RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511412.1

ALYREF-203, Transcript of Aly/REF export factor, humanhuman

TSL 3

Gene ALYREF, Length 533 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREF-203ENST00000511412 SLC26A8Q96RN1 970 aa37.64■■■■□ 3.62
ALYREF-203ENST00000511412 NWD1Q149M9 1564 aa37.63■■■■□ 3.62
ALYREF-203ENST00000511412 RIMS2Q9UQ26 1411 aa37.63■■■■□ 3.61
ALYREF-203ENST00000511412 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP37.62■■■■□ 3.61
ALYREF-203ENST00000511412 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa37.6■■■■□ 3.61
ALYREF-203ENST00000511412 KCNA6P17658 529 aa37.6■■■■□ 3.61
ALYREF-203ENST00000511412 BCANQ96GW7 911 aa37.59■■■■□ 3.61
ALYREF-203ENST00000511412 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP37.58■■■■□ 3.61
ALYREF-203ENST00000511412 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP37.58■■■■□ 3.61
ALYREF-203ENST00000511412 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP37.57■■■■□ 3.6
ALYREF-203ENST00000511412 TMEM94Q12767 1356 aa37.56■■■■□ 3.6
ALYREF-203ENST00000511412 CHGAP10645 457 aaKnown RBP37.56■■■■□ 3.6
ALYREF-203ENST00000511412 HDGFP51858 240 aaKnown RBP37.56■■■■□ 3.6
ALYREF-203ENST00000511412 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa37.53■■■■□ 3.6
ALYREF-203ENST00000511412 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP37.5■■■■□ 3.59
ALYREF-203ENST00000511412 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP37.5■■■■□ 3.59
ALYREF-203ENST00000511412 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP37.48■■■■□ 3.59
ALYREF-203ENST00000511412 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP37.48■■■■□ 3.59
ALYREF-203ENST00000511412 DIP2AQ14689 1571 aa37.46■■■■□ 3.59
ALYREF-203ENST00000511412 SOCS7O14512 581 aa37.43■■■■□ 3.58
ALYREF-203ENST00000511412 NAIPQ13075 1403 aa37.43■■■■□ 3.58
ALYREF-203ENST00000511412 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP37.41■■■■□ 3.58
ALYREF-203ENST00000511412 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP37.4■■■■□ 3.58
ALYREF-203ENST00000511412 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa37.39■■■■□ 3.58
ALYREF-203ENST00000511412 FAM135BQ49AJ0 1406 aa37.38■■■■□ 3.57
ALYREF-203ENST00000511412 TBX22Q9Y458 520 aa37.38■■■■□ 3.57
ALYREF-203ENST00000511412 MSH6P52701 1360 aa37.37■■■■□ 3.57
ALYREF-203ENST00000511412 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa37.36■■■■□ 3.57
ALYREF-203ENST00000511412 TRPM2O94759 1503 aa37.33■■■■□ 3.57
ALYREF-203ENST00000511412 HFM1A2PYH4 1435 aa37.32■■■■□ 3.56
ALYREF-203ENST00000511412 CLTCL1P53675 1640 aa37.32■■■■□ 3.56
ALYREF-203ENST00000511412 PIK3R4Q99570 1358 aa37.31■■■■□ 3.56
ALYREF-203ENST00000511412 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP37.27■■■■□ 3.56
ALYREF-203ENST00000511412 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa37.26■■■■□ 3.56
ALYREF-203ENST00000511412 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa37.26■■■■□ 3.55
ALYREF-203ENST00000511412 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa37.25■■■■□ 3.55
ALYREF-203ENST00000511412 KIF1BO60333 1816 aa37.23■■■■□ 3.55
ALYREF-203ENST00000511412 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP37.23■■■■□ 3.55
ALYREF-203ENST00000511412 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa37.2■■■■□ 3.55
ALYREF-203ENST00000511412 TRIM52Q96A61 297 aa37.19■■■■□ 3.54
ALYREF-203ENST00000511412 C14orf37Q86TY3 774 aa37.17■■■■□ 3.54
ALYREF-203ENST00000511412 SLAIN2Q9P270 581 aa37.17■■■■□ 3.54
ALYREF-203ENST00000511412 PTPRUQ92729 1446 aa37.17■■■■□ 3.54
ALYREF-203ENST00000511412 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP37.16■■■■□ 3.54
ALYREF-203ENST00000511412 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP37.16■■■■□ 3.54
ALYREF-203ENST00000511412 PHLPP1O60346 1717 aa37.14■■■■□ 3.54
ALYREF-203ENST00000511412 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa37.13■■■■□ 3.53
ALYREF-203ENST00000511412 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP37.09■■■■□ 3.53
