RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486161.5

PTPRD-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 5,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-211ENST00000486161 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP10.82□□□□□ -0.68
PTPRD-211ENST00000486161 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP10.81□□□□□ -0.68
PTPRD-211ENST00000486161 CNTLNQ9NXG0 1405 aa10.81□□□□□ -0.68
PTPRD-211ENST00000486161 TTC37Q6PGP7 1564 aa10.81□□□□□ -0.68
PTPRD-211ENST00000486161 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP10.8□□□□□ -0.68
PTPRD-211ENST00000486161 BCL11AQ9H165 835 aa10.8□□□□□ -0.68
PTPRD-211ENST00000486161 MYT1Q01538 1121 aa10.8□□□□□ -0.68
PTPRD-211ENST00000486161 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa10.8□□□□□ -0.68
PTPRD-211ENST00000486161 WASHC2AQ641Q2 1341 aa10.79□□□□□ -0.68
PTPRD-211ENST00000486161 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa10.79□□□□□ -0.68
PTPRD-211ENST00000486161 NOS1P29475 1434 aa10.79□□□□□ -0.68
PTPRD-211ENST00000486161 ZMYM3Q14202 1370 aa10.79□□□□□ -0.68
PTPRD-211ENST00000486161 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP10.79□□□□□ -0.68
PTPRD-211ENST00000486161 PREX2Q70Z35 1606 aa10.78□□□□□ -0.68
PTPRD-211ENST00000486161 MAGI2Q86UL8 1455 aa10.78□□□□□ -0.68
PTPRD-211ENST00000486161 CDK19Q9BWU1 502 aa10.78□□□□□ -0.68
PTPRD-211ENST00000486161 ABCC1P33527 1531 aa10.77□□□□□ -0.68
PTPRD-211ENST00000486161 SHROOM2Q13796 1616 aa10.77□□□□□ -0.68
PTPRD-211ENST00000486161 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa10.77□□□□□ -0.68
PTPRD-211ENST00000486161 ARAP3Q8WWN8 1544 aa10.77□□□□□ -0.69
PTPRD-211ENST00000486161 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.69
PTPRD-211ENST00000486161 GPRASP1Q5JY77 1395 aa10.77□□□□□ -0.69
PTPRD-211ENST00000486161 CCDC136Q96JN2 1154 aa10.77□□□□□ -0.69
PTPRD-211ENST00000486161 MLH3Q9UHC1 1453 aa10.76□□□□□ -0.69
PTPRD-211ENST00000486161 ATAD2Q6PL18 1390 aa10.76□□□□□ -0.69
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
PTPRD-211ENST00000486161 ESCO1Q5FWF5 840 aa10.75□□□□□ -0.69
PTPRD-211ENST00000486161 ADCY10Q96PN6 1610 aa10.75□□□□□ -0.69
PTPRD-211ENST00000486161 MYH16Q9H6N6 1097 aa10.75□□□□□ -0.69
PTPRD-211ENST00000486161 PZPP20742 1482 aa10.75□□□□□ -0.69
PTPRD-211ENST00000486161 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP10.74□□□□□ -0.69
PTPRD-211ENST00000486161 DMRT2Q9Y5R5 561 aa10.74□□□□□ -0.69
PTPRD-211ENST00000486161 YEATS2Q9ULM3 1422 aa10.74□□□□□ -0.69
PTPRD-211ENST00000486161 LMOD3Q0VAK6 560 aa10.74□□□□□ -0.69
PTPRD-211ENST00000486161 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa10.74□□□□□ -0.69
PTPRD-211ENST00000486161 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa10.74□□□□□ -0.69
PTPRD-211ENST00000486161 MS4A1P11836 297 aa10.73□□□□□ -0.69
PTPRD-211ENST00000486161 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
PTPRD-211ENST00000486161 CABP1Q9NZU7 370 aa10.73□□□□□ -0.69
PTPRD-211ENST00000486161 ADGBQ8N7X0 1667 aa10.73□□□□□ -0.69
PTPRD-211ENST00000486161 GGNBP2Q9H3C7 697 aa10.73□□□□□ -0.69
PTPRD-211ENST00000486161 MAST1Q9Y2H9 1570 aa10.73□□□□□ -0.69
PTPRD-211ENST00000486161 NLRP6P59044 892 aa10.73□□□□□ -0.69
PTPRD-211ENST00000486161 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
PTPRD-211ENST00000486161 CCDC61Q9Y6R9 512 aa10.73□□□□□ -0.69
PTPRD-211ENST00000486161 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa10.72□□□□□ -0.69
PTPRD-211ENST00000486161 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa10.72□□□□□ -0.69
PTPRD-211ENST00000486161 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa10.72□□□□□ -0.69
PTPRD-211ENST00000486161 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP10.72□□□□□ -0.69
PTPRD-211ENST00000486161 RIMS2Q9UQ26 1411 aa10.72□□□□□ -0.69
PTPRD-211ENST00000486161 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP10.72□□□□□ -0.69
PTPRD-211ENST00000486161 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa10.72□□□□□ -0.69
PTPRD-211ENST00000486161 CHMP4AQ9BY43 222 aa10.72□□□□□ -0.69
