RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.62
RABGEF1-203ENST00000439720 MRS2Q9HD23 443 aa11.21□□□□□ -0.62
RABGEF1-203ENST00000439720 VWDEQ8N2E2 1590 aa11.2□□□□□ -0.62
RABGEF1-203ENST00000439720 ERBINQ96RT1 1412 aa11.2□□□□□ -0.62
RABGEF1-203ENST00000439720 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
RABGEF1-203ENST00000439720 VSIG10Q8N0Z9 540 aa11.2□□□□□ -0.62
RABGEF1-203ENST00000439720 MADDQ8WXG6 1647 aa11.2□□□□□ -0.62
RABGEF1-203ENST00000439720 NPATQ14207 1427 aa11.2□□□□□ -0.62
RABGEF1-203ENST00000439720 POLR3GLQ9BT43 218 aa11.2□□□□□ -0.62
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
RABGEF1-203ENST00000439720 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa11.19□□□□□ -0.62
RABGEF1-203ENST00000439720 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP11.19□□□□□ -0.62
RABGEF1-203ENST00000439720 ZMYND15Q9H091 742 aa11.19□□□□□ -0.62
RABGEF1-203ENST00000439720 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
RABGEF1-203ENST00000439720 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
RABGEF1-203ENST00000439720 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa11.18□□□□□ -0.62
RABGEF1-203ENST00000439720 A2MP01023 1474 aa11.18□□□□□ -0.62
RABGEF1-203ENST00000439720 PZPP20742 1482 aa11.18□□□□□ -0.62
RABGEF1-203ENST00000439720 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
RABGEF1-203ENST00000439720 C3P01024 1663 aa11.17□□□□□ -0.62
RABGEF1-203ENST00000439720 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
RABGEF1-203ENST00000439720 LAMC1P11047 1609 aa11.16□□□□□ -0.62
RABGEF1-203ENST00000439720 PDE4AP27815 886 aa11.16□□□□□ -0.62
RABGEF1-203ENST00000439720 NFKBIBQ15653 356 aa11.16□□□□□ -0.62
RABGEF1-203ENST00000439720 MROH1Q8NDA8 1641 aa11.16□□□□□ -0.62
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM43AQ8N2R8 423 aa11.16□□□□□ -0.62
RABGEF1-203ENST00000439720 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa11.15□□□□□ -0.62
RABGEF1-203ENST00000439720 NEURL4Q96JN8 1562 aa11.15□□□□□ -0.62
RABGEF1-203ENST00000439720 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
RABGEF1-203ENST00000439720 NCOA1Q15788 1441 aa11.14□□□□□ -0.63
RABGEF1-203ENST00000439720 YEATS2Q9ULM3 1422 aa11.14□□□□□ -0.63
RABGEF1-203ENST00000439720 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
RABGEF1-203ENST00000439720 IQGAP3Q86VI3 1631 aa11.13□□□□□ -0.63
RABGEF1-203ENST00000439720 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa11.13□□□□□ -0.63
RABGEF1-203ENST00000439720 PTPRMP28827 1452 aa11.13□□□□□ -0.63
RABGEF1-203ENST00000439720 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
RABGEF1-203ENST00000439720 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
RABGEF1-203ENST00000439720 DCAF11Q8TEB1 546 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGEF1-203ENST00000439720 NUDCQ9Y266 331 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGEF1-203ENST00000439720 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGEF1-203ENST00000439720 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGEF1-203ENST00000439720 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC4A3P48751 1232 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGEF1-203ENST00000439720 BACH2Q9BYV9 841 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGEF1-203ENST00000439720 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
RABGEF1-203ENST00000439720 RNF123Q5XPI4 1314 aa11.11□□□□□ -0.63
RABGEF1-203ENST00000439720 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa11.11□□□□□ -0.63
RABGEF1-203ENST00000439720 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
RABGEF1-203ENST00000439720 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
