RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459697.1

RABGGTB-203, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 1,177 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-203ENST00000459697 WBP1LQ9NX94 342 aa9.7□□□□□ -0.86
RABGGTB-203ENST00000459697 TOP2BQ02880 1626 aa9.7□□□□□ -0.86
RABGGTB-203ENST00000459697 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
RABGGTB-203ENST00000459697 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
RABGGTB-203ENST00000459697 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
RABGGTB-203ENST00000459697 PACS2Q86VP3 889 aa9.68□□□□□ -0.86
RABGGTB-203ENST00000459697 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
RABGGTB-203ENST00000459697 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
RABGGTB-203ENST00000459697 LRCH3Q96II8 777 aa9.67□□□□□ -0.86
RABGGTB-203ENST00000459697 E2F4Q16254 413 aa9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-203ENST00000459697 WDR70Q9NW82 654 aa9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-203ENST00000459697 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-203ENST00000459697 KCNC4Q03721 635 aa9.65□□□□□ -0.86
RABGGTB-203ENST00000459697 TSKSQ9UJT2 592 aa9.65□□□□□ -0.86
RABGGTB-203ENST00000459697 HPS5Q9UPZ3 1129 aa9.65□□□□□ -0.86
RABGGTB-203ENST00000459697 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
RABGGTB-203ENST00000459697 MAPKBP1O60336 1514 aa9.63□□□□□ -0.87
RABGGTB-203ENST00000459697 CFAP44Q96MT7 982 aa9.63□□□□□ -0.87
RABGGTB-203ENST00000459697 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
RABGGTB-203ENST00000459697 GRXCR2A6NFK2 248 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGGTB-203ENST00000459697 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
RABGGTB-203ENST00000459697 CDCA7LQ96GN5 454 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGGTB-203ENST00000459697 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
RABGGTB-203ENST00000459697 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
RABGGTB-203ENST00000459697 CEP170Q5SW79 1584 aa9.6□□□□□ -0.87
RABGGTB-203ENST00000459697 PRSS12P56730 875 aa9.6□□□□□ -0.87
RABGGTB-203ENST00000459697 PPP4CP60510 307 aa9.6□□□□□ -0.87
RABGGTB-203ENST00000459697 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
RABGGTB-203ENST00000459697 SMAPO00193 183 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTB-203ENST00000459697 PRDM2Q13029 1718 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTB-203ENST00000459697 ABCC8Q09428 1581 aa9.58□□□□□ -0.88
RABGGTB-203ENST00000459697 DNMBPQ6XZF7 1577 aa9.58□□□□□ -0.88
RABGGTB-203ENST00000459697 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
RABGGTB-203ENST00000459697 SAMD7Q7Z3H4 446 aa9.57□□□□□ -0.88
RABGGTB-203ENST00000459697 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa9.57□□□□□ -0.88
RABGGTB-203ENST00000459697 TATDN2Q93075 761 aa9.56□□□□□ -0.88
RABGGTB-203ENST00000459697 FAM198AQ9UFP1 575 aa9.56□□□□□ -0.88
RABGGTB-203ENST00000459697 PNMA3Q9UL41 463 aa9.56□□□□□ -0.88
RABGGTB-203ENST00000459697 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
RABGGTB-203ENST00000459697 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
RABGGTB-203ENST00000459697 NBPF26B4DH59 902 aa9.55□□□□□ -0.88
RABGGTB-203ENST00000459697 OSBPP22059 807 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGGTB-203ENST00000459697 HSPA2P54652 639 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGGTB-203ENST00000459697 WIZO95785 1651 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGGTB-203ENST00000459697 HDGFP51858 240 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
RABGGTB-203ENST00000459697 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
RABGGTB-203ENST00000459697 PTPRMP28827 1452 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGGTB-203ENST00000459697 GRIN2BQ13224 1484 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGGTB-203ENST00000459697 C3orf80F5H4A9 247 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGGTB-203ENST00000459697 CDHR5Q9HBB8 845 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGGTB-203ENST00000459697 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
