RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431413.5

HERC3-206, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 761 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-206ENST00000431413 RIMS2Q9UQ26 1411 aa22.99■■□□□ 1.27
HERC3-206ENST00000431413 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
HERC3-206ENST00000431413 E9PCH4 1651 aa22.98■■□□□ 1.27
HERC3-206ENST00000431413 ILDR2Q71H61 639 aa22.98■■□□□ 1.27
HERC3-206ENST00000431413 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
HERC3-206ENST00000431413 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa22.98■■□□□ 1.27
HERC3-206ENST00000431413 ZFYVE9O95405 1425 aa22.98■■□□□ 1.27
HERC3-206ENST00000431413 ALKQ9UM73 1620 aa22.97■■□□□ 1.27
HERC3-206ENST00000431413 TMEM94Q12767 1356 aa22.96■■□□□ 1.27
HERC3-206ENST00000431413 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa22.96■■□□□ 1.27
HERC3-206ENST00000431413 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
HERC3-206ENST00000431413 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
HERC3-206ENST00000431413 TBX22Q9Y458 520 aa22.92■■□□□ 1.26
HERC3-206ENST00000431413 MYO5BQ9ULV0 1848 aa22.89■■□□□ 1.26
HERC3-206ENST00000431413 SOCS7O14512 581 aa22.89■■□□□ 1.25
HERC3-206ENST00000431413 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
HERC3-206ENST00000431413 NWD1Q149M9 1564 aa22.88■■□□□ 1.25
HERC3-206ENST00000431413 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
HERC3-206ENST00000431413 NAIPQ13075 1403 aa22.87■■□□□ 1.25
HERC3-206ENST00000431413 MSH6P52701 1360 aa22.87■■□□□ 1.25
HERC3-206ENST00000431413 FAM135BQ49AJ0 1406 aa22.86■■□□□ 1.25
HERC3-206ENST00000431413 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
HERC3-206ENST00000431413 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
HERC3-206ENST00000431413 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
HERC3-206ENST00000431413 PIK3R4Q99570 1358 aa22.84■■□□□ 1.25
HERC3-206ENST00000431413 TRIM52Q96A61 297 aa22.83■■□□□ 1.25
HERC3-206ENST00000431413 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
HERC3-206ENST00000431413 DIP2AQ14689 1571 aa22.82■■□□□ 1.24
HERC3-206ENST00000431413 HFM1A2PYH4 1435 aa22.82■■□□□ 1.24
HERC3-206ENST00000431413 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa22.82■■□□□ 1.24
HERC3-206ENST00000431413 C14orf37Q86TY3 774 aa22.81■■□□□ 1.24
HERC3-206ENST00000431413 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa22.81■■□□□ 1.24
HERC3-206ENST00000431413 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa22.81■■□□□ 1.24
HERC3-206ENST00000431413 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
HERC3-206ENST00000431413 SLAIN2Q9P270 581 aa22.79■■□□□ 1.24
HERC3-206ENST00000431413 TRPM2O94759 1503 aa22.77■■□□□ 1.24
HERC3-206ENST00000431413 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
HERC3-206ENST00000431413 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa22.75■■□□□ 1.23
HERC3-206ENST00000431413 C19orf44Q9H6X5 657 aa22.74■■□□□ 1.23
HERC3-206ENST00000431413 CADPS2Q86UW7 1296 aa22.73■■□□□ 1.23
HERC3-206ENST00000431413 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa22.72■■□□□ 1.23
HERC3-206ENST00000431413 ATF3P18847 181 aa22.72■■□□□ 1.23
HERC3-206ENST00000431413 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa22.7■■□□□ 1.22
HERC3-206ENST00000431413 CLTCL1P53675 1640 aa22.69■■□□□ 1.22
HERC3-206ENST00000431413 VGFO15240 615 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
HERC3-206ENST00000431413 PTPRUQ92729 1446 aa22.66■■□□□ 1.22
HERC3-206ENST00000431413 KIF1BO60333 1816 aa22.66■■□□□ 1.22
HERC3-206ENST00000431413 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa22.65■■□□□ 1.22
HERC3-206ENST00000431413 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa22.64■■□□□ 1.21
