RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481477.5

SETD4-215, Transcript of SET domain containing 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SETD4, Length 2,761 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD4-215ENST00000481477 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa16.28■□□□□ 0.2
SETD4-215ENST00000481477 TRPM2O94759 1503 aa16.28■□□□□ 0.2
SETD4-215ENST00000481477 RALBP1Q15311 655 aa16.28■□□□□ 0.2
SETD4-215ENST00000481477 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa16.28■□□□□ 0.2
SETD4-215ENST00000481477 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa16.28■□□□□ 0.2
SETD4-215ENST00000481477 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.2
SETD4-215ENST00000481477 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa16.26■□□□□ 0.19
SETD4-215ENST00000481477 TMEM132EQ6IEE7 984 aa16.26■□□□□ 0.19
SETD4-215ENST00000481477 NLRP13Q86W25 1043 aa16.26■□□□□ 0.19
SETD4-215ENST00000481477 PTPRTO14522 1441 aa16.25■□□□□ 0.19
SETD4-215ENST00000481477 MADDQ8WXG6 1647 aa16.25■□□□□ 0.19
SETD4-215ENST00000481477 PLEKHG5O94827 1062 aa16.25■□□□□ 0.19
SETD4-215ENST00000481477 MROH1Q8NDA8 1641 aa16.25■□□□□ 0.19
SETD4-215ENST00000481477 TET3O43151 1660 aa16.25■□□□□ 0.19
SETD4-215ENST00000481477 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
SETD4-215ENST00000481477 TRAK1Q9UPV9 953 aa16.24■□□□□ 0.19
SETD4-215ENST00000481477 DEPDC5O75140 1603 aa16.24■□□□□ 0.19
SETD4-215ENST00000481477 BRPF3Q9ULD4 1205 aa16.24■□□□□ 0.19
SETD4-215ENST00000481477 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
SETD4-215ENST00000481477 NUDCQ9Y266 331 aa16.23■□□□□ 0.19
SETD4-215ENST00000481477 KNSTRNQ9Y448 316 aa16.23■□□□□ 0.19
SETD4-215ENST00000481477 POGZQ7Z3K3 1410 aa16.23■□□□□ 0.19
SETD4-215ENST00000481477 CEP152O94986 1710 aa16.23■□□□□ 0.19
SETD4-215ENST00000481477 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
SETD4-215ENST00000481477 PARD3Q8TEW0 1356 aa16.22■□□□□ 0.19
SETD4-215ENST00000481477 CDCA7LQ96GN5 454 aa16.21■□□□□ 0.19
SETD4-215ENST00000481477 RNF123Q5XPI4 1314 aa16.21■□□□□ 0.19
SETD4-215ENST00000481477 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.19
SETD4-215ENST00000481477 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP16.21■□□□□ 0.19
SETD4-215ENST00000481477 USP35Q9P2H5 1018 aa16.21■□□□□ 0.19
SETD4-215ENST00000481477 NOS1P29475 1434 aa16.21■□□□□ 0.18
SETD4-215ENST00000481477 NPATQ14207 1427 aa16.19■□□□□ 0.18
SETD4-215ENST00000481477 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
SETD4-215ENST00000481477 VWDEQ8N2E2 1590 aa16.19■□□□□ 0.18
SETD4-215ENST00000481477 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
SETD4-215ENST00000481477 FAM69CQ0P6D2 419 aa16.18■□□□□ 0.18
SETD4-215ENST00000481477 EFCAB6Q5THR3 1501 aa16.18■□□□□ 0.18
SETD4-215ENST00000481477 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
SETD4-215ENST00000481477 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
SETD4-215ENST00000481477 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa16.17■□□□□ 0.18
SETD4-215ENST00000481477 MROH2AA6NES4 1674 aa16.16■□□□□ 0.18
SETD4-215ENST00000481477 YEATS2Q9ULM3 1422 aa16.16■□□□□ 0.18
SETD4-215ENST00000481477 MLECQ14165 292 aa16.15■□□□□ 0.18
SETD4-215ENST00000481477 ADAMTS8Q9UP79 889 aa16.15■□□□□ 0.18
SETD4-215ENST00000481477 ABCA6Q8N139 1617 aa16.15■□□□□ 0.18
SETD4-215ENST00000481477 LAMC1P11047 1609 aa16.15■□□□□ 0.18
SETD4-215ENST00000481477 STK26Q9P289 416 aa16.15■□□□□ 0.18
SETD4-215ENST00000481477 PPP2R1AP30153 589 aa16.14■□□□□ 0.17
SETD4-215ENST00000481477 CCDC146Q8IYE0 955 aa16.14■□□□□ 0.17
