RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506932.1

SH3BP2-211, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 4

Gene SH3BP2, Length 537 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-211ENST00000506932 HFM1A2PYH4 1435 aa23.76■■□□□ 1.39
SH3BP2-211ENST00000506932 CHGAP10645 457 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
SH3BP2-211ENST00000506932 PIP4K2BP78356 416 aa23.75■■□□□ 1.39
SH3BP2-211ENST00000506932 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
SH3BP2-211ENST00000506932 TOM1O60784 492 aa23.71■■□□□ 1.39
SH3BP2-211ENST00000506932 NWD1Q149M9 1564 aa23.7■■□□□ 1.38
SH3BP2-211ENST00000506932 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa23.7■■□□□ 1.38
SH3BP2-211ENST00000506932 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
SH3BP2-211ENST00000506932 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
SH3BP2-211ENST00000506932 BCANQ96GW7 911 aa23.69■■□□□ 1.38
SH3BP2-211ENST00000506932 CLTCL1P53675 1640 aa23.69■■□□□ 1.38
SH3BP2-211ENST00000506932 TRPM2O94759 1503 aa23.66■■□□□ 1.38
SH3BP2-211ENST00000506932 KCNA6P17658 529 aa23.65■■□□□ 1.38
SH3BP2-211ENST00000506932 HSPA1LP34931 641 aa23.65■■□□□ 1.38
SH3BP2-211ENST00000506932 TMEM94Q12767 1356 aa23.65■■□□□ 1.38
SH3BP2-211ENST00000506932 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
SH3BP2-211ENST00000506932 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
SH3BP2-211ENST00000506932 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
SH3BP2-211ENST00000506932 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa23.63■■□□□ 1.37
SH3BP2-211ENST00000506932 TRIM52Q96A61 297 aa23.63■■□□□ 1.37
SH3BP2-211ENST00000506932 DISP3Q9P2K9 1392 aa23.63■■□□□ 1.37
SH3BP2-211ENST00000506932 HDGFP51858 240 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
SH3BP2-211ENST00000506932 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP23.61■■□□□ 1.37
SH3BP2-211ENST00000506932 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa23.6■■□□□ 1.37
SH3BP2-211ENST00000506932 DIP2AQ14689 1571 aa23.59■■□□□ 1.37
SH3BP2-211ENST00000506932 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
SH3BP2-211ENST00000506932 KIF1BO60333 1816 aa23.57■■□□□ 1.36
SH3BP2-211ENST00000506932 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa23.56■■□□□ 1.36
SH3BP2-211ENST00000506932 TBX22Q9Y458 520 aa23.56■■□□□ 1.36
SH3BP2-211ENST00000506932 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
SH3BP2-211ENST00000506932 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
SH3BP2-211ENST00000506932 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa23.53■■□□□ 1.36
SH3BP2-211ENST00000506932 FOXD1Q16676 465 aa23.52■■□□□ 1.36
SH3BP2-211ENST00000506932 PTPRUQ92729 1446 aa23.51■■□□□ 1.35
SH3BP2-211ENST00000506932 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
SH3BP2-211ENST00000506932 ILDR2Q71H61 639 aa23.49■■□□□ 1.35
SH3BP2-211ENST00000506932 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa23.48■■□□□ 1.35
SH3BP2-211ENST00000506932 PIK3R4Q99570 1358 aa23.48■■□□□ 1.35
SH3BP2-211ENST00000506932 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
SH3BP2-211ENST00000506932 MSH6P52701 1360 aa23.47■■□□□ 1.35
SH3BP2-211ENST00000506932 FAM135BQ49AJ0 1406 aa23.44■■□□□ 1.34
SH3BP2-211ENST00000506932 METP08581 1390 aa23.44■■□□□ 1.34
SH3BP2-211ENST00000506932 PPLO60437 1756 aa23.43■■□□□ 1.34
SH3BP2-211ENST00000506932 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa23.43■■□□□ 1.34
SH3BP2-211ENST00000506932 SETD5Q9C0A6 1442 aa23.42■■□□□ 1.34
SH3BP2-211ENST00000506932 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
SH3BP2-211ENST00000506932 MPHOSPH9Q99550 1183 aa23.42■■□□□ 1.34
SH3BP2-211ENST00000506932 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
