RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497637.5

ACTN4-208, Transcript of actinin alpha 4, human

TSL 2

Gene ACTN4, Length 877 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ACTN4-208	ENST00000497637	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		29.12	■■■□□ 2.25
ACTN4-208	ENST00000497637	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		29.12	■■■□□ 2.25
ACTN4-208	ENST00000497637	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		29.12	■■■□□ 2.25
ACTN4-208	ENST00000497637	TET3	O43151	1660 aa		29.09	■■■□□ 2.25
ACTN4-208	ENST00000497637	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	29.08	■■■□□ 2.25
ACTN4-208	ENST00000497637	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		29.08	■■■□□ 2.25
ACTN4-208	ENST00000497637	CEP152	O94986	1710 aa		29.07	■■■□□ 2.24
ACTN4-208	ENST00000497637	LRP6	O75581	1613 aa		29.05	■■■□□ 2.24
ACTN4-208	ENST00000497637	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		29.05	■■■□□ 2.24
ACTN4-208	ENST00000497637	IDI1	Q13907	227 aa		29.05	■■■□□ 2.24
ACTN4-208	ENST00000497637	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	29.05	■■■□□ 2.24
ACTN4-208	ENST00000497637	PIK3C2B	O00750	1634 aa		29.05	■■■□□ 2.24
ACTN4-208	ENST00000497637	BCAN	Q96GW7	911 aa		29.04	■■■□□ 2.24
ACTN4-208	ENST00000497637	NWD1	Q149M9	1564 aa		29.04	■■■□□ 2.24
ACTN4-208	ENST00000497637	HFM1	A2PYH4	1435 aa		29.03	■■■□□ 2.24
ACTN4-208	ENST00000497637	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	29.03	■■■□□ 2.24
ACTN4-208	ENST00000497637	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		29.02	■■■□□ 2.24
ACTN4-208	ENST00000497637	KANK1	Q14678	1352 aa		29	■■■□□ 2.23
ACTN4-208	ENST00000497637	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		28.97	■■■□□ 2.23
ACTN4-208	ENST00000497637	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	28.97	■■■□□ 2.23	5e-7	■□□□□ 8.5
ACTN4-208	ENST00000497637	ABCC5	O15440	1437 aa		28.96	■■■□□ 2.23
ACTN4-208	ENST00000497637	DAPK1	P53355	1430 aa		28.96	■■■□□ 2.23
ACTN4-208	ENST00000497637	NAIP	Q13075	1403 aa		28.96	■■■□□ 2.23
ACTN4-208	ENST00000497637	FOXD1	Q16676	465 aa		28.96	■■■□□ 2.23
ACTN4-208	ENST00000497637	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		28.95	■■■□□ 2.23
ACTN4-208	ENST00000497637	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	28.95	■■■□□ 2.22
ACTN4-208	ENST00000497637	C14orf37	Q86TY3	774 aa		28.95	■■■□□ 2.22
ACTN4-208	ENST00000497637	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		28.95	■■■□□ 2.22
ACTN4-208	ENST00000497637	KIF15	Q9NS87	1388 aa		28.94	■■■□□ 2.22
ACTN4-208	ENST00000497637	ROCK1	Q13464	1354 aa		28.93	■■■□□ 2.22
ACTN4-208	ENST00000497637	ATF3	P18847	181 aa		28.92	■■■□□ 2.22
ACTN4-208	ENST00000497637	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		28.92	■■■□□ 2.22
ACTN4-208	ENST00000497637	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	28.91	■■■□□ 2.22
ACTN4-208	ENST00000497637	SHPRH	Q149N8	1683 aa		28.89	■■■□□ 2.22
ACTN4-208	ENST00000497637	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		28.89	■■■□□ 2.22
ACTN4-208	ENST00000497637	AFF2	P51816	1311 aa		28.89	■■■□□ 2.21
ACTN4-208	ENST00000497637	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		28.88	■■■□□ 2.21
ACTN4-208	ENST00000497637	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	28.88	■■■□□ 2.21
ACTN4-208	ENST00000497637	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	28.88	■■■□□ 2.21
ACTN4-208	ENST00000497637	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	28.88	■■■□□ 2.21
ACTN4-208	ENST00000497637	TBX22	Q9Y458	520 aa		28.88	■■■□□ 2.21
ACTN4-208	ENST00000497637	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		28.87	■■■□□ 2.21
ACTN4-208	ENST00000497637	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	28.86	■■■□□ 2.21
ACTN4-208	ENST00000497637	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	28.86	■■■□□ 2.21
ACTN4-208	ENST00000497637	ADGRB3	O60242	1522 aa		28.85	■■■□□ 2.21
ACTN4-208	ENST00000497637	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		28.84	■■■□□ 2.21
ACTN4-208	ENST00000497637	NOS1	P29475	1434 aa		28.84	■■■□□ 2.21
ACTN4-208	ENST00000497637	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	28.83	■■■□□ 2.21
ACTN4-208	ENST00000497637	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	28.82	■■■□□ 2.2
