RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527876.5

GNPTG-206, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunit gamma, human

TSL 4

Gene GNPTG, Length 550 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GNPTG-206	ENST00000527876	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		33.68	■■■□□ 2.98
GNPTG-206	ENST00000527876	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		33.68	■■■□□ 2.98
GNPTG-206	ENST00000527876	TMEM94	Q12767	1356 aa		33.65	■■■□□ 2.98
GNPTG-206	ENST00000527876	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	33.65	■■■□□ 2.98
GNPTG-206	ENST00000527876	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		33.61	■■■□□ 2.97
GNPTG-206	ENST00000527876	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		33.6	■■■□□ 2.97
GNPTG-206	ENST00000527876	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	33.59	■■■□□ 2.97
GNPTG-206	ENST00000527876	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		33.59	■■■□□ 2.97
GNPTG-206	ENST00000527876	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	33.54	■■■□□ 2.96
GNPTG-206	ENST00000527876	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	33.53	■■■□□ 2.96
GNPTG-206	ENST00000527876	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	33.52	■■■□□ 2.96
GNPTG-206	ENST00000527876	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		33.51	■■■□□ 2.95
GNPTG-206	ENST00000527876	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		33.5	■■■□□ 2.95
GNPTG-206	ENST00000527876	NUP155	O75694	1391 aa		33.49	■■■□□ 2.95
GNPTG-206	ENST00000527876	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	33.49	■■■□□ 2.95
GNPTG-206	ENST00000527876	TBX22	Q9Y458	520 aa		33.48	■■■□□ 2.95
GNPTG-206	ENST00000527876	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	33.44	■■■□□ 2.94
GNPTG-206	ENST00000527876	ITGAE	P38570	1179 aa		33.43	■■■□□ 2.94
GNPTG-206	ENST00000527876	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	33.43	■■■□□ 2.94
GNPTG-206	ENST00000527876	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	33.42	■■■□□ 2.94
GNPTG-206	ENST00000527876	BCAN	Q96GW7	911 aa		33.41	■■■□□ 2.94
GNPTG-206	ENST00000527876	DIP2A	Q14689	1571 aa		33.41	■■■□□ 2.94
GNPTG-206	ENST00000527876	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		33.41	■■■□□ 2.94
GNPTG-206	ENST00000527876	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	33.39	■■■□□ 2.94
GNPTG-206	ENST00000527876	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	33.39	■■■□□ 2.94
GNPTG-206	ENST00000527876	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	33.39	■■■□□ 2.94
GNPTG-206	ENST00000527876	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		33.37	■■■□□ 2.93
GNPTG-206	ENST00000527876	MSH6	P52701	1360 aa		33.37	■■■□□ 2.93
GNPTG-206	ENST00000527876	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	33.37	■■■□□ 2.93
GNPTG-206	ENST00000527876	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		33.36	■■■□□ 2.93
GNPTG-206	ENST00000527876	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	33.36	■■■□□ 2.93
GNPTG-206	ENST00000527876	PIK3R4	Q99570	1358 aa		33.35	■■■□□ 2.93
GNPTG-206	ENST00000527876	SLAIN2	Q9P270	581 aa		33.34	■■■□□ 2.93
GNPTG-206	ENST00000527876	PTPRU	Q92729	1446 aa		33.33	■■■□□ 2.93
GNPTG-206	ENST00000527876	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	33.31	■■■□□ 2.92
GNPTG-206	ENST00000527876	NAIP	Q13075	1403 aa		33.29	■■■□□ 2.92
GNPTG-206	ENST00000527876	PHLPP1	O60346	1717 aa		33.29	■■■□□ 2.92
GNPTG-206	ENST00000527876	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		33.28	■■■□□ 2.92
GNPTG-206	ENST00000527876	TRPM2	O94759	1503 aa		33.28	■■■□□ 2.92
GNPTG-206	ENST00000527876	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	33.25	■■■□□ 2.91
GNPTG-206	ENST00000527876	CLTCL1	P53675	1640 aa		33.25	■■■□□ 2.91
GNPTG-206	ENST00000527876	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	33.24	■■■□□ 2.91
GNPTG-206	ENST00000527876	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		33.21	■■■□□ 2.91
GNPTG-206	ENST00000527876	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		33.2	■■■□□ 2.91
GNPTG-206	ENST00000527876	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		33.2	■■■□□ 2.91
GNPTG-206	ENST00000527876	KIF1B	O60333	1816 aa		33.16	■■■□□ 2.9
GNPTG-206	ENST00000527876	MET	P08581	1390 aa		33.15	■■■□□ 2.9
GNPTG-206	ENST00000527876	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	33.15	■■■□□ 2.9
GNPTG-206	ENST00000527876	POTEA	Q6S8J7	498 aa		33.15	■■■□□ 2.9
