RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486115.1

C7orf49-210, humanhuman

TSL 2

Gene C7orf49, Length 578 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C7orf49-210ENST00000486115 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa26.43■■□□□ 1.82
C7orf49-210ENST00000486115 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
C7orf49-210ENST00000486115 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa26.42■■□□□ 1.82
C7orf49-210ENST00000486115 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
C7orf49-210ENST00000486115 DMRT2Q9Y5R5 561 aa26.42■■□□□ 1.82
C7orf49-210ENST00000486115 STRCQ7RTU9 1775 aa26.39■■□□□ 1.82
C7orf49-210ENST00000486115 MED14O60244 1454 aa26.39■■□□□ 1.82
C7orf49-210ENST00000486115 LTKP29376 864 aa26.38■■□□□ 1.81
C7orf49-210ENST00000486115 RGL3Q3MIN7 710 aa26.38■■□□□ 1.81
C7orf49-210ENST00000486115 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa26.38■■□□□ 1.81
C7orf49-210ENST00000486115 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
C7orf49-210ENST00000486115 CLSPNQ9HAW4 1339 aa26.38■■□□□ 1.81
C7orf49-210ENST00000486115 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa26.34■■□□□ 1.81
C7orf49-210ENST00000486115 VGFO15240 615 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
C7orf49-210ENST00000486115 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
C7orf49-210ENST00000486115 IQGAP1P46940 1657 aa26.32■■□□□ 1.8
C7orf49-210ENST00000486115 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP26.31■■□□□ 1.8
C7orf49-210ENST00000486115 SIN3AQ96ST3 1273 aa26.31■■□□□ 1.8
C7orf49-210ENST00000486115 NEUROD1Q13562 356 aa26.3■■□□□ 1.8
C7orf49-210ENST00000486115 BCANQ96GW7 911 aa26.3■■□□□ 1.8
C7orf49-210ENST00000486115 PPLO60437 1756 aa26.3■■□□□ 1.8
C7orf49-210ENST00000486115 STAC3Q96MF2 364 aa26.29■■□□□ 1.8
C7orf49-210ENST00000486115 MYOM2P54296 1465 aa26.27■■□□□ 1.8
C7orf49-210ENST00000486115 IFT172Q9UG01 1749 aa26.27■■□□□ 1.8
C7orf49-210ENST00000486115 DIP2AQ14689 1571 aa26.24■■□□□ 1.79
C7orf49-210ENST00000486115 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa26.24■■□□□ 1.79
C7orf49-210ENST00000486115 DCAF11Q8TEB1 546 aa26.23■■□□□ 1.79
C7orf49-210ENST00000486115 TONSLQ96HA7 1378 aa26.21■■□□□ 1.79
C7orf49-210ENST00000486115 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa26.2■■□□□ 1.79
C7orf49-210ENST00000486115 NRXN1Q9ULB1 1477 aa26.18■■□□□ 1.78
C7orf49-210ENST00000486115 PIK3C2GO75747 1445 aa26.18■■□□□ 1.78
C7orf49-210ENST00000486115 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa26.18■■□□□ 1.78
C7orf49-210ENST00000486115 SLC26A8Q96RN1 970 aa26.18■■□□□ 1.78
C7orf49-210ENST00000486115 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
C7orf49-210ENST00000486115 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa26.18■■□□□ 1.78
C7orf49-210ENST00000486115 TBX22Q9Y458 520 aa26.18■■□□□ 1.78
C7orf49-210ENST00000486115 L3MBTL2Q969R5 705 aa26.17■■□□□ 1.78
C7orf49-210ENST00000486115 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa26.16■■□□□ 1.78
C7orf49-210ENST00000486115 PIK3R4Q99570 1358 aa26.14■■□□□ 1.78
C7orf49-210ENST00000486115 ALKQ9UM73 1620 aa26.12■■□□□ 1.77
C7orf49-210ENST00000486115 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa26.11■■□□□ 1.77
C7orf49-210ENST00000486115 LAMC1P11047 1609 aa26.1■■□□□ 1.77
C7orf49-210ENST00000486115 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
C7orf49-210ENST00000486115 PRAG1Q86YV5 1406 aa26.08■■□□□ 1.77
C7orf49-210ENST00000486115 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
C7orf49-210ENST00000486115 KCNA6P17658 529 aa26.06■■□□□ 1.76
C7orf49-210ENST00000486115 NWD1Q149M9 1564 aa26.05■■□□□ 1.76
C7orf49-210ENST00000486115 METP08581 1390 aa26.05■■□□□ 1.76
