RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527103.1

PITPNM1-208, Transcript of phosphatidylinositol transfer protein membrane associated 1, human

TSL 4

Gene PITPNM1, Length 308 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PITPNM1-208	ENST00000527103	TRPM2	O94759	1503 aa		33.04	■■■□□ 2.88
PITPNM1-208	ENST00000527103	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	33.04	■■■□□ 2.88
PITPNM1-208	ENST00000527103	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	33.03	■■■□□ 2.88
PITPNM1-208	ENST00000527103	ZFYVE9	O95405	1425 aa		33.02	■■■□□ 2.88
PITPNM1-208	ENST00000527103	BCAN	Q96GW7	911 aa		33.02	■■■□□ 2.88
PITPNM1-208	ENST00000527103	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		33.01	■■■□□ 2.87
PITPNM1-208	ENST00000527103	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	33.01	■■■□□ 2.87
PITPNM1-208	ENST00000527103	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	33	■■■□□ 2.87
PITPNM1-208	ENST00000527103	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		32.98	■■■□□ 2.87
PITPNM1-208	ENST00000527103	CLTCL1	P53675	1640 aa		32.98	■■■□□ 2.87
PITPNM1-208	ENST00000527103	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	32.97	■■■□□ 2.87
PITPNM1-208	ENST00000527103	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		32.94	■■■□□ 2.86
PITPNM1-208	ENST00000527103	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		32.88	■■■□□ 2.85
PITPNM1-208	ENST00000527103	CPS1	P31327	1500 aa		32.87	■■■□□ 2.85
PITPNM1-208	ENST00000527103	TBX22	Q9Y458	520 aa		32.85	■■■□□ 2.85
PITPNM1-208	ENST00000527103	KIF1B	O60333	1816 aa		32.85	■■■□□ 2.85
PITPNM1-208	ENST00000527103	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		32.83	■■■□□ 2.85
PITPNM1-208	ENST00000527103	KCNA6	P17658	529 aa		32.83	■■■□□ 2.85
PITPNM1-208	ENST00000527103	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	32.83	■■■□□ 2.85
PITPNM1-208	ENST00000527103	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		32.82	■■■□□ 2.84
PITPNM1-208	ENST00000527103	RGL3	Q3MIN7	710 aa		32.8	■■■□□ 2.84
PITPNM1-208	ENST00000527103	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	32.78	■■■□□ 2.84
PITPNM1-208	ENST00000527103	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		32.77	■■■□□ 2.84
PITPNM1-208	ENST00000527103	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		32.77	■■■□□ 2.84
PITPNM1-208	ENST00000527103	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		32.76	■■■□□ 2.84
PITPNM1-208	ENST00000527103	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		32.75	■■■□□ 2.83
PITPNM1-208	ENST00000527103	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		32.74	■■■□□ 2.83
PITPNM1-208	ENST00000527103	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		32.73	■■■□□ 2.83
PITPNM1-208	ENST00000527103	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		32.72	■■■□□ 2.83
PITPNM1-208	ENST00000527103	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	32.7	■■■□□ 2.83
PITPNM1-208	ENST00000527103	PIK3R4	Q99570	1358 aa		32.67	■■■□□ 2.82
PITPNM1-208	ENST00000527103	DIP2A	Q14689	1571 aa		32.66	■■■□□ 2.82
PITPNM1-208	ENST00000527103	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		32.66	■■■□□ 2.82
PITPNM1-208	ENST00000527103	TOM1	O60784	492 aa		32.64	■■■□□ 2.82
PITPNM1-208	ENST00000527103	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	32.63	■■■□□ 2.81
PITPNM1-208	ENST00000527103	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		32.63	■■■□□ 2.81
PITPNM1-208	ENST00000527103	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		32.62	■■■□□ 2.81
PITPNM1-208	ENST00000527103	TMEM94	Q12767	1356 aa		32.62	■■■□□ 2.81
PITPNM1-208	ENST00000527103	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		32.61	■■■□□ 2.81
PITPNM1-208	ENST00000527103	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	32.61	■■■□□ 2.81
PITPNM1-208	ENST00000527103	MET	P08581	1390 aa		32.6	■■■□□ 2.81
PITPNM1-208	ENST00000527103	NWD1	Q149M9	1564 aa		32.6	■■■□□ 2.81
PITPNM1-208	ENST00000527103	PPL	O60437	1756 aa		32.59	■■■□□ 2.81
PITPNM1-208	ENST00000527103	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	32.59	■■■□□ 2.81
PITPNM1-208	ENST00000527103	PTPRU	Q92729	1446 aa		32.58	■■■□□ 2.81
PITPNM1-208	ENST00000527103	PIP4K2B	P78356	416 aa		32.53	■■■□□ 2.8
PITPNM1-208	ENST00000527103	ALK	Q9UM73	1620 aa		32.51	■■■□□ 2.79
PITPNM1-208	ENST00000527103	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	32.51	■■■□□ 2.79
PITPNM1-208	ENST00000527103	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	32.49	■■■□□ 2.79
