.28
MLH1-222	ENST00000539477	MSH6	P52701	1360 aa		13.28	□□□□□ -0.28
MLH1-222	ENST00000539477	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		13.28	□□□□□ -0.28
MLH1-222	ENST00000539477	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		13.28	□□□□□ -0.28
MLH1-222	ENST00000539477	ABCC11	Q96J66	1382 aa		13.28	□□□□□ -0.28
MLH1-222	ENST00000539477	MINK1	Q8N4C8	1332 aa	Predicted RBP	13.27	□□□□□ -0.28
MLH1-222	ENST00000539477	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		13.27	□□□□□ -0.29
MLH1-222	ENST00000539477	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	13.25	□□□□□ -0.29

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