RABGGTB-203ENST00000459697 NUDT18Q6ZVK8 323 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGGTB-203ENST00000459697 SOGA1O94964 1423 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTB-203ENST00000459697 RNF40O75150 1001 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTB-203ENST00000459697 TJAP1Q5JTD0 557 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTB-203ENST00000459697 Q6ZNB5 142 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTB-203ENST00000459697 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
RABGGTB-203ENST00000459697 WDR97A6NE52 1622 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTB-203ENST00000459697 SHROOM2Q13796 1616 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGGTB-203ENST00000459697 ADCY10Q96PN6 1610 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGGTB-203ENST00000459697 MTRQ99707 1265 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGGTB-203ENST00000459697 IL21Q9HBE4 155 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGGTB-203ENST00000459697 KIF21BO75037 1637 aa9.46□□□□□ -0.89
RABGGTB-203ENST00000459697 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
RABGGTB-203ENST00000459697 PADI6Q6TGC4 694 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGGTB-203ENST00000459697 NECTIN2Q92692 538 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGGTB-203ENST00000459697 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
RABGGTB-203ENST00000459697 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
RABGGTB-203ENST00000459697 PBRM1Q86U86 1689 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGGTB-203ENST00000459697 APLP1P51693 650 aa9.43□□□□□ -0.9
RABGGTB-203ENST00000459697 LAPTM4AQ15012 233 aa9.43□□□□□ -0.9
RABGGTB-203ENST00000459697 TTC13Q8NBP0 860 aa9.43□□□□□ -0.9
RABGGTB-203ENST00000459697 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGGTB-203ENST00000459697 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
RABGGTB-203ENST00000459697 PPP1R18Q6NYC8 613 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGGTB-203ENST00000459697 SLF2Q8IX21 1173 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGGTB-203ENST00000459697 ZNF516Q92618 1163 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGGTB-203ENST00000459697 GRIN2AQ12879 1464 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGGTB-203ENST00000459697 SLC4A3P48751 1232 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGGTB-203ENST00000459697 PRKD2Q9BZL6 878 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGGTB-203ENST00000459697 GFRA3O60609 400 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGGTB-203ENST00000459697 NUP160Q12769 1436 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGGTB-203ENST00000459697 ADAMTSL3P82987 1691 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGGTB-203ENST00000459697 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
RABGGTB-203ENST00000459697 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
RABGGTB-203ENST00000459697 TEX14Q8IWB6 1497 aa9.38□□□□□ -0.91
RABGGTB-203ENST00000459697 GLI2P10070 1586 aa9.37□□□□□ -0.91
RABGGTB-203ENST00000459697 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
RABGGTB-203ENST00000459697 COPS2P61201 443 aa9.37□□□□□ -0.91
RABGGTB-203ENST00000459697 NKX2-3Q8TAU0 364 aa9.37□□□□□ -0.91
RABGGTB-203ENST00000459697 EYA1Q99502 592 aa9.37□□□□□ -0.91
RABGGTB-203ENST00000459697 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa9.36□□□□□ -0.91
RABGGTB-203ENST00000459697 V9GY48 417 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
RABGGTB-203ENST00000459697 GGCXP38435 758 aa9.35□□□□□ -0.91
RABGGTB-203ENST00000459697 MADDQ8WXG6 1647 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGGTB-203ENST00000459697 FGD5Q6ZNL6 1462 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGGTB-203ENST00000459697 PRR14Q9BWN1 585 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGGTB-203ENST00000459697 TRAF7Q6Q0C0 670 aa9.33□□□□□ -0.92
RABGGTB-203ENST00000459697 KCNV2Q8TDN2 545 aa9.33□□□□□ -0.92
RABGGTB-203ENST00000459697 ASXL2Q76L83 1435 aa9.32□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 6.9 ms