RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469733.5

FAAP20-211, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 2

Gene FAAP20, Length 2,280 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-211ENST00000469733 DIP2BQ9P265 1576 aa23.35■■□□□ 1.33
FAAP20-211ENST00000469733 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
FAAP20-211ENST00000469733 TMC1Q8TDI8 760 aa23.34■■□□□ 1.33
FAAP20-211ENST00000469733 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
FAAP20-211ENST00000469733 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.32
FAAP20-211ENST00000469733 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
FAAP20-211ENST00000469733 NRXN1Q9ULB1 1477 aa23.32■■□□□ 1.32
FAAP20-211ENST00000469733 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa23.32■■□□□ 1.32
FAAP20-211ENST00000469733 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
FAAP20-211ENST00000469733 PARD3Q8TEW0 1356 aa23.31■■□□□ 1.32
FAAP20-211ENST00000469733 FAM69CQ0P6D2 419 aa23.31■■□□□ 1.32
FAAP20-211ENST00000469733 YEATS2Q9ULM3 1422 aa23.31■■□□□ 1.32
FAAP20-211ENST00000469733 CDCA8Q53HL2 280 aa23.3■■□□□ 1.32
FAAP20-211ENST00000469733 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
FAAP20-211ENST00000469733 PANK3Q9H999 370 aa23.29■■□□□ 1.32
FAAP20-211ENST00000469733 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa23.29■■□□□ 1.32
FAAP20-211ENST00000469733 CHGAP10645 457 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
FAAP20-211ENST00000469733 CFAP70Q5T0N1 1121 aa23.29■■□□□ 1.32
FAAP20-211ENST00000469733 NOS1P29475 1434 aa23.28■■□□□ 1.32
FAAP20-211ENST00000469733 PPLO60437 1756 aa23.28■■□□□ 1.32
FAAP20-211ENST00000469733 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa23.27■■□□□ 1.32
FAAP20-211ENST00000469733 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa23.26■■□□□ 1.31
FAAP20-211ENST00000469733 NLRP13Q86W25 1043 aa23.25■■□□□ 1.31
FAAP20-211ENST00000469733 BCANQ96GW7 911 aa23.25■■□□□ 1.31
FAAP20-211ENST00000469733 PIK3C2BO00750 1634 aa23.25■■□□□ 1.31
FAAP20-211ENST00000469733 SYNMO15061 1565 aa23.25■■□□□ 1.31
FAAP20-211ENST00000469733 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
FAAP20-211ENST00000469733 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa23.23■■□□□ 1.31
FAAP20-211ENST00000469733 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa23.23■■□□□ 1.31
FAAP20-211ENST00000469733 TSPOAP1O95153 1857 aa23.23■■□□□ 1.31
FAAP20-211ENST00000469733 SLC24A1O60721 1099 aa23.23■■□□□ 1.31
FAAP20-211ENST00000469733 PIK3C2GO75747 1445 aa23.21■■□□□ 1.31
FAAP20-211ENST00000469733 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
FAAP20-211ENST00000469733 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
FAAP20-211ENST00000469733 MYO3AQ8NEV4 1616 aa23.2■■□□□ 1.3
FAAP20-211ENST00000469733 MYOM1P52179 1685 aa23.18■■□□□ 1.3
FAAP20-211ENST00000469733 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
FAAP20-211ENST00000469733 ERVK-7P63135 1459 aa23.15■■□□□ 1.3
FAAP20-211ENST00000469733 KNSTRNQ9Y448 316 aa23.15■■□□□ 1.3
FAAP20-211ENST00000469733 REREQ9P2R6 1566 aa23.14■■□□□ 1.3
FAAP20-211ENST00000469733 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.3
FAAP20-211ENST00000469733 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa23.14■■□□□ 1.3
FAAP20-211ENST00000469733 PREX1Q8TCU6 1659 aa23.14■■□□□ 1.29
FAAP20-211ENST00000469733 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa23.13■■□□□ 1.29
FAAP20-211ENST00000469733 ADGRB1O14514 1584 aa23.12■■□□□ 1.29
FAAP20-211ENST00000469733 SLC52A1Q9NWF4 448 aa23.12■■□□□ 1.29
FAAP20-211ENST00000469733 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa23.1■■□□□ 1.29
FAAP20-211ENST00000469733 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
