RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533249.5

PKP3-210, Transcript of plakophilin 3, humanhuman

TSL 3

Gene PKP3, Length 1,111 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3-210ENST00000533249 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP35.14■■■■□ 3.22
PKP3-210ENST00000533249 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP35.12■■■■□ 3.21
PKP3-210ENST00000533249 ROCK1Q13464 1354 aa35.11■■■■□ 3.21
PKP3-210ENST00000533249 ZFYVE9O95405 1425 aa35.09■■■■□ 3.21
PKP3-210ENST00000533249 ITGAEP38570 1179 aa35.09■■■■□ 3.21
PKP3-210ENST00000533249 RIMS2Q9UQ26 1411 aa35.08■■■■□ 3.21
PKP3-210ENST00000533249 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa35.08■■■■□ 3.21
PKP3-210ENST00000533249 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP35.08■■■■□ 3.21
PKP3-210ENST00000533249 CHGAP10645 457 aaKnown RBP35.08■■■■□ 3.21
PKP3-210ENST00000533249 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP35.08■■■■□ 3.21
PKP3-210ENST00000533249 NWD1Q149M9 1564 aa35.07■■■■□ 3.2
PKP3-210ENST00000533249 E9PCH4 1651 aa35.07■■■■□ 3.2
PKP3-210ENST00000533249 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP35.05■■■■□ 3.2
PKP3-210ENST00000533249 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa35.05■■■■□ 3.2
PKP3-210ENST00000533249 HDGFP51858 240 aaKnown RBP35.04■■■■□ 3.2
PKP3-210ENST00000533249 FAM135BQ49AJ0 1406 aa35.04■■■■□ 3.2
PKP3-210ENST00000533249 IQGAP3Q86VI3 1631 aa35.03■■■■□ 3.2
PKP3-210ENST00000533249 NUP155O75694 1391 aa35■■■■□ 3.19
PKP3-210ENST00000533249 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP34.97■■■■□ 3.19
PKP3-210ENST00000533249 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa34.97■■■■□ 3.19
PKP3-210ENST00000533249 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP34.97■■■■□ 3.19
PKP3-210ENST00000533249 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP34.96■■■■□ 3.19
PKP3-210ENST00000533249 MSH6P52701 1360 aa34.96■■■■□ 3.19
PKP3-210ENST00000533249 TBX22Q9Y458 520 aa34.92■■■■□ 3.18
PKP3-210ENST00000533249 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa34.87■■■■□ 3.17
PKP3-210ENST00000533249 SLAIN2Q9P270 581 aa34.85■■■■□ 3.17
PKP3-210ENST00000533249 DIP2AQ14689 1571 aa34.83■■■■□ 3.17
PKP3-210ENST00000533249 C14orf37Q86TY3 774 aa34.82■■■■□ 3.16
PKP3-210ENST00000533249 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP34.82■■■■□ 3.16
PKP3-210ENST00000533249 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa34.78■■■■□ 3.16
PKP3-210ENST00000533249 PHLPP1O60346 1717 aa34.77■■■■□ 3.16
PKP3-210ENST00000533249 PIK3R4Q99570 1358 aa34.76■■■■□ 3.16
PKP3-210ENST00000533249 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa34.76■■■■□ 3.16
PKP3-210ENST00000533249 TRPM2O94759 1503 aa34.75■■■■□ 3.15
PKP3-210ENST00000533249 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP34.71■■■■□ 3.15
PKP3-210ENST00000533249 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa34.71■■■■□ 3.15
PKP3-210ENST00000533249 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP34.7■■■■□ 3.15
PKP3-210ENST00000533249 PTPRUQ92729 1446 aa34.7■■■■□ 3.15
PKP3-210ENST00000533249 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP34.69■■■■□ 3.14
PKP3-210ENST00000533249 C19orf44Q9H6X5 657 aa34.68■■■■□ 3.14
PKP3-210ENST00000533249 ATF3P18847 181 aa34.67■■■■□ 3.14
PKP3-210ENST00000533249 CADPS2Q86UW7 1296 aa34.67■■■■□ 3.14
PKP3-210ENST00000533249 JCADQ9P266 1359 aa34.66■■■■□ 3.14
PKP3-210ENST00000533249 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa34.66■■■■□ 3.14
PKP3-210ENST00000533249 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP34.64■■■■□ 3.14
PKP3-210ENST00000533249 POTEAQ6S8J7 498 aa34.64■■■■□ 3.14
PKP3-210ENST00000533249 NAIPQ13075 1403 aa34.64■■■■□ 3.14
PKP3-210ENST00000533249 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa34.63■■■■□ 3.13