C7orf49-210ENST00000486115 CPS1P31327 1500 aa26.04■■□□□ 1.76
C7orf49-210ENST00000486115 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
C7orf49-210ENST00000486115 CFAP70Q5T0N1 1121 aa26.03■■□□□ 1.76
C7orf49-210ENST00000486115 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
C7orf49-210ENST00000486115 LTBP4Q8N2S1 1624 aa26■■□□□ 1.75
C7orf49-210ENST00000486115 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa25.99■■□□□ 1.75
C7orf49-210ENST00000486115 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
C7orf49-210ENST00000486115 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa25.99■■□□□ 1.75
C7orf49-210ENST00000486115 PTPRUQ92729 1446 aa25.98■■□□□ 1.75
C7orf49-210ENST00000486115 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa25.98■■□□□ 1.75
C7orf49-210ENST00000486115 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
C7orf49-210ENST00000486115 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
C7orf49-210ENST00000486115 TMEM132EQ6IEE7 984 aa25.95■■□□□ 1.74
C7orf49-210ENST00000486115 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
C7orf49-210ENST00000486115 STRCP1A6NGW2 1772 aa25.95■■□□□ 1.74
C7orf49-210ENST00000486115 PTCH1Q13635 1447 aa25.94■■□□□ 1.74
C7orf49-210ENST00000486115 ADGRB1O14514 1584 aa25.94■■□□□ 1.74
C7orf49-210ENST00000486115 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
C7orf49-210ENST00000486115 ABCC11Q96J66 1382 aa25.92■■□□□ 1.74
C7orf49-210ENST00000486115 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa25.92■■□□□ 1.74
C7orf49-210ENST00000486115 TECPR2O15040 1411 aa25.91■■□□□ 1.74
C7orf49-210ENST00000486115 LRRC7Q96NW7 1537 aa25.91■■□□□ 1.74
C7orf49-210ENST00000486115 NBPF8Q3BBV2 869 aa25.9■■□□□ 1.74
C7orf49-210ENST00000486115 STK26Q9P289 416 aa25.9■■□□□ 1.74
C7orf49-210ENST00000486115 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
C7orf49-210ENST00000486115 RALGAPBQ86X10 1494 aa25.9■■□□□ 1.74
C7orf49-210ENST00000486115 IQSEC2Q5JU85 1478 aa25.89■■□□□ 1.73
C7orf49-210ENST00000486115 KNDC1Q76NI1 1749 aa25.88■■□□□ 1.73
C7orf49-210ENST00000486115 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa25.88■■□□□ 1.73
C7orf49-210ENST00000486115 TMEM94Q12767 1356 aa25.87■■□□□ 1.73
C7orf49-210ENST00000486115 CERKQ8TCT0 537 aa25.87■■□□□ 1.73
C7orf49-210ENST00000486115 NBPF1Q3BBV0 1214 aa25.86■■□□□ 1.73
C7orf49-210ENST00000486115 DLC1Q96QB1 1528 aa25.86■■□□□ 1.73
C7orf49-210ENST00000486115 ROBO2Q9HCK4 1378 aa25.85■■□□□ 1.73
C7orf49-210ENST00000486115 FAM135BQ49AJ0 1406 aa25.85■■□□□ 1.73
C7orf49-210ENST00000486115 GPRASP1Q5JY77 1395 aa25.84■■□□□ 1.73
C7orf49-210ENST00000486115 SIRT1Q96EB6 747 aa25.84■■□□□ 1.73
C7orf49-210ENST00000486115 TRAK1Q9UPV9 953 aa25.82■■□□□ 1.72
C7orf49-210ENST00000486115 C14orf37Q86TY3 774 aa25.81■■□□□ 1.72
C7orf49-210ENST00000486115 CARD11Q9BXL7 1154 aa25.8■■□□□ 1.72
C7orf49-210ENST00000486115 MSH6P52701 1360 aa25.79■■□□□ 1.72
C7orf49-210ENST00000486115 POGKQ9P215 609 aa25.78■■□□□ 1.72
C7orf49-210ENST00000486115 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
C7orf49-210ENST00000486115 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
C7orf49-210ENST00000486115 PRAM1Q96QH2 718 aa25.77■■□□□ 1.72
C7orf49-210ENST00000486115 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa25.77■■□□□ 1.72
C7orf49-210ENST00000486115 WAPLQ7Z5K2 1190 aa25.75■■□□□ 1.71
C7orf49-210ENST00000486115 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
C7orf49-210ENST00000486115 C19orf44Q9H6X5 657 aa25.74■■□□□ 1.71
C7orf49-210ENST00000486115 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
C7orf49-210ENST00000486115 DCCP43146 1447 aa25.73■■□□□ 1.71
C7orf49-210ENST00000486115 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.2 ms