RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417497.5

TTC28-AS1-202, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene TTC28-AS1, Length 627 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-202ENST00000417497 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP19.83■□□□□ 0.77
TTC28-AS1-202ENST00000417497 BCANQ96GW7 911 aa19.83■□□□□ 0.77
TTC28-AS1-202ENST00000417497 SLC26A8Q96RN1 970 aa19.83■□□□□ 0.77
TTC28-AS1-202ENST00000417497 CLTCL1P53675 1640 aa19.82■□□□□ 0.76
TTC28-AS1-202ENST00000417497 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa19.82■□□□□ 0.76
TTC28-AS1-202ENST00000417497 CPS1P31327 1500 aa19.81■□□□□ 0.76
TTC28-AS1-202ENST00000417497 IQSEC2Q5JU85 1478 aa19.8■□□□□ 0.76
TTC28-AS1-202ENST00000417497 MPHOSPH9Q99550 1183 aa19.8■□□□□ 0.76
TTC28-AS1-202ENST00000417497 STRCP1A6NGW2 1772 aa19.79■□□□□ 0.76
TTC28-AS1-202ENST00000417497 HDGFP51858 240 aaKnown RBP19.78■□□□□ 0.76
TTC28-AS1-202ENST00000417497 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP19.78■□□□□ 0.76
TTC28-AS1-202ENST00000417497 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP19.78■□□□□ 0.76
TTC28-AS1-202ENST00000417497 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa19.78■□□□□ 0.76
TTC28-AS1-202ENST00000417497 UBAP1LF5GYI3 381 aa19.74■□□□□ 0.75
TTC28-AS1-202ENST00000417497 LRRC7Q96NW7 1537 aa19.74■□□□□ 0.75
TTC28-AS1-202ENST00000417497 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa19.7■□□□□ 0.74
TTC28-AS1-202ENST00000417497 KCNA6P17658 529 aa19.7■□□□□ 0.74
TTC28-AS1-202ENST00000417497 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP19.7■□□□□ 0.74
TTC28-AS1-202ENST00000417497 CCDC144AA2RUR9 1427 aa19.69■□□□□ 0.74
TTC28-AS1-202ENST00000417497 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa19.69■□□□□ 0.74
TTC28-AS1-202ENST00000417497 KIF1BO60333 1816 aa19.69■□□□□ 0.74
TTC28-AS1-202ENST00000417497 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP19.68■□□□□ 0.74
TTC28-AS1-202ENST00000417497 TBX22Q9Y458 520 aa19.68■□□□□ 0.74
TTC28-AS1-202ENST00000417497 PIP4K2BP78356 416 aa19.66■□□□□ 0.74
TTC28-AS1-202ENST00000417497 NWD1Q149M9 1564 aa19.66■□□□□ 0.74
TTC28-AS1-202ENST00000417497 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP19.65■□□□□ 0.74
TTC28-AS1-202ENST00000417497 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP19.65■□□□□ 0.74
TTC28-AS1-202ENST00000417497 TMEM94Q12767 1356 aa19.65■□□□□ 0.74
TTC28-AS1-202ENST00000417497 RGL3Q3MIN7 710 aa19.64■□□□□ 0.73
TTC28-AS1-202ENST00000417497 DIP2AQ14689 1571 aa19.64■□□□□ 0.73
TTC28-AS1-202ENST00000417497 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa19.64■□□□□ 0.73
TTC28-AS1-202ENST00000417497 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa19.63■□□□□ 0.73
TTC28-AS1-202ENST00000417497 TOM1O60784 492 aa19.63■□□□□ 0.73
TTC28-AS1-202ENST00000417497 ALKQ9UM73 1620 aa19.62■□□□□ 0.73
TTC28-AS1-202ENST00000417497 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP19.62■□□□□ 0.73
TTC28-AS1-202ENST00000417497 HRCP23327 699 aa19.62■□□□□ 0.73
TTC28-AS1-202ENST00000417497 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa19.61■□□□□ 0.73
TTC28-AS1-202ENST00000417497 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa19.61■□□□□ 0.73
TTC28-AS1-202ENST00000417497 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP19.61■□□□□ 0.73
TTC28-AS1-202ENST00000417497 PTPRUQ92729 1446 aa19.6■□□□□ 0.73
TTC28-AS1-202ENST00000417497 VGFO15240 615 aaPredicted RBP19.6■□□□□ 0.73
TTC28-AS1-202ENST00000417497 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP19.6■□□□□ 0.73
TTC28-AS1-202ENST00000417497 METP08581 1390 aa19.59■□□□□ 0.73
