RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496824.5

PFKL-210, Transcript of phosphofructokinase, liver type, humanhuman

TSL 5

Gene PFKL, Length 1,063 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKL-210ENST00000496824 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa30.41■■■□□ 2.46
PFKL-210ENST00000496824 SLC52A1Q9NWF4 448 aa30.41■■■□□ 2.46
PFKL-210ENST00000496824 BCANQ96GW7 911 aa30.4■■■□□ 2.46
PFKL-210ENST00000496824 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa30.39■■■□□ 2.45
PFKL-210ENST00000496824 KCNA6P17658 529 aa30.38■■■□□ 2.45
PFKL-210ENST00000496824 ZFYVE9O95405 1425 aa30.38■■■□□ 2.45
PFKL-210ENST00000496824 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP30.37■■■□□ 2.45
PFKL-210ENST00000496824 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP30.36■■■□□ 2.45
PFKL-210ENST00000496824 RIMS2Q9UQ26 1411 aa30.35■■■□□ 2.45
PFKL-210ENST00000496824 IQGAP3Q86VI3 1631 aa30.35■■■□□ 2.45
PFKL-210ENST00000496824 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP30.35■■■□□ 2.45
PFKL-210ENST00000496824 FAM135BQ49AJ0 1406 aa30.31■■■□□ 2.44
PFKL-210ENST00000496824 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP30.31■■■□□ 2.44
PFKL-210ENST00000496824 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa30.3■■■□□ 2.44
PFKL-210ENST00000496824 CHGAP10645 457 aaKnown RBP30.29■■■□□ 2.44
PFKL-210ENST00000496824 ROCK1Q13464 1354 aa30.28■■■□□ 2.44
PFKL-210ENST00000496824 ITGAEP38570 1179 aa30.28■■■□□ 2.44
PFKL-210ENST00000496824 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP30.28■■■□□ 2.44
PFKL-210ENST00000496824 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP30.25■■■□□ 2.43
PFKL-210ENST00000496824 MSH6P52701 1360 aa30.24■■■□□ 2.43
PFKL-210ENST00000496824 PHLPP1O60346 1717 aa30.22■■■□□ 2.43
PFKL-210ENST00000496824 NUP155O75694 1391 aa30.2■■■□□ 2.43
PFKL-210ENST00000496824 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP30.19■■■□□ 2.42
PFKL-210ENST00000496824 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa30.18■■■□□ 2.42
PFKL-210ENST00000496824 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa30.17■■■□□ 2.42
PFKL-210ENST00000496824 DIP2AQ14689 1571 aa30.17■■■□□ 2.42
PFKL-210ENST00000496824 HDGFP51858 240 aaKnown RBP30.17■■■□□ 2.42
PFKL-210ENST00000496824 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP30.14■■■□□ 2.42
PFKL-210ENST00000496824 SLAIN2Q9P270 581 aa30.13■■■□□ 2.41
PFKL-210ENST00000496824 TBX22Q9Y458 520 aa30.13■■■□□ 2.41
PFKL-210ENST00000496824 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP30.13■■■□□ 2.41
PFKL-210ENST00000496824 TRPM2O94759 1503 aa30.1■■■□□ 2.41
PFKL-210ENST00000496824 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP30.09■■■□□ 2.41
PFKL-210ENST00000496824 C14orf37Q86TY3 774 aa30.09■■■□□ 2.41
PFKL-210ENST00000496824 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa30.08■■■□□ 2.41
PFKL-210ENST00000496824 PTPRUQ92729 1446 aa30.05■■■□□ 2.4
PFKL-210ENST00000496824 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa30.03■■■□□ 2.4
PFKL-210ENST00000496824 PIK3R4Q99570 1358 aa30.03■■■□□ 2.4
PFKL-210ENST00000496824 POTEAQ6S8J7 498 aa30.02■■■□□ 2.4
PFKL-210ENST00000496824 CLTCL1P53675 1640 aa30.02■■■□□ 2.4
PFKL-210ENST00000496824 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP30.02■■■□□ 2.4
PFKL-210ENST00000496824 JCADQ9P266 1359 aa30■■■□□ 2.39
PFKL-210ENST00000496824 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa29.99■■■□□ 2.39
PFKL-210ENST00000496824 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP29.99■■■□□ 2.39
PFKL-210ENST00000496824 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa29.98■■■□□ 2.39
PFKL-210ENST00000496824 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP29.97■■■□□ 2.39
PFKL-210ENST00000496824 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP29.96■■■□□ 2.39