PTPRD-211ENST00000486161 WAPLQ7Z5K2 1190 aa10.72□□□□□ -0.69
PTPRD-211ENST00000486161 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.69
PTPRD-211ENST00000486161 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.69
PTPRD-211ENST00000486161 ARXQ96QS3 562 aa10.71□□□□□ -0.7
PTPRD-211ENST00000486161 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
PTPRD-211ENST00000486161 ABTB2Q8N961 1025 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRD-211ENST00000486161 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
PTPRD-211ENST00000486161 EVA1CP58658 441 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRD-211ENST00000486161 CCDC146Q8IYE0 955 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRD-211ENST00000486161 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
PTPRD-211ENST00000486161 PDE3BQ13370 1112 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRD-211ENST00000486161 TSPOAP1O95153 1857 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRD-211ENST00000486161 HECW2Q9P2P5 1572 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRD-211ENST00000486161 GCC2Q8IWJ2 1684 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRD-211ENST00000486161 GOLGA2Q08379 1002 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRD-211ENST00000486161 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRD-211ENST00000486161 NGEFQ8N5V2 710 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRD-211ENST00000486161 PRAG1Q86YV5 1406 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRD-211ENST00000486161 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRD-211ENST00000486161 ABCA9Q8IUA7 1624 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRD-211ENST00000486161 WASLO00401 505 aaPredicted RBP10.67□□□□□ -0.7
PTPRD-211ENST00000486161 NUTM2GQ5VZR2 741 aa10.67□□□□□ -0.7
PTPRD-211ENST00000486161 RALGAPBQ86X10 1494 aa10.67□□□□□ -0.7
PTPRD-211ENST00000486161 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
PTPRD-211ENST00000486161 NPATQ14207 1427 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRD-211ENST00000486161 MTHFSP49914 203 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRD-211ENST00000486161 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa10.65□□□□□ -0.7
PTPRD-211ENST00000486161 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
PTPRD-211ENST00000486161 C1orf141Q5JVX7 400 aa10.65□□□□□ -0.7
PTPRD-211ENST00000486161 PPP2R1AP30153 589 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRD-211ENST00000486161 TBX22Q9Y458 520 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRD-211ENST00000486161 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
PTPRD-211ENST00000486161 KDM5DQ9BY66 1539 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRD-211ENST00000486161 NINLQ9Y2I6 1382 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRD-211ENST00000486161 RCAN3Q9UKA8 241 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRD-211ENST00000486161 CADPS2Q86UW7 1296 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRD-211ENST00000486161 RUNDC1Q96C34 613 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRD-211ENST00000486161 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
PTPRD-211ENST00000486161 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
PTPRD-211ENST00000486161 STK31Q9BXU1 1019 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRD-211ENST00000486161 PHF8Q9UPP1 1060 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRD-211ENST00000486161 PLXNC1O60486 1568 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRD-211ENST00000486161 APAF1O14727 1248 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRD-211ENST00000486161 NSD3Q9BZ95 1437 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRD-211ENST00000486161 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRD-211ENST00000486161 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
PTPRD-211ENST00000486161 TEFQ10587 303 aa10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.1 ms