FAAP20-211ENST00000469733 VGFO15240 615 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
FAAP20-211ENST00000469733 IDI1Q13907 227 aa23.1■■□□□ 1.29
FAAP20-211ENST00000469733 AGLP35573 1532 aa23.1■■□□□ 1.29
FAAP20-211ENST00000469733 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
FAAP20-211ENST00000469733 NUDCQ9Y266 331 aa23.08■■□□□ 1.29
FAAP20-211ENST00000469733 ERICH6BQ5W0A0 696 aa23.07■■□□□ 1.28
FAAP20-211ENST00000469733 QRICH2Q9H0J4 1663 aa23.07■■□□□ 1.28
FAAP20-211ENST00000469733 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa23.06■■□□□ 1.28
FAAP20-211ENST00000469733 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
FAAP20-211ENST00000469733 TRAK1Q9UPV9 953 aa23.06■■□□□ 1.28
FAAP20-211ENST00000469733 INSRP06213 1382 aa23.06■■□□□ 1.28
FAAP20-211ENST00000469733 KIF13AQ9H1H9 1805 aa23.06■■□□□ 1.28
FAAP20-211ENST00000469733 ZFYVE9O95405 1425 aa23.05■■□□□ 1.28
FAAP20-211ENST00000469733 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa23.05■■□□□ 1.28
FAAP20-211ENST00000469733 PPP6R1Q9UPN7 881 aa23.05■■□□□ 1.28
FAAP20-211ENST00000469733 TMEM132EQ6IEE7 984 aa23.04■■□□□ 1.28
FAAP20-211ENST00000469733 MYO5BQ9ULV0 1848 aa23.04■■□□□ 1.28
FAAP20-211ENST00000469733 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
FAAP20-211ENST00000469733 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa23.02■■□□□ 1.28
FAAP20-211ENST00000469733 PPP2R1AP30153 589 aa23.01■■□□□ 1.27
FAAP20-211ENST00000469733 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
FAAP20-211ENST00000469733 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
FAAP20-211ENST00000469733 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa22.99■■□□□ 1.27
FAAP20-211ENST00000469733 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
FAAP20-211ENST00000469733 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
FAAP20-211ENST00000469733 PDE3BQ13370 1112 aa22.94■■□□□ 1.26
FAAP20-211ENST00000469733 PPP4R2Q9NY27 417 aa22.94■■□□□ 1.26
FAAP20-211ENST00000469733 CARD14Q9BXL6 1004 aa22.93■■□□□ 1.26
FAAP20-211ENST00000469733 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa22.92■■□□□ 1.26
FAAP20-211ENST00000469733 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa22.92■■□□□ 1.26
FAAP20-211ENST00000469733 RNF123Q5XPI4 1314 aa22.92■■□□□ 1.26
FAAP20-211ENST00000469733 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP22.91■■□□□ 1.26
FAAP20-211ENST00000469733 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
FAAP20-211ENST00000469733 STAG3Q9UJ98 1225 aa22.9■■□□□ 1.26
FAAP20-211ENST00000469733 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
FAAP20-211ENST00000469733 EVC2Q86UK5 1308 aa22.9■■□□□ 1.26
FAAP20-211ENST00000469733 MLECQ14165 292 aa22.89■■□□□ 1.25
FAAP20-211ENST00000469733 ADAMTS8Q9UP79 889 aa22.89■■□□□ 1.25
FAAP20-211ENST00000469733 TULP4Q9NRJ4 1543 aa22.88■■□□□ 1.25
FAAP20-211ENST00000469733 NSD3Q9BZ95 1437 aa22.87■■□□□ 1.25
FAAP20-211ENST00000469733 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa22.86■■□□□ 1.25
FAAP20-211ENST00000469733 USP32Q8NFA0 1604 aa22.85■■□□□ 1.25
FAAP20-211ENST00000469733 A2ML1A8K2U0 1454 aa22.84■■□□□ 1.25
FAAP20-211ENST00000469733 ALKQ9UM73 1620 aa22.84■■□□□ 1.25
FAAP20-211ENST00000469733 STK26Q9P289 416 aa22.84■■□□□ 1.25
FAAP20-211ENST00000469733 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
FAAP20-211ENST00000469733 PTPRMP28827 1452 aa22.83■■□□□ 1.24
FAAP20-211ENST00000469733 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.24
FAAP20-211ENST00000469733 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
FAAP20-211ENST00000469733 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP22.8■■□□□ 1.24
FAAP20-211ENST00000469733 RIMS2Q9UQ26 1411 aa22.79■■□□□ 1.24
FAAP20-211ENST00000469733 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.6 ms