RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498280.1

RBM39-242, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 3

Gene RBM39, Length 444 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-242ENST00000498280 SLC19A1P41440 591 aa7.37□□□□□ -1.23
RBM39-242ENST00000498280 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
RBM39-242ENST00000498280 TTC13Q8NBP0 860 aa7.37□□□□□ -1.23
RBM39-242ENST00000498280 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
RBM39-242ENST00000498280 DGAT1O75907 488 aa7.35□□□□□ -1.23
RBM39-242ENST00000498280 RNF223E7ERA6 249 aa7.34□□□□□ -1.23
RBM39-242ENST00000498280 TREML4Q6UXN2 200 aa7.34□□□□□ -1.23
RBM39-242ENST00000498280 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
RBM39-242ENST00000498280 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa7.33□□□□□ -1.24
RBM39-242ENST00000498280 KCNV2Q8TDN2 545 aa7.33□□□□□ -1.24
RBM39-242ENST00000498280 FAM187AA6NFU0 413 aa7.32□□□□□ -1.24
RBM39-242ENST00000498280 DNAJB2P25686 324 aa7.32□□□□□ -1.24
RBM39-242ENST00000498280 PRR20EP86478 221 aa7.32□□□□□ -1.24
RBM39-242ENST00000498280 PRR20CP86479 221 aa7.32□□□□□ -1.24
RBM39-242ENST00000498280 PRR20DP86480 221 aa7.32□□□□□ -1.24
RBM39-242ENST00000498280 PRR20BP86481 221 aa7.32□□□□□ -1.24
RBM39-242ENST00000498280 PRR20AP86496 221 aa7.32□□□□□ -1.24
RBM39-242ENST00000498280 KMT5BQ4FZB7 885 aa7.32□□□□□ -1.24
RBM39-242ENST00000498280 SPRYD7Q5W111 196 aa7.32□□□□□ -1.24
RBM39-242ENST00000498280 ANKLE1Q8NAG6 615 aa7.32□□□□□ -1.24
RBM39-242ENST00000498280 EYA1Q99502 592 aa7.32□□□□□ -1.24
RBM39-242ENST00000498280 TNFRSF10AO00220 468 aa7.31□□□□□ -1.24
RBM39-242ENST00000498280 ST8SIA5O15466 376 aa7.31□□□□□ -1.24
RBM39-242ENST00000498280 TLL1O43897 1013 aa7.31□□□□□ -1.24
RBM39-242ENST00000498280 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
RBM39-242ENST00000498280 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
RBM39-242ENST00000498280 ZNF697Q5TEC3 545 aa7.29□□□□□ -1.24
RBM39-242ENST00000498280 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
RBM39-242ENST00000498280 S1PR4O95977 384 aa7.28□□□□□ -1.24
RBM39-242ENST00000498280 FAM161AQ3B820 660 aa7.28□□□□□ -1.24
RBM39-242ENST00000498280 LIAT1Q6ZQX7 453 aa7.28□□□□□ -1.24
RBM39-242ENST00000498280 TMEM134Q9H6X4 195 aa7.28□□□□□ -1.24
RBM39-242ENST00000498280 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
RBM39-242ENST00000498280 CFHP08603 1231 aa7.27□□□□□ -1.25
RBM39-242ENST00000498280 GDF9O60383 454 aa7.26□□□□□ -1.25
RBM39-242ENST00000498280 NR1I2O75469 434 aa7.26□□□□□ -1.25
RBM39-242ENST00000498280 ADH1BP00325 375 aa7.26□□□□□ -1.25
RBM39-242ENST00000498280 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
RBM39-242ENST00000498280 AAASQ9NRG9 546 aa7.26□□□□□ -1.25
RBM39-242ENST00000498280 PTGDRQ13258 359 aa7.24□□□□□ -1.25
RBM39-242ENST00000498280 SEMA3EO15041 775 aa7.23□□□□□ -1.25
RBM39-242ENST00000498280 SLC6A16Q9GZN6 736 aa7.23□□□□□ -1.25
RBM39-242ENST00000498280 DACH1Q9UI36 760 aa7.23□□□□□ -1.25
RBM39-242ENST00000498280 WFS1O76024 890 aa7.22□□□□□ -1.25
RBM39-242ENST00000498280 LMOD2Q6P5Q4 547 aa7.22□□□□□ -1.25
RBM39-242ENST00000498280 ADGRG1Q9Y653 693 aa7.22□□□□□ -1.25
RBM39-242ENST00000498280 RCCD1A6NED2 376 aa7.21□□□□□ -1.26
RBM39-242ENST00000498280 PLA2G2CQ5R387 149 aa7.21□□□□□ -1.26
RBM39-242ENST00000498280 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
RBM39-242ENST00000498280 NUTM2FA1L443 756 aa7.2□□□□□ -1.26