ALYREF-203ENST00000511412 CADPS2Q86UW7 1296 aa37.07■■■■□ 3.52
ALYREF-203ENST00000511412 C19orf44Q9H6X5 657 aa37.07■■■■□ 3.52
ALYREF-203ENST00000511412 METP08581 1390 aa37.04■■■■□ 3.52
ALYREF-203ENST00000511412 ATF3P18847 181 aa37.04■■■■□ 3.52
ALYREF-203ENST00000511412 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP37.03■■■■□ 3.52
ALYREF-203ENST00000511412 DCCP43146 1447 aa37.02■■■■□ 3.52
ALYREF-203ENST00000511412 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP36.97■■■■□ 3.51
ALYREF-203ENST00000511412 JCADQ9P266 1359 aa36.96■■■■□ 3.51
ALYREF-203ENST00000511412 PPLO60437 1756 aa36.96■■■■□ 3.51
ALYREF-203ENST00000511412 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP36.96■■■■□ 3.51
ALYREF-203ENST00000511412 VGFO15240 615 aaPredicted RBP36.93■■■■□ 3.5
ALYREF-203ENST00000511412 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP36.92■■■■□ 3.5
ALYREF-203ENST00000511412 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa36.91■■■■□ 3.5
ALYREF-203ENST00000511412 NALCNQ8IZF0 1738 aa36.9■■■■□ 3.5
ALYREF-203ENST00000511412 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa36.89■■■■□ 3.5
ALYREF-203ENST00000511412 FOXD1Q16676 465 aa36.88■■■■□ 3.49
ALYREF-203ENST00000511412 CCDC144AA2RUR9 1427 aa36.87■■■■□ 3.49
ALYREF-203ENST00000511412 MST1RQ04912 1400 aa36.86■■■■□ 3.49
ALYREF-203ENST00000511412 PTCH1Q13635 1447 aa36.86■■■■□ 3.49
ALYREF-203ENST00000511412 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa36.86■■■■□ 3.49
ALYREF-203ENST00000511412 BRINP3Q76B58 766 aa36.85■■■■□ 3.49
ALYREF-203ENST00000511412 SHPRHQ149N8 1683 aa36.84■■■■□ 3.49
ALYREF-203ENST00000511412 MPHOSPH9Q99550 1183 aa36.81■■■■□ 3.48
ALYREF-203ENST00000511412 PRAG1Q86YV5 1406 aa36.8■■■■□ 3.48
ALYREF-203ENST00000511412 NHSL1Q5SYE7 1610 aa36.8■■■■□ 3.48
ALYREF-203ENST00000511412 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa36.78■■■■□ 3.48
ALYREF-203ENST00000511412 IFT172Q9UG01 1749 aa36.77■■■■□ 3.48
ALYREF-203ENST00000511412 LRP6O75581 1613 aa36.76■■■■□ 3.48
ALYREF-203ENST00000511412 ROBO2Q9HCK4 1378 aa36.75■■■■□ 3.47
ALYREF-203ENST00000511412 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa36.75■■■■□ 3.47
ALYREF-203ENST00000511412 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP36.74■■■■□ 3.47
ALYREF-203ENST00000511412 SETD5Q9C0A6 1442 aa36.73■■■■□ 3.47
ALYREF-203ENST00000511412 POTEAQ6S8J7 498 aa36.72■■■■□ 3.47
ALYREF-203ENST00000511412 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa36.68■■■■□ 3.46
ALYREF-203ENST00000511412 RGL3Q3MIN7 710 aa36.68■■■■□ 3.46
ALYREF-203ENST00000511412 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa36.67■■■■□ 3.46
ALYREF-203ENST00000511412 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP36.66■■■■□ 3.46
ALYREF-203ENST00000511412 C1orf167Q5SNV9 1468 aa36.66■■■■□ 3.46
ALYREF-203ENST00000511412 PIK3C2GO75747 1445 aa36.59■■■■□ 3.45
ALYREF-203ENST00000511412 LAMC1P11047 1609 aa36.59■■■■□ 3.45
ALYREF-203ENST00000511412 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa36.59■■■■□ 3.45
ALYREF-203ENST00000511412 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa36.59■■■■□ 3.45
ALYREF-203ENST00000511412 KNDC1Q76NI1 1749 aa36.58■■■■□ 3.45
ALYREF-203ENST00000511412 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP36.57■■■■□ 3.44
ALYREF-203ENST00000511412 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP36.57■■■■□ 3.44
ALYREF-203ENST00000511412 TECPR2O15040 1411 aa36.56■■■■□ 3.44
ALYREF-203ENST00000511412 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP36.54■■■■□ 3.44
ALYREF-203ENST00000511412 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP36.54■■■■□ 3.44
ALYREF-203ENST00000511412 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP36.54■■■■□ 3.44
ALYREF-203ENST00000511412 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP36.53■■■■□ 3.44
ALYREF-203ENST00000511412 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP36.52■■■■□ 3.44
ALYREF-203ENST00000511412 PNPLA6Q8IY17 1366 aa36.52■■■■□ 3.44
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