ACTN4-208	ENST00000497637	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	28.81	■■■□□ 2.2
ACTN4-208	ENST00000497637	ZRANB1	Q9UGI0	708 aa		28.81	■■■□□ 2.2
ACTN4-208	ENST00000497637	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	28.8	■■■□□ 2.2
ACTN4-208	ENST00000497637	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		28.8	■■■□□ 2.2
ACTN4-208	ENST00000497637	BRINP3	Q76B58	766 aa		28.8	■■■□□ 2.2
ACTN4-208	ENST00000497637	RGS12	O14924	1447 aa		28.78	■■■□□ 2.2
ACTN4-208	ENST00000497637	ZFYVE9	O95405	1425 aa		28.78	■■■□□ 2.2
ACTN4-208	ENST00000497637	NGLY1	Q96IV0	654 aa		28.78	■■■□□ 2.2
ACTN4-208	ENST00000497637	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	28.77	■■■□□ 2.2
ACTN4-208	ENST00000497637	ADGRL2	O95490	1459 aa		28.77	■■■□□ 2.2
ACTN4-208	ENST00000497637	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	28.76	■■■□□ 2.19
ACTN4-208	ENST00000497637	ATAD2	Q6PL18	1390 aa		28.75	■■■□□ 2.19
ACTN4-208	ENST00000497637	PIK3R4	Q99570	1358 aa		28.75	■■■□□ 2.19
ACTN4-208	ENST00000497637	C8orf37	Q96NL8	207 aa		28.74	■■■□□ 2.19
ACTN4-208	ENST00000497637	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		28.74	■■■□□ 2.19
ACTN4-208	ENST00000497637	DIP2A	Q14689	1571 aa		28.73	■■■□□ 2.19
ACTN4-208	ENST00000497637	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	28.72	■■■□□ 2.19
ACTN4-208	ENST00000497637	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		28.7	■■■□□ 2.18
ACTN4-208	ENST00000497637	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		28.7	■■■□□ 2.18
ACTN4-208	ENST00000497637	DCC	P43146	1447 aa		28.69	■■■□□ 2.18
ACTN4-208	ENST00000497637	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	28.68	■■■□□ 2.18
ACTN4-208	ENST00000497637	CCDC125	Q86Z20	511 aa		28.65	■■■□□ 2.18
ACTN4-208	ENST00000497637	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		28.63	■■■□□ 2.17
ACTN4-208	ENST00000497637	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		28.63	■■■□□ 2.17
ACTN4-208	ENST00000497637	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		28.62	■■■□□ 2.17
ACTN4-208	ENST00000497637	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		28.59	■■■□□ 2.17
ACTN4-208	ENST00000497637	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		28.58	■■■□□ 2.17
ACTN4-208	ENST00000497637	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	28.57	■■■□□ 2.16
ACTN4-208	ENST00000497637	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	28.56	■■■□□ 2.16
ACTN4-208	ENST00000497637	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		28.55	■■■□□ 2.16
ACTN4-208	ENST00000497637	MST1R	Q04912	1400 aa		28.54	■■■□□ 2.16
ACTN4-208	ENST00000497637	ADAMTS2	O95450	1211 aa		28.54	■■■□□ 2.16
ACTN4-208	ENST00000497637	USP21	Q9UK80	565 aa		28.54	■■■□□ 2.16
ACTN4-208	ENST00000497637	TRPM2	O94759	1503 aa		28.53	■■■□□ 2.16
ACTN4-208	ENST00000497637	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		28.53	■■■□□ 2.16
ACTN4-208	ENST00000497637	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		28.53	■■■□□ 2.16
ACTN4-208	ENST00000497637	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		28.52	■■■□□ 2.16
ACTN4-208	ENST00000497637	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		28.51	■■■□□ 2.15
ACTN4-208	ENST00000497637	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		28.5	■■■□□ 2.15
ACTN4-208	ENST00000497637	EP400	Q96L91	3159 aa		28.48	■■■□□ 2.15
ACTN4-208	ENST00000497637	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		28.48	■■■□□ 2.15
ACTN4-208	ENST00000497637	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	28.48	■■■□□ 2.15
ACTN4-208	ENST00000497637	PTPRU	Q92729	1446 aa		28.48	■■■□□ 2.15
ACTN4-208	ENST00000497637	NEUROD1	Q13562	356 aa		28.46	■■■□□ 2.15
ACTN4-208	ENST00000497637	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	28.45	■■■□□ 2.14
ACTN4-208	ENST00000497637	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	28.43	■■■□□ 2.14
ACTN4-208	ENST00000497637	PTCH1	Q13635	1447 aa		28.42	■■■□□ 2.14
ACTN4-208	ENST00000497637	ATRN	O75882	1429 aa		28.4	■■■□□ 2.14
ACTN4-208	ENST00000497637	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	28.39	■■■□□ 2.14
ACTN4-208	ENST00000497637	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		28.38	■■■□□ 2.13
ACTN4-208	ENST00000497637	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	28.36	■■■□□ 2.13

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 80.1 ms