RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511663.5

SH3BP2-220, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 966 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-220ENST00000511663 TET3O43151 1660 aa29.42■■■□□ 2.3
SH3BP2-220ENST00000511663 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP29.39■■■□□ 2.3
SH3BP2-220ENST00000511663 TMEM94Q12767 1356 aa29.39■■■□□ 2.29
SH3BP2-220ENST00000511663 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP29.38■■■□□ 2.29
SH3BP2-220ENST00000511663 NUP155O75694 1391 aa29.37■■■□□ 2.29
SH3BP2-220ENST00000511663 UNC13BO14795 1591 aa29.35■■■□□ 2.29
SH3BP2-220ENST00000511663 GCC2Q8IWJ2 1684 aa29.35■■■□□ 2.29
SH3BP2-220ENST00000511663 RIMS2Q9UQ26 1411 aa29.35■■■□□ 2.29
SH3BP2-220ENST00000511663 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP29.33■■■□□ 2.29
SH3BP2-220ENST00000511663 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa29.33■■■□□ 2.29
SH3BP2-220ENST00000511663 ZFYVE9O95405 1425 aa29.3■■■□□ 2.28
SH3BP2-220ENST00000511663 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP29.3■■■□□ 2.28
SH3BP2-220ENST00000511663 FAM135BQ49AJ0 1406 aa29.29■■■□□ 2.28
SH3BP2-220ENST00000511663 TBX22Q9Y458 520 aa29.29■■■□□ 2.28
SH3BP2-220ENST00000511663 MSH6P52701 1360 aa29.28■■■□□ 2.28
SH3BP2-220ENST00000511663 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP29.28■■■□□ 2.28
SH3BP2-220ENST00000511663 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa29.27■■■□□ 2.28
SH3BP2-220ENST00000511663 E9PCH4 1651 aa29.26■■■□□ 2.27
SH3BP2-220ENST00000511663 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP29.26■■■□□ 2.27
SH3BP2-220ENST00000511663 IQGAP3Q86VI3 1631 aa29.26■■■□□ 2.27
SH3BP2-220ENST00000511663 MYO5BQ9ULV0 1848 aa29.24■■■□□ 2.27
SH3BP2-220ENST00000511663 C14orf37Q86TY3 774 aa29.22■■■□□ 2.27
SH3BP2-220ENST00000511663 NWD1Q149M9 1564 aa29.21■■■□□ 2.27
SH3BP2-220ENST00000511663 SLAIN2Q9P270 581 aa29.2■■■□□ 2.26
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP29.17■■■□□ 2.26
SH3BP2-220ENST00000511663 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP29.15■■■□□ 2.26
SH3BP2-220ENST00000511663 PIK3R4Q99570 1358 aa29.14■■■□□ 2.26
SH3BP2-220ENST00000511663 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa29.13■■■□□ 2.25
SH3BP2-220ENST00000511663 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa29.12■■■□□ 2.25
SH3BP2-220ENST00000511663 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa29.11■■■□□ 2.25
SH3BP2-220ENST00000511663 ATF3P18847 181 aa29.1■■■□□ 2.25
SH3BP2-220ENST00000511663 C19orf44Q9H6X5 657 aa29.1■■■□□ 2.25
SH3BP2-220ENST00000511663 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa29.1■■■□□ 2.25
SH3BP2-220ENST00000511663 DIP2AQ14689 1571 aa29.09■■■□□ 2.25
SH3BP2-220ENST00000511663 CADPS2Q86UW7 1296 aa29.09■■■□□ 2.25
SH3BP2-220ENST00000511663 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
SH3BP2-220ENST00000511663 TRIM52Q96A61 297 aa29.07■■■□□ 2.24
SH3BP2-220ENST00000511663 TRPM2O94759 1503 aa29.04■■■□□ 2.24
SH3BP2-220ENST00000511663 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa29.03■■■□□ 2.24
SH3BP2-220ENST00000511663 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP29.01■■■□□ 2.23
SH3BP2-220ENST00000511663 NAIPQ13075 1403 aa29.01■■■□□ 2.23
SH3BP2-220ENST00000511663 JCADQ9P266 1359 aa28.99■■■□□ 2.23
SH3BP2-220ENST00000511663 PHLPP1O60346 1717 aa28.97■■■□□ 2.23
SH3BP2-220ENST00000511663 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.22
SH3BP2-220ENST00000511663 PTPRUQ92729 1446 aa28.94■■■□□ 2.22
SH3BP2-220ENST00000511663 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP28.93■■■□□ 2.22
SH3BP2-220ENST00000511663 VGFO15240 615 aaPredicted RBP28.92■■■□□ 2.22
SH3BP2-220ENST00000511663 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa28.92■■■□□ 2.22
SH3BP2-220ENST00000511663 HFM1A2PYH4 1435 aa28.9■■■□□ 2.22
SH3BP2-220ENST00000511663 METP08581 1390 aa28.89■■■□□ 2.22