RABGEF1-203ENST00000439720 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa11.1□□□□□ -0.63
RABGEF1-203ENST00000439720 TET3O43151 1660 aa11.1□□□□□ -0.63
RABGEF1-203ENST00000439720 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
RABGEF1-203ENST00000439720 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
RABGEF1-203ENST00000439720 MYO3AQ8NEV4 1616 aa11.09□□□□□ -0.63
RABGEF1-203ENST00000439720 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
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RABGEF1-203ENST00000439720 ARID3AQ99856 593 aa11.07□□□□□ -0.64
RABGEF1-203ENST00000439720 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa11.07□□□□□ -0.64
RABGEF1-203ENST00000439720 ABCC3O15438 1527 aa11.07□□□□□ -0.64
RABGEF1-203ENST00000439720 PLA2R1Q13018 1463 aa11.06□□□□□ -0.64
RABGEF1-203ENST00000439720 E9PCH4 1651 aa11.06□□□□□ -0.64
RABGEF1-203ENST00000439720 EXOC6Q8TAG9 804 aa11.06□□□□□ -0.64
RABGEF1-203ENST00000439720 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
RABGEF1-203ENST00000439720 IQSEC2Q5JU85 1478 aa11.05□□□□□ -0.64
RABGEF1-203ENST00000439720 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
RABGEF1-203ENST00000439720 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
RABGEF1-203ENST00000439720 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP11.05□□□□□ -0.64
RABGEF1-203ENST00000439720 NLRP1Q9C000 1473 aa11.04□□□□□ -0.64
RABGEF1-203ENST00000439720 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
RABGEF1-203ENST00000439720 SKAP1Q86WV1 359 aa11.04□□□□□ -0.64
RABGEF1-203ENST00000439720 FBXO41Q8TF61 875 aa11.04□□□□□ -0.64
RABGEF1-203ENST00000439720 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
RABGEF1-203ENST00000439720 PIK3C2BO00750 1634 aa11.04□□□□□ -0.64
RABGEF1-203ENST00000439720 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa11.03□□□□□ -0.64
RABGEF1-203ENST00000439720 EFCAB6Q5THR3 1501 aa11.03□□□□□ -0.64
RABGEF1-203ENST00000439720 MS4A1P11836 297 aa11.03□□□□□ -0.64
RABGEF1-203ENST00000439720 CEP152O94986 1710 aa11.03□□□□□ -0.64
RABGEF1-203ENST00000439720 RAPGEF3O95398 923 aa11.03□□□□□ -0.64
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RABGEF1-203ENST00000439720 RALGAPBQ86X10 1494 aa11.01□□□□□ -0.65
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RABGEF1-203ENST00000439720 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa11□□□□□ -0.65
RABGEF1-203ENST00000439720 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
RABGEF1-203ENST00000439720 A2ML1A8K2U0 1454 aa10.99□□□□□ -0.65
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RABGEF1-203ENST00000439720 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
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RABGEF1-203ENST00000439720 PTPRTO14522 1441 aa10.99□□□□□ -0.65
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RABGEF1-203ENST00000439720 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa10.98□□□□□ -0.65
RABGEF1-203ENST00000439720 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa10.98□□□□□ -0.65
RABGEF1-203ENST00000439720 ARID3CA6NKF2 412 aa10.98□□□□□ -0.65
RABGEF1-203ENST00000439720 RRP9O43818 475 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
RABGEF1-203ENST00000439720 UBR1Q8IWV7 1749 aa10.97□□□□□ -0.65
RABGEF1-203ENST00000439720 TSPY4P0CV99 314 aa10.97□□□□□ -0.65
RABGEF1-203ENST00000439720 TSPY10P0CW01 314 aa10.97□□□□□ -0.65
RABGEF1-203ENST00000439720 MPHOSPH9Q99550 1183 aa10.97□□□□□ -0.65
RABGEF1-203ENST00000439720 ADRA2BP18089 450 aa10.97□□□□□ -0.65
RABGEF1-203ENST00000439720 AFAP1Q8N556 730 aa10.96□□□□□ -0.65
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF428Q96B54 188 aa10.96□□□□□ -0.65
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