PITPNM1-208	ENST00000527103	IFT172	Q9UG01	1749 aa		32.48	■■■□□ 2.79
PITPNM1-208	ENST00000527103	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		32.47	■■■□□ 2.79
PITPNM1-208	ENST00000527103	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		32.47	■■■□□ 2.79
PITPNM1-208	ENST00000527103	C14orf37	Q86TY3	774 aa		32.46	■■■□□ 2.79
PITPNM1-208	ENST00000527103	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		32.45	■■■□□ 2.79
PITPNM1-208	ENST00000527103	MSH6	P52701	1360 aa		32.44	■■■□□ 2.78
PITPNM1-208	ENST00000527103	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	32.43	■■■□□ 2.78
PITPNM1-208	ENST00000527103	PIK3C2G	O75747	1445 aa		32.43	■■■□□ 2.78
PITPNM1-208	ENST00000527103	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	32.42	■■■□□ 2.78
PITPNM1-208	ENST00000527103	MYOM2	P54296	1465 aa		32.42	■■■□□ 2.78
PITPNM1-208	ENST00000527103	STAC3	Q96MF2	364 aa		32.41	■■■□□ 2.78
PITPNM1-208	ENST00000527103	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		32.4	■■■□□ 2.78
PITPNM1-208	ENST00000527103	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		32.4	■■■□□ 2.78
PITPNM1-208	ENST00000527103	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	32.4	■■■□□ 2.78
PITPNM1-208	ENST00000527103	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	32.4	■■■□□ 2.78
PITPNM1-208	ENST00000527103	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		32.39	■■■□□ 2.78
PITPNM1-208	ENST00000527103	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		32.39	■■■□□ 2.78
PITPNM1-208	ENST00000527103	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		32.38	■■■□□ 2.77
PITPNM1-208	ENST00000527103	STK26	Q9P289	416 aa		32.36	■■■□□ 2.77
PITPNM1-208	ENST00000527103	ATF3	P18847	181 aa		32.33	■■■□□ 2.77
PITPNM1-208	ENST00000527103	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		32.33	■■■□□ 2.77
PITPNM1-208	ENST00000527103	SLAIN2	Q9P270	581 aa		32.33	■■■□□ 2.77
PITPNM1-208	ENST00000527103	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		32.32	■■■□□ 2.77
PITPNM1-208	ENST00000527103	NEUROD1	Q13562	356 aa		32.32	■■■□□ 2.76
PITPNM1-208	ENST00000527103	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		32.32	■■■□□ 2.76
PITPNM1-208	ENST00000527103	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	32.31	■■■□□ 2.76
PITPNM1-208	ENST00000527103	HSPA1L	P34931	641 aa		32.3	■■■□□ 2.76
PITPNM1-208	ENST00000527103	PTCH1	Q13635	1447 aa		32.29	■■■□□ 2.76
PITPNM1-208	ENST00000527103	ABCC11	Q96J66	1382 aa		32.28	■■■□□ 2.76
PITPNM1-208	ENST00000527103	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		32.27	■■■□□ 2.76
PITPNM1-208	ENST00000527103	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		32.26	■■■□□ 2.76
PITPNM1-208	ENST00000527103	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		32.26	■■■□□ 2.75
PITPNM1-208	ENST00000527103	YTHDC2	Q9H6S0	1430 aa	Known RBP	32.26	■■■□□ 2.75
PITPNM1-208	ENST00000527103	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	32.24	■■■□□ 2.75
PITPNM1-208	ENST00000527103	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		32.24	■■■□□ 2.75
PITPNM1-208	ENST00000527103	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		32.24	■■■□□ 2.75
PITPNM1-208	ENST00000527103	TECPR2	O15040	1411 aa		32.22	■■■□□ 2.75
PITPNM1-208	ENST00000527103	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		32.21	■■■□□ 2.75
PITPNM1-208	ENST00000527103	SIRT1	Q96EB6	747 aa		32.21	■■■□□ 2.75
PITPNM1-208	ENST00000527103	LAMC1	P11047	1609 aa		32.19	■■■□□ 2.74
PITPNM1-208	ENST00000527103	DCC	P43146	1447 aa		32.19	■■■□□ 2.74
PITPNM1-208	ENST00000527103	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		32.14	■■■□□ 2.74
PITPNM1-208	ENST00000527103	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		32.13	■■■□□ 2.73
PITPNM1-208	ENST00000527103	ADGRB1	O14514	1584 aa		32.12	■■■□□ 2.73
PITPNM1-208	ENST00000527103	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		32.11	■■■□□ 2.73
PITPNM1-208	ENST00000527103	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		32.11	■■■□□ 2.73
PITPNM1-208	ENST00000527103	PRAM1	Q96QH2	718 aa		32.11	■■■□□ 2.73
PITPNM1-208	ENST00000527103	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		32.11	■■■□□ 2.73
PITPNM1-208	ENST00000527103	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		32.1	■■■□□ 2.73
PITPNM1-208	ENST00000527103	MST1R	Q04912	1400 aa		32.09	■■■□□ 2.73
PITPNM1-208	ENST00000527103	POGK	Q9P215	609 aa		32.09	■■■□□ 2.73

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