SH3BP2-220ENST00000511663 POTEAQ6S8J7 498 aa28.89■■■□□ 2.22
SH3BP2-220ENST00000511663 CLTCL1P53675 1640 aa28.89■■■□□ 2.22
SH3BP2-220ENST00000511663 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
SH3BP2-220ENST00000511663 KIF1BO60333 1816 aa28.87■■■□□ 2.21
SH3BP2-220ENST00000511663 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa28.87■■■□□ 2.21
SH3BP2-220ENST00000511663 BRINP3Q76B58 766 aa28.86■■■□□ 2.21
SH3BP2-220ENST00000511663 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa28.86■■■□□ 2.21
SH3BP2-220ENST00000511663 DCCP43146 1447 aa28.86■■■□□ 2.21
SH3BP2-220ENST00000511663 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa28.85■■■□□ 2.21
SH3BP2-220ENST00000511663 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa28.84■■■□□ 2.21
SH3BP2-220ENST00000511663 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP28.82■■■□□ 2.2
SH3BP2-220ENST00000511663 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP28.81■■■□□ 2.2
SH3BP2-220ENST00000511663 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP28.8■■■□□ 2.2
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP28.76■■■□□ 2.19
SH3BP2-220ENST00000511663 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP28.76■■■□□ 2.19
SH3BP2-220ENST00000511663 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa28.75■■■□□ 2.19
SH3BP2-220ENST00000511663 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP28.74■■■□□ 2.19
SH3BP2-220ENST00000511663 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP28.74■■■□□ 2.19
SH3BP2-220ENST00000511663 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP28.74■■■□□ 2.19
SH3BP2-220ENST00000511663 MST1RQ04912 1400 aa28.74■■■□□ 2.19
SH3BP2-220ENST00000511663 FOXD1Q16676 465 aa28.73■■■□□ 2.19
SH3BP2-220ENST00000511663 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa28.71■■■□□ 2.19
SH3BP2-220ENST00000511663 MPHOSPH9Q99550 1183 aa28.69■■■□□ 2.18
SH3BP2-220ENST00000511663 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP28.69■■■□□ 2.18
SH3BP2-220ENST00000511663 SHPRHQ149N8 1683 aa28.68■■■□□ 2.18
SH3BP2-220ENST00000511663 RGL3Q3MIN7 710 aa28.68■■■□□ 2.18
SH3BP2-220ENST00000511663 CCDC144AA2RUR9 1427 aa28.68■■■□□ 2.18
SH3BP2-220ENST00000511663 LRP6O75581 1613 aa28.67■■■□□ 2.18
SH3BP2-220ENST00000511663 SETD5Q9C0A6 1442 aa28.67■■■□□ 2.18
SH3BP2-220ENST00000511663 PTCH1Q13635 1447 aa28.66■■■□□ 2.18
SH3BP2-220ENST00000511663 ROBO2Q9HCK4 1378 aa28.64■■■□□ 2.18
SH3BP2-220ENST00000511663 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP28.64■■■□□ 2.18
SH3BP2-220ENST00000511663 C1orf167Q5SNV9 1468 aa28.61■■■□□ 2.17
SH3BP2-220ENST00000511663 NALCNQ8IZF0 1738 aa28.61■■■□□ 2.17
SH3BP2-220ENST00000511663 PPLO60437 1756 aa28.6■■■□□ 2.17
SH3BP2-220ENST00000511663 RXRBP28702 533 aa28.6■■■□□ 2.17
SH3BP2-220ENST00000511663 NHSL1Q5SYE7 1610 aa28.59■■■□□ 2.17
SH3BP2-220ENST00000511663 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa28.59■■■□□ 2.17
SH3BP2-220ENST00000511663 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa28.59■■■□□ 2.17
SH3BP2-220ENST00000511663 ORAI2Q96SN7 254 aa28.58■■■□□ 2.17
SH3BP2-220ENST00000511663 STK26Q9P289 416 aa28.57■■■□□ 2.16
SH3BP2-220ENST00000511663 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP28.56■■■□□ 2.16
SH3BP2-220ENST00000511663 AFF2P51816 1311 aa28.55■■■□□ 2.16
SH3BP2-220ENST00000511663 C8orf37Q96NL8 207 aa28.55■■■□□ 2.16
SH3BP2-220ENST00000511663 PRAG1Q86YV5 1406 aa28.54■■■□□ 2.16
SH3BP2-220ENST00000511663 PNPLA6Q8IY17 1366 aa28.54■■■□□ 2.16
SH3BP2-220ENST00000511663 ESCO1Q5FWF5 840 aa28.52■■■□□ 2.16
SH3BP2-220ENST00000511663 NGLY1Q96IV0 654 aa28.51■■■□□ 2.15
SH3BP2-220ENST00000511663 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa28.51■■■□□ 2.15
SH3BP2-220ENST00000511663 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP28.5■■■□□ 2.15
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