HERC3-206ENST00000431413 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa22.64■■□□□ 1.21
HERC3-206ENST00000431413 METP08581 1390 aa22.63■■□□□ 1.21
HERC3-206ENST00000431413 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
HERC3-206ENST00000431413 DCCP43146 1447 aa22.61■■□□□ 1.21
HERC3-206ENST00000431413 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
HERC3-206ENST00000431413 JCADQ9P266 1359 aa22.61■■□□□ 1.21
HERC3-206ENST00000431413 PHLPP1O60346 1717 aa22.59■■□□□ 1.21
HERC3-206ENST00000431413 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
HERC3-206ENST00000431413 FOXD1Q16676 465 aa22.57■■□□□ 1.2
HERC3-206ENST00000431413 MPHOSPH9Q99550 1183 aa22.57■■□□□ 1.2
HERC3-206ENST00000431413 CCDC144AA2RUR9 1427 aa22.57■■□□□ 1.2
HERC3-206ENST00000431413 BRINP3Q76B58 766 aa22.54■■□□□ 1.2
HERC3-206ENST00000431413 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
HERC3-206ENST00000431413 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa22.53■■□□□ 1.2
HERC3-206ENST00000431413 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa22.52■■□□□ 1.2
HERC3-206ENST00000431413 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
HERC3-206ENST00000431413 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
HERC3-206ENST00000431413 RGL3Q3MIN7 710 aa22.5■■□□□ 1.19
HERC3-206ENST00000431413 MST1RQ04912 1400 aa22.49■■□□□ 1.19
HERC3-206ENST00000431413 PTCH1Q13635 1447 aa22.49■■□□□ 1.19
HERC3-206ENST00000431413 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.49■■□□□ 1.19
HERC3-206ENST00000431413 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa22.48■■□□□ 1.19
HERC3-206ENST00000431413 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
HERC3-206ENST00000431413 PPLO60437 1756 aa22.46■■□□□ 1.19
HERC3-206ENST00000431413 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa22.46■■□□□ 1.19
HERC3-206ENST00000431413 ROBO2Q9HCK4 1378 aa22.45■■□□□ 1.18
HERC3-206ENST00000431413 POTEAQ6S8J7 498 aa22.44■■□□□ 1.18
HERC3-206ENST00000431413 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa22.44■■□□□ 1.18
HERC3-206ENST00000431413 PRAG1Q86YV5 1406 aa22.44■■□□□ 1.18
HERC3-206ENST00000431413 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
HERC3-206ENST00000431413 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa22.43■■□□□ 1.18
HERC3-206ENST00000431413 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
HERC3-206ENST00000431413 NALCNQ8IZF0 1738 aa22.41■■□□□ 1.18
HERC3-206ENST00000431413 C1orf167Q5SNV9 1468 aa22.4■■□□□ 1.18
HERC3-206ENST00000431413 SHPRHQ149N8 1683 aa22.39■■□□□ 1.18
HERC3-206ENST00000431413 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
HERC3-206ENST00000431413 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa22.38■■□□□ 1.17
HERC3-206ENST00000431413 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
HERC3-206ENST00000431413 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
HERC3-206ENST00000431413 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
HERC3-206ENST00000431413 LRP6O75581 1613 aa22.37■■□□□ 1.17
HERC3-206ENST00000431413 STK26Q9P289 416 aa22.36■■□□□ 1.17
HERC3-206ENST00000431413 NHSL1Q5SYE7 1610 aa22.35■■□□□ 1.17
HERC3-206ENST00000431413 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
HERC3-206ENST00000431413 ORAI2Q96SN7 254 aa22.34■■□□□ 1.17
HERC3-206ENST00000431413 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
HERC3-206ENST00000431413 PIK3C2GO75747 1445 aa22.33■■□□□ 1.17
HERC3-206ENST00000431413 ABCC11Q96J66 1382 aa22.33■■□□□ 1.17
HERC3-206ENST00000431413 TECPR2O15040 1411 aa22.32■■□□□ 1.16
HERC3-206ENST00000431413 TMEM132EQ6IEE7 984 aa22.32■■□□□ 1.16
HERC3-206ENST00000431413 IFT172Q9UG01 1749 aa22.31■■□□□ 1.16
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