SH3BP2-211ENST00000506932 C14orf37Q86TY3 774 aa23.39■■□□□ 1.33
SH3BP2-211ENST00000506932 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa23.39■■□□□ 1.33
SH3BP2-211ENST00000506932 CCDC144AA2RUR9 1427 aa23.38■■□□□ 1.33
SH3BP2-211ENST00000506932 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa23.38■■□□□ 1.33
SH3BP2-211ENST00000506932 SLAIN2Q9P270 581 aa23.36■■□□□ 1.33
SH3BP2-211ENST00000506932 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa23.35■■□□□ 1.33
SH3BP2-211ENST00000506932 IFT172Q9UG01 1749 aa23.35■■□□□ 1.33
SH3BP2-211ENST00000506932 PHLPP1O60346 1717 aa23.33■■□□□ 1.32
SH3BP2-211ENST00000506932 NALCNQ8IZF0 1738 aa23.33■■□□□ 1.32
SH3BP2-211ENST00000506932 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa23.33■■□□□ 1.32
SH3BP2-211ENST00000506932 VGFO15240 615 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
SH3BP2-211ENST00000506932 C19orf44Q9H6X5 657 aa23.31■■□□□ 1.32
SH3BP2-211ENST00000506932 RGL3Q3MIN7 710 aa23.29■■□□□ 1.32
SH3BP2-211ENST00000506932 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
SH3BP2-211ENST00000506932 ATF3P18847 181 aa23.28■■□□□ 1.32
SH3BP2-211ENST00000506932 CADPS2Q86UW7 1296 aa23.28■■□□□ 1.32
SH3BP2-211ENST00000506932 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa23.28■■□□□ 1.32
SH3BP2-211ENST00000506932 DCCP43146 1447 aa23.26■■□□□ 1.31
SH3BP2-211ENST00000506932 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa23.26■■□□□ 1.31
SH3BP2-211ENST00000506932 ROBO2Q9HCK4 1378 aa23.26■■□□□ 1.31
SH3BP2-211ENST00000506932 PTCH1Q13635 1447 aa23.25■■□□□ 1.31
SH3BP2-211ENST00000506932 MST1RQ04912 1400 aa23.24■■□□□ 1.31
SH3BP2-211ENST00000506932 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
SH3BP2-211ENST00000506932 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
SH3BP2-211ENST00000506932 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa23.23■■□□□ 1.31
SH3BP2-211ENST00000506932 PRAG1Q86YV5 1406 aa23.22■■□□□ 1.31
SH3BP2-211ENST00000506932 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
SH3BP2-211ENST00000506932 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa23.2■■□□□ 1.3
SH3BP2-211ENST00000506932 SOCS7O14512 581 aa23.2■■□□□ 1.3
SH3BP2-211ENST00000506932 BRINP3Q76B58 766 aa23.2■■□□□ 1.3
SH3BP2-211ENST00000506932 PIK3C2GO75747 1445 aa23.19■■□□□ 1.3
SH3BP2-211ENST00000506932 JCADQ9P266 1359 aa23.16■■□□□ 1.3
SH3BP2-211ENST00000506932 NHSL1Q5SYE7 1610 aa23.16■■□□□ 1.3
SH3BP2-211ENST00000506932 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
SH3BP2-211ENST00000506932 NRXN1Q9ULB1 1477 aa23.14■■□□□ 1.29
SH3BP2-211ENST00000506932 KNDC1Q76NI1 1749 aa23.13■■□□□ 1.29
SH3BP2-211ENST00000506932 SHPRHQ149N8 1683 aa23.13■■□□□ 1.29
SH3BP2-211ENST00000506932 MYOM2P54296 1465 aa23.13■■□□□ 1.29
SH3BP2-211ENST00000506932 TMEM132EQ6IEE7 984 aa23.13■■□□□ 1.29
SH3BP2-211ENST00000506932 LRP6O75581 1613 aa23.12■■□□□ 1.29
SH3BP2-211ENST00000506932 STK26Q9P289 416 aa23.12■■□□□ 1.29
SH3BP2-211ENST00000506932 C1orf167Q5SNV9 1468 aa23.11■■□□□ 1.29
SH3BP2-211ENST00000506932 TECPR2O15040 1411 aa23.11■■□□□ 1.29
SH3BP2-211ENST00000506932 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
SH3BP2-211ENST00000506932 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
SH3BP2-211ENST00000506932 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa23.09■■□□□ 1.29
SH3BP2-211ENST00000506932 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa23.09■■□□□ 1.29
SH3BP2-211ENST00000506932 LAMC1P11047 1609 aa23.08■■□□□ 1.29
SH3BP2-211ENST00000506932 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.28
SH3BP2-211ENST00000506932 HRCP23327 699 aa23.07■■□□□ 1.28
SH3BP2-211ENST00000506932 WAPLQ7Z5K2 1190 aa23.07■■□□□ 1.28
SH3BP2-211ENST00000506932 ABCC11Q96J66 1382 aa23.05■■□□□ 1.28
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