TTC28-AS1-202ENST00000417497 PIK3R4Q99570 1358 aa19.58■□□□□ 0.73
TTC28-AS1-202ENST00000417497 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa19.58■□□□□ 0.72
TTC28-AS1-202ENST00000417497 PPLO60437 1756 aa19.57■□□□□ 0.72
TTC28-AS1-202ENST00000417497 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa19.57■□□□□ 0.72
TTC28-AS1-202ENST00000417497 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa19.55■□□□□ 0.72
TTC28-AS1-202ENST00000417497 HSPA1LP34931 641 aa19.52■□□□□ 0.72
TTC28-AS1-202ENST00000417497 C14orf37Q86TY3 774 aa19.52■□□□□ 0.72
TTC28-AS1-202ENST00000417497 MSH6P52701 1360 aa19.52■□□□□ 0.72
TTC28-AS1-202ENST00000417497 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP19.51■□□□□ 0.71
TTC28-AS1-202ENST00000417497 IFT172Q9UG01 1749 aa19.5■□□□□ 0.71
TTC28-AS1-202ENST00000417497 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP19.49■□□□□ 0.71
TTC28-AS1-202ENST00000417497 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa19.46■□□□□ 0.71
TTC28-AS1-202ENST00000417497 PIK3C2GO75747 1445 aa19.45■□□□□ 0.7
TTC28-AS1-202ENST00000417497 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP19.44■□□□□ 0.7
TTC28-AS1-202ENST00000417497 C19orf44Q9H6X5 657 aa19.44■□□□□ 0.7
TTC28-AS1-202ENST00000417497 SLAIN2Q9P270 581 aa19.44■□□□□ 0.7
TTC28-AS1-202ENST00000417497 ROBO2Q9HCK4 1378 aa19.44■□□□□ 0.7
TTC28-AS1-202ENST00000417497 MYOM2P54296 1465 aa19.42■□□□□ 0.7
TTC28-AS1-202ENST00000417497 TMEM132EQ6IEE7 984 aa19.42■□□□□ 0.7
TTC28-AS1-202ENST00000417497 STK26Q9P289 416 aa19.42■□□□□ 0.7
TTC28-AS1-202ENST00000417497 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa19.42■□□□□ 0.7
TTC28-AS1-202ENST00000417497 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP19.42■□□□□ 0.7
TTC28-AS1-202ENST00000417497 FAM135BQ49AJ0 1406 aa19.42■□□□□ 0.7
TTC28-AS1-202ENST00000417497 NRXN1Q9ULB1 1477 aa19.41■□□□□ 0.7
TTC28-AS1-202ENST00000417497 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa19.41■□□□□ 0.7
TTC28-AS1-202ENST00000417497 ATF3P18847 181 aa19.41■□□□□ 0.7
TTC28-AS1-202ENST00000417497 DCAF11Q8TEB1 546 aa19.41■□□□□ 0.7
TTC28-AS1-202ENST00000417497 PTCH1Q13635 1447 aa19.41■□□□□ 0.7
TTC28-AS1-202ENST00000417497 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa19.4■□□□□ 0.7
TTC28-AS1-202ENST00000417497 CFAP70Q5T0N1 1121 aa19.39■□□□□ 0.69
TTC28-AS1-202ENST00000417497 CADPS2Q86UW7 1296 aa19.39■□□□□ 0.69
TTC28-AS1-202ENST00000417497 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP19.38■□□□□ 0.69
TTC28-AS1-202ENST00000417497 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP19.38■□□□□ 0.69
TTC28-AS1-202ENST00000417497 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa19.38■□□□□ 0.69
TTC28-AS1-202ENST00000417497 PRAG1Q86YV5 1406 aa19.37■□□□□ 0.69
TTC28-AS1-202ENST00000417497 NALCNQ8IZF0 1738 aa19.37■□□□□ 0.69
TTC28-AS1-202ENST00000417497 DCCP43146 1447 aa19.36■□□□□ 0.69
TTC28-AS1-202ENST00000417497 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP19.36■□□□□ 0.69
TTC28-AS1-202ENST00000417497 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP19.34■□□□□ 0.69
TTC28-AS1-202ENST00000417497 WAPLQ7Z5K2 1190 aa19.34■□□□□ 0.69
TTC28-AS1-202ENST00000417497 TECPR2O15040 1411 aa19.33■□□□□ 0.68
TTC28-AS1-202ENST00000417497 MST1RQ04912 1400 aa19.33■□□□□ 0.68
TTC28-AS1-202ENST00000417497 ABCC11Q96J66 1382 aa19.32■□□□□ 0.68
TTC28-AS1-202ENST00000417497 DISP3Q9P2K9 1392 aa19.32■□□□□ 0.68
TTC28-AS1-202ENST00000417497 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa19.32■□□□□ 0.68
TTC28-AS1-202ENST00000417497 SIN3AQ96ST3 1273 aa19.32■□□□□ 0.68
TTC28-AS1-202ENST00000