RBM39-242ENST00000498280 FOXC1Q12948 553 aa7.2□□□□□ -1.26
RBM39-242ENST00000498280 STK17AQ9UEE5 414 aa7.2□□□□□ -1.26
RBM39-242ENST00000498280 RSPH4AQ5TD94 716 aa7.18□□□□□ -1.26
RBM39-242ENST00000498280 PKD2L1Q9P0L9 805 aa7.18□□□□□ -1.26
RBM39-242ENST00000498280 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
RBM39-242ENST00000498280 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
RBM39-242ENST00000498280 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
RBM39-242ENST00000498280 SLC10A3P09131 477 aa7.16□□□□□ -1.26
RBM39-242ENST00000498280 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
RBM39-242ENST00000498280 CRIPAKQ8N1N5 446 aa7.16□□□□□ -1.26
RBM39-242ENST00000498280 FCHSD2O94868 740 aa7.15□□□□□ -1.26
RBM39-242ENST00000498280 FECHP22830 423 aa7.15□□□□□ -1.26
RBM39-242ENST00000498280 SPSB2Q99619 263 aa7.15□□□□□ -1.26
RBM39-242ENST00000498280 WIPF1O43516 503 aa7.14□□□□□ -1.27
RBM39-242ENST00000498280 OATP04181 439 aa7.14□□□□□ -1.27
RBM39-242ENST00000498280 RPIAP49247 311 aa7.14□□□□□ -1.27
RBM39-242ENST00000498280 SCUBE3Q8IX30 993 aa7.14□□□□□ -1.27
RBM39-242ENST00000498280 AXIN1O15169 862 aa7.13□□□□□ -1.27
RBM39-242ENST00000498280 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
RBM39-242ENST00000498280 CTC1Q2NKJ3 1217 aa7.13□□□□□ -1.27
RBM39-242ENST00000498280 LCE2CQ5TA81 110 aa7.13□□□□□ -1.27
RBM39-242ENST00000498280 CYP4X1Q8N118 509 aa7.13□□□□□ -1.27
RBM39-242ENST00000498280 PXYLP1Q8TE99 480 aa7.13□□□□□ -1.27
RBM39-242ENST00000498280 AVPP01185 164 aa7.12□□□□□ -1.27
RBM39-242ENST00000498280 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
RBM39-242ENST00000498280 NLRP7Q8WX94 980 aa7.12□□□□□ -1.27
RBM39-242ENST00000498280 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
RBM39-242ENST00000498280 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
RBM39-242ENST00000498280 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
RBM39-242ENST00000498280 PLCB2Q00722 1185 aa7.11□□□□□ -1.27
RBM39-242ENST00000498280 TOR4AQ9NXH8 423 aa7.11□□□□□ -1.27
RBM39-242ENST00000498280 GPR37O15354 613 aa7.1□□□□□ -1.27
RBM39-242ENST00000498280 P3H3Q8IVL6 736 aa7.1□□□□□ -1.27
RBM39-242ENST00000498280 HIC1Q14526 733 aa7.09□□□□□ -1.27
RBM39-242ENST00000498280 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
RBM39-242ENST00000498280 RDH13Q8NBN7 331 aa7.09□□□□□ -1.27
RBM39-242ENST00000498280 LOC100996750A0A140TA64 210 aa7.08□□□□□ -1.28
RBM39-242ENST00000498280 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
RBM39-242ENST00000498280 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
RBM39-242ENST00000498280 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa7.08□□□□□ -1.28
RBM39-242ENST00000498280 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa7.08□□□□□ -1.28
RBM39-242ENST00000498280 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
RBM39-242ENST00000498280 MORN1Q5T089 497 aa7.07□□□□□ -1.28
RBM39-242ENST00000498280 PHOX2BQ99453 314 aa7.07□□□□□ -1.28
RBM39-242ENST00000498280 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
RBM39-242ENST00000498280 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
RBM39-242ENST00000498280 FUT2Q10981 343 aa7.06□□□□□ -1.28
RBM39-242ENST00000498280 SULF1Q8IWU6 871 aa7.06□□□□□ -1.28
RBM39-242ENST00000498280 TERTO14746 1132 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
RBM39-242ENST00000498280 ATP6V1AP38606 617 aa7.05□□□□□ -1.28
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