PKP3-210ENST00000533249 CLTCL1P53675 1640 aa34.63■■■■□ 3.13
PKP3-210ENST00000533249 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP34.59■■■■□ 3.13
PKP3-210ENST00000533249 METP08581 1390 aa34.56■■■■□ 3.12
PKP3-210ENST00000533249 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP34.55■■■■□ 3.12
PKP3-210ENST00000533249 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa34.55■■■■□ 3.12
PKP3-210ENST00000533249 TRIM52Q96A61 297 aa34.54■■■■□ 3.12
PKP3-210ENST00000533249 KIF1BO60333 1816 aa34.53■■■■□ 3.12
PKP3-210ENST00000533249 BRINP3Q76B58 766 aa34.51■■■■□ 3.12
PKP3-210ENST00000533249 DCCP43146 1447 aa34.5■■■■□ 3.11
PKP3-210ENST00000533249 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa34.48■■■■□ 3.11
PKP3-210ENST00000533249 LRP6O75581 1613 aa34.48■■■■□ 3.11
PKP3-210ENST00000533249 HFM1A2PYH4 1435 aa34.47■■■■□ 3.11
PKP3-210ENST00000533249 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP34.45■■■■□ 3.11
PKP3-210ENST00000533249 SHPRHQ149N8 1683 aa34.44■■■■□ 3.1
PKP3-210ENST00000533249 MST1RQ04912 1400 aa34.43■■■■□ 3.1
PKP3-210ENST00000533249 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa34.42■■■■□ 3.1
PKP3-210ENST00000533249 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP34.42■■■■□ 3.1
PKP3-210ENST00000533249 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa34.4■■■■□ 3.1
PKP3-210ENST00000533249 VGFO15240 615 aaPredicted RBP34.38■■■■□ 3.09
PKP3-210ENST00000533249 NALCNQ8IZF0 1738 aa34.38■■■■□ 3.09
PKP3-210ENST00000533249 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP34.36■■■■□ 3.09
PKP3-210ENST00000533249 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP34.35■■■■□ 3.09
PKP3-210ENST00000533249 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP34.35■■■■□ 3.09
PKP3-210ENST00000533249 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP34.35■■■■□ 3.09
PKP3-210ENST00000533249 NHSL1Q5SYE7 1610 aa34.33■■■■□ 3.09
PKP3-210ENST00000533249 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP34.31■■■■□ 3.08
PKP3-210ENST00000533249 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa34.3■■■■□ 3.08
PKP3-210ENST00000533249 SETD5Q9C0A6 1442 aa34.3■■■■□ 3.08
PKP3-210ENST00000533249 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP34.3■■■■□ 3.08
PKP3-210ENST00000533249 FOXD1Q16676 465 aa34.29■■■■□ 3.08
PKP3-210ENST00000533249 PPLO60437 1756 aa34.28■■■■□ 3.08
PKP3-210ENST00000533249 PTCH1Q13635 1447 aa34.28■■■■□ 3.08
PKP3-210ENST00000533249 ROBO2Q9HCK4 1378 aa34.27■■■■□ 3.08
PKP3-210ENST00000533249 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP34.26■■■■□ 3.08
PKP3-210ENST00000533249 C1orf167Q5SNV9 1468 aa34.23■■■■□ 3.07
PKP3-210ENST00000533249 PNPLA6Q8IY17 1366 aa34.18■■■■□ 3.06
PKP3-210ENST00000533249 CCDC144AA2RUR9 1427 aa34.17■■■■□ 3.06
PKP3-210ENST00000533249 AFF2P51816 1311 aa34.17■■■■□ 3.06
PKP3-210ENST00000533249 PRAG1Q86YV5 1406 aa34.17■■■■□ 3.06
PKP3-210ENST00000533249 ORAI2Q96SN7 254 aa34.16■■■■□ 3.06
PKP3-210ENST00000533249 RXRBP28702 533 aa34.15■■■■□ 3.06
PKP3-210ENST00000533249 RGL3Q3MIN7 710 aa34.15■■■■□ 3.06
PKP3-210ENST00000533249 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa34.13■■■■□ 3.05
PKP3-210ENST00000533249 MPHOSPH9Q99550 1183 aa34.13■■■■□ 3.05
PKP3-210ENST00000533249 C8orf37Q96NL8 207 aa34.12■■■■□ 3.05
PKP3-210ENST00000533249 LAMC1P11047 1609 aa34.1■■■■□ 3.05
PKP3-210ENST00000533249 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa34.08■■■■□ 3.05
PKP3-210ENST00000533249 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP34.06■■■■□ 3.04
PKP3-210ENST00000533249 STK26Q9P289 416 aa34.06■■■■□ 3.04
PKP3-210ENST00000533249 ADAMTS2O95450 1211 aa34.05■■■■□ 3.04
PKP3-210ENST00000533249 IFT172Q9UG01 1749 aa34.04■■■■□ 3.04
PKP3-210ENST00000533249 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa34.04■■■■□ 3.04
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