SETD4-215ENST00000481477 HECW2Q9P2P5 1572 aa16.14■□□□□ 0.17
SETD4-215ENST00000481477 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
SETD4-215ENST00000481477 IQGAP1P46940 1657 aa16.13■□□□□ 0.17
SETD4-215ENST00000481477 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
SETD4-215ENST00000481477 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
SETD4-215ENST00000481477 KIF1BO60333 1816 aa16.12■□□□□ 0.17
SETD4-215ENST00000481477 PDE4AP27815 886 aa16.12■□□□□ 0.17
SETD4-215ENST00000481477 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
SETD4-215ENST00000481477 PLIN1O60240 522 aa16.11■□□□□ 0.17
SETD4-215ENST00000481477 CDCA8Q53HL2 280 aa16.11■□□□□ 0.17
SETD4-215ENST00000481477 MLH3Q9UHC1 1453 aa16.11■□□□□ 0.17
SETD4-215ENST00000481477 CARD14Q9BXL6 1004 aa16.11■□□□□ 0.17
SETD4-215ENST00000481477 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP16.1■□□□□ 0.17
SETD4-215ENST00000481477 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa16.1■□□□□ 0.17
SETD4-215ENST00000481477 IDI1Q13907 227 aa16.1■□□□□ 0.17
SETD4-215ENST00000481477 GSE1Q14687 1217 aa16.1■□□□□ 0.17
SETD4-215ENST00000481477 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa16.1■□□□□ 0.17
SETD4-215ENST00000481477 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
SETD4-215ENST00000481477 TSPOAP1O95153 1857 aa16.09■□□□□ 0.17
SETD4-215ENST00000481477 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
SETD4-215ENST00000481477 ABCC3O15438 1527 aa16.08■□□□□ 0.16
SETD4-215ENST00000481477 BACH2Q9BYV9 841 aa16.08■□□□□ 0.16
SETD4-215ENST00000481477 RCAN3Q9UKA8 241 aa16.07■□□□□ 0.16
SETD4-215ENST00000481477 ERVK-7P63135 1459 aa16.07■□□□□ 0.16
SETD4-215ENST00000481477 CFAP74Q9C0B2 1584 aa16.06■□□□□ 0.16
SETD4-215ENST00000481477 STAC3Q96MF2 364 aa16.06■□□□□ 0.16
SETD4-215ENST00000481477 EXOC6Q8TAG9 804 aa16.05■□□□□ 0.16
SETD4-215ENST00000481477 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
SETD4-215ENST00000481477 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa16.05■□□□□ 0.16
SETD4-215ENST00000481477 MYOM2P54296 1465 aa16.05■□□□□ 0.16
SETD4-215ENST00000481477 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
SETD4-215ENST00000481477 ADGRB3O60242 1522 aa16.04■□□□□ 0.16
SETD4-215ENST00000481477 CABP2Q9NPB3 220 aa16.04■□□□□ 0.16
SETD4-215ENST00000481477 STAG3Q9UJ98 1225 aa16.04■□□□□ 0.16
SETD4-215ENST00000481477 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa16.04■□□□□ 0.16
SETD4-215ENST00000481477 NEO1Q92859 1461 aa16.04■□□□□ 0.16
SETD4-215ENST00000481477 RRP1P56182 461 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
SETD4-215ENST00000481477 NFKBIBQ15653 356 aa16.03■□□□□ 0.16
SETD4-215ENST00000481477 LMTK2Q8IWU2 1503 aa16.03■□□□□ 0.16
SETD4-215ENST00000481477 MYOM1P52179 1685 aa16.02■□□□□ 0.16
SETD4-215ENST00000481477 PODXL2Q9NZ53 605 aa16.02■□□□□ 0.16
SETD4-215ENST00000481477 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa16.02■□□□□ 0.15
SETD4-215ENST00000481477 PIK3C2GO75747 1445 aa16.01■□□□□ 0.15
SETD4-215ENST00000481477 NEUROD2Q15784 382 aa16.01■□□□□ 0.15
SETD4-215ENST00000481477 SYNMO15061 1565 aa16.01■□□□□ 0.15
SETD4-215ENST00000481477 PLPPR3Q6T4P5 718 aa16.01■□□□□ 0.15
SETD4-215ENST00000481477 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
SETD4-215ENST00000481477 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa16.01■□□□□ 0.15
SETD4-215ENST00000481477 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa16■□□□□ 0.15
SETD4-215ENST00000481477 APAF1O14727 1248 aa16■□□□□ 0.15
SETD4-215ENST00000481477 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 98.5 ms