PFKL-210ENST00000496824 ATF3P18847 181 aa29.95■■■□□ 2.39
PFKL-210ENST00000496824 C19orf44Q9H6X5 657 aa29.95■■■□□ 2.39
PFKL-210ENST00000496824 KIF1BO60333 1816 aa29.94■■■□□ 2.38
PFKL-210ENST00000496824 LRP6O75581 1613 aa29.94■■■□□ 2.38
PFKL-210ENST00000496824 CADPS2Q86UW7 1296 aa29.94■■■□□ 2.38
PFKL-210ENST00000496824 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa29.93■■■□□ 2.38
PFKL-210ENST00000496824 SHPRHQ149N8 1683 aa29.93■■■□□ 2.38
PFKL-210ENST00000496824 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP29.93■■■□□ 2.38
PFKL-210ENST00000496824 NAIPQ13075 1403 aa29.9■■■□□ 2.38
PFKL-210ENST00000496824 METP08581 1390 aa29.9■■■□□ 2.38
PFKL-210ENST00000496824 NALCNQ8IZF0 1738 aa29.88■■■□□ 2.37
PFKL-210ENST00000496824 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa29.86■■■□□ 2.37
PFKL-210ENST00000496824 BRINP3Q76B58 766 aa29.85■■■□□ 2.37
PFKL-210ENST00000496824 DCCP43146 1447 aa29.85■■■□□ 2.37
PFKL-210ENST00000496824 NHSL1Q5SYE7 1610 aa29.82■■■□□ 2.36
PFKL-210ENST00000496824 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa29.82■■■□□ 2.36
PFKL-210ENST00000496824 MST1RQ04912 1400 aa29.81■■■□□ 2.36
PFKL-210ENST00000496824 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP29.81■■■□□ 2.36
PFKL-210ENST00000496824 TRIM52Q96A61 297 aa29.77■■■□□ 2.36
PFKL-210ENST00000496824 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa29.77■■■□□ 2.36
PFKL-210ENST00000496824 HFM1A2PYH4 1435 aa29.75■■■□□ 2.35
PFKL-210ENST00000496824 PPLO60437 1756 aa29.74■■■□□ 2.35
PFKL-210ENST00000496824 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP29.73■■■□□ 2.35
PFKL-210ENST00000496824 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP29.73■■■□□ 2.35
PFKL-210ENST00000496824 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP29.73■■■□□ 2.35
PFKL-210ENST00000496824 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP29.71■■■□□ 2.35
PFKL-210ENST00000496824 SETD5Q9C0A6 1442 aa29.69■■■□□ 2.34
PFKL-210ENST00000496824 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP29.67■■■□□ 2.34
PFKL-210ENST00000496824 PTCH1Q13635 1447 aa29.66■■■□□ 2.34
PFKL-210ENST00000496824 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP29.66■■■□□ 2.34
PFKL-210ENST00000496824 ROBO2Q9HCK4 1378 aa29.64■■■□□ 2.34
PFKL-210ENST00000496824 FOXD1Q16676 465 aa29.63■■■□□ 2.33
PFKL-210ENST00000496824 C1orf167Q5SNV9 1468 aa29.62■■■□□ 2.33
PFKL-210ENST00000496824 VGFO15240 615 aaPredicted RBP29.62■■■□□ 2.33
PFKL-210ENST00000496824 PNPLA6Q8IY17 1366 aa29.6■■■□□ 2.33
PFKL-210ENST00000496824 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP29.59■■■□□ 2.33
PFKL-210ENST00000496824 AFF2P51816 1311 aa29.59■■■□□ 2.33
PFKL-210ENST00000496824 LAMC1P11047 1609 aa29.58■■■□□ 2.33
PFKL-210ENST00000496824 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa29.56■■■□□ 2.32
PFKL-210ENST00000496824 IFT172Q9UG01 1749 aa29.56■■■□□ 2.32
PFKL-210ENST00000496824 PRAG1Q86YV5 1406 aa29.55■■■□□ 2.32
PFKL-210ENST00000496824 RXRBP28702 533 aa29.54■■■□□ 2.32
PFKL-210ENST00000496824 C8orf37Q96NL8 207 aa29.54■■■□□ 2.32
PFKL-210ENST00000496824 ORAI2Q96SN7 254 aa29.54■■■□□ 2.32
PFKL-210ENST00000496824 CCDC144AA2RUR9 1427 aa29.5■■■□□ 2.31
PFKL-210ENST00000496824 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa29.49■■■□□ 2.31
PFKL-210ENST00000496824 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa29.48■■■□□ 2.31
PFKL-210ENST00000496824 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP29.48■■■□□ 2.31
PFKL-210ENST00000496824 ADAMTS2O95450 1211 aa29.47■■■□□ 2.31
PFKL-210ENST00000496824 RGL3Q3MIN7 710 aa29.47■■■□□ 2.31
PFKL-210ENST00000496824 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP29.47■■■□□ 2.31
PFKL-210ENST00000496824 RGS12O14924 1447 aa29.45■■■□□ 2.3
PFKL-210ENST00000496824 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa29.45■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.3 ms