RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444040.6

SHQ1-202, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 2

Gene SHQ1, Length 2,844 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-202ENST00000444040 EFCAB6Q5THR3 1501 aa21.4■■□□□ 1.02
SHQ1-202ENST00000444040 RRP1P56182 461 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
SHQ1-202ENST00000444040 MYOM2P54296 1465 aa21.39■■□□□ 1.01
SHQ1-202ENST00000444040 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
SHQ1-202ENST00000444040 RCAN3Q9UKA8 241 aa21.38■■□□□ 1.01
SHQ1-202ENST00000444040 KNSTRNQ9Y448 316 aa21.37■■□□□ 1.01
SHQ1-202ENST00000444040 LMTK2Q8IWU2 1503 aa21.37■■□□□ 1.01
SHQ1-202ENST00000444040 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa21.37■■□□□ 1.01
SHQ1-202ENST00000444040 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa21.37■■□□□ 1.01
SHQ1-202ENST00000444040 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
SHQ1-202ENST00000444040 CDCA7LQ96GN5 454 aa21.36■■□□□ 1.01
SHQ1-202ENST00000444040 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
SHQ1-202ENST00000444040 MYOM1P52179 1685 aa21.35■■□□□ 1.01
SHQ1-202ENST00000444040 PPP2R1AP30153 589 aa21.34■■□□□ 1.01
SHQ1-202ENST00000444040 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa21.34■■□□□ 1.01
SHQ1-202ENST00000444040 CFAP70Q5T0N1 1121 aa21.34■■□□□ 1.01
SHQ1-202ENST00000444040 ABCA6Q8N139 1617 aa21.34■■□□□ 1.01
SHQ1-202ENST00000444040 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa21.32■■□□□ 1
SHQ1-202ENST00000444040 IFT172Q9UG01 1749 aa21.32■■□□□ 1
SHQ1-202ENST00000444040 NRXN1Q9ULB1 1477 aa21.32■■□□□ 1
SHQ1-202ENST00000444040 ADAMTS8Q9UP79 889 aa21.32■■□□□ 1
SHQ1-202ENST00000444040 KIF1BO60333 1816 aa21.32■■□□□ 1
SHQ1-202ENST00000444040 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa21.31■■□□□ 1
SHQ1-202ENST00000444040 MROH2AA6NES4 1674 aa21.3■■□□□ 1
SHQ1-202ENST00000444040 POGZQ7Z3K3 1410 aa21.29■■□□□ 1
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SHQ1-202ENST00000444040 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
SHQ1-202ENST00000444040 ERVK-7P63135 1459 aa21.29■■□□□ 1
SHQ1-202ENST00000444040 CD109Q6YHK3 1445 aa21.29■■□□□ 1
SHQ1-202ENST00000444040 EXOC6Q8TAG9 804 aa21.28■■□□□ 1
SHQ1-202ENST00000444040 SLC24A1O60721 1099 aa21.28■■□□□ 1
SHQ1-202ENST00000444040 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa21.28■■□□□ 1
SHQ1-202ENST00000444040 MLH3Q9UHC1 1453 aa21.28■■□□□ 1
SHQ1-202ENST00000444040 ADGRB3O60242 1522 aa21.27■■□□□ 1
SHQ1-202ENST00000444040 PIK3C2GO75747 1445 aa21.27■■□□□ 1
SHQ1-202ENST00000444040 OSCARQ8IYS5 282 aa21.27■■□□□ 1
SHQ1-202ENST00000444040 CFAP74Q9C0B2 1584 aa21.26■□□□□ 0.99
SHQ1-202ENST00000444040 NPATQ14207 1427 aa21.25■□□□□ 0.99
SHQ1-202ENST00000444040 MYO3AQ8NEV4 1616 aa21.23■□□□□ 0.99
SHQ1-202ENST00000444040 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa21.23■□□□□ 0.99
SHQ1-202ENST00000444040 NOS1P29475 1434 aa21.23■□□□□ 0.99
SHQ1-202ENST00000444040 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP21.22■□□□□ 0.99
SHQ1-202ENST00000444040 HECW2Q9P2P5 1572 aa21.22■□□□□ 0.99
SHQ1-202ENST00000444040 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa21.22■□□□□ 0.99
SHQ1-202ENST00000444040 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa21.21■□□□□ 0.99
SHQ1-202ENST00000444040 ZNF521Q96K83 1311 aa21.2■□□□□ 0.98
SHQ1-202ENST00000444040 CARD14Q9BXL6 1004 aa21.19■□□□□ 0.98
SHQ1-202ENST00000444040 GGT6Q6P531 493 aa21.19■□□□□ 0.98
SHQ1-202ENST00000444040 PLIN1O60240 522 aa21.17■□□□□ 0.98
SHQ1-202ENST00000444040 ABCC3O15438 1527 aa21.17■□□□□ 0.98
SHQ1-202ENST00000444040 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
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SHQ1-202ENST00000444040 CHGAP10645 457 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
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SHQ1-202ENST00000444040 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa21.13■□□□□ 0.97
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SHQ1-202ENST00000444040 ERICH6Q7L0X2 663 aa21.1■□□□□ 0.97
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SHQ1-202ENST00000444040 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa21.07■□□□□ 0.96
SHQ1-202ENST00000444040 PIK3C2BO00750 1634 aa21.07■□□□□ 0.96
SHQ1-202ENST00000444040 TMEM132EQ6IEE7 984 aa21.07■□□□□ 0.96
SHQ1-202ENST00000444040 QRICH2Q9H0J4 1663 aa21.07■□□□□ 0.96
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SHQ1-202ENST00000444040 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa21.03■□□□□ 0.96
SHQ1-202ENST00000444040 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa21.03■□□□□ 0.96
SHQ1-202ENST00000444040 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa21.03■□□□□ 0.96
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SHQ1-202ENST00000444040 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.96
SHQ1-202ENST00000444040 MS4A1P11836 297 aa21.01■□□□□ 0.95
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SHQ1-202ENST00000444040 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP21■□□□□ 0.95
SHQ1-202ENST00000444040 NGEFQ8N5V2 710 aa21■□□□□ 0.95
SHQ1-202ENST00000444040 RICTORQ6R327 1708 aa21■□□□□ 0.95
SHQ1-202ENST00000444040 VGFO15240 615 aaPredicted RBP21■□□□□ 0.95
SHQ1-202ENST00000444040 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP21■□□□□ 0.95
SHQ1-202ENST00000444040 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
SHQ1-202ENST00000444040 PDE4AP27815 886 aa20.98■□□□□ 0.95
SHQ1-202ENST00000444040 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP20.98■□□□□ 0.95
SHQ1-202ENST00000444040 USP32Q8NFA0 1604 aa20.98■□□□□ 0.95
SHQ1-202ENST00000444040 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP20.98■□□□□ 0.95
SHQ1-202ENST00000444040 MORC1Q86VD1 984 aa20.98■□□□□ 0.95
SHQ1-202ENST00000444040 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP20.97■□□□□ 0.95
SHQ1-202ENST00000444040 KDM2BQ8NHM5 1336 aa20.97■□□□□ 0.95
SHQ1-202ENST00000444040 YEATS2Q9ULM3 1422 aa20.97■□□□□ 0.95
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