GNPTG-206	ENST00000527876	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		33.14	■■■□□ 2.9
GNPTG-206	ENST00000527876	JCAD	Q9P266	1359 aa		33.13	■■■□□ 2.89
GNPTG-206	ENST00000527876	HFM1	A2PYH4	1435 aa		33.12	■■■□□ 2.89
GNPTG-206	ENST00000527876	DCC	P43146	1447 aa		33.1	■■■□□ 2.89
GNPTG-206	ENST00000527876	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	33.09	■■■□□ 2.89
GNPTG-206	ENST00000527876	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	33.07	■■■□□ 2.88
GNPTG-206	ENST00000527876	C14orf37	Q86TY3	774 aa		33.07	■■■□□ 2.88
GNPTG-206	ENST00000527876	ATF3	P18847	181 aa		33.06	■■■□□ 2.88
GNPTG-206	ENST00000527876	SHPRH	Q149N8	1683 aa		33.06	■■■□□ 2.88
GNPTG-206	ENST00000527876	LRP6	O75581	1613 aa		33.05	■■■□□ 2.88
GNPTG-206	ENST00000527876	BRINP3	Q76B58	766 aa		33.04	■■■□□ 2.88
GNPTG-206	ENST00000527876	MST1R	Q04912	1400 aa		33.02	■■■□□ 2.88
GNPTG-206	ENST00000527876	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		33	■■■□□ 2.87
GNPTG-206	ENST00000527876	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		32.99	■■■□□ 2.87
GNPTG-206	ENST00000527876	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		32.98	■■■□□ 2.87
GNPTG-206	ENST00000527876	PPL	O60437	1756 aa		32.98	■■■□□ 2.87
GNPTG-206	ENST00000527876	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		32.98	■■■□□ 2.87
GNPTG-206	ENST00000527876	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		32.96	■■■□□ 2.87
GNPTG-206	ENST00000527876	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		32.94	■■■□□ 2.86
GNPTG-206	ENST00000527876	TRIM52	Q96A61	297 aa		32.92	■■■□□ 2.86
GNPTG-206	ENST00000527876	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	32.91	■■■□□ 2.86
GNPTG-206	ENST00000527876	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		32.91	■■■□□ 2.86
GNPTG-206	ENST00000527876	PTCH1	Q13635	1447 aa		32.89	■■■□□ 2.86
GNPTG-206	ENST00000527876	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		32.89	■■■□□ 2.86
GNPTG-206	ENST00000527876	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	32.89	■■■□□ 2.86
GNPTG-206	ENST00000527876	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		32.86	■■■□□ 2.85
GNPTG-206	ENST00000527876	LAMC1	P11047	1609 aa		32.86	■■■□□ 2.85
GNPTG-206	ENST00000527876	FOXD1	Q16676	465 aa		32.83	■■■□□ 2.85
GNPTG-206	ENST00000527876	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		32.8	■■■□□ 2.84
GNPTG-206	ENST00000527876	IFT172	Q9UG01	1749 aa		32.8	■■■□□ 2.84
GNPTG-206	ENST00000527876	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	32.8	■■■□□ 2.84
GNPTG-206	ENST00000527876	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		32.79	■■■□□ 2.84
GNPTG-206	ENST00000527876	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	32.74	■■■□□ 2.83
GNPTG-206	ENST00000527876	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	32.74	■■■□□ 2.83
GNPTG-206	ENST00000527876	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		32.73	■■■□□ 2.83
GNPTG-206	ENST00000527876	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		32.73	■■■□□ 2.83
GNPTG-206	ENST00000527876	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	32.72	■■■□□ 2.83
GNPTG-206	ENST00000527876	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		32.72	■■■□□ 2.83
GNPTG-206	ENST00000527876	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		32.69	■■■□□ 2.82
GNPTG-206	ENST00000527876	ORAI2	Q96SN7	254 aa		32.69	■■■□□ 2.82
GNPTG-206	ENST00000527876	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	32.68	■■■□□ 2.82
GNPTG-206	ENST00000527876	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	32.68	■■■□□ 2.82
GNPTG-206	ENST00000527876	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	32.68	■■■□□ 2.82
GNPTG-206	ENST00000527876	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	32.68	■■■□□ 2.82
GNPTG-206	ENST00000527876	TECPR2	O15040	1411 aa		32.66	■■■□□ 2.82
GNPTG-206	ENST00000527876	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		32.65	■■■□□ 2.82
GNPTG-206	ENST00000527876	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		32.63	■■■□□ 2.81
GNPTG-206	ENST00000527876	AFF2	P51816	1311 aa		32.62	■■■□□ 2.81
GNPTG-206	ENST00000527876	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	32.61	■■■□□ 2.81
GNPTG-206	ENST00000527876	PIK3C2G	O75747	1445 aa		32.61	■■■□□ 2.81
GNPTG-206	ENST00000527876	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		32.61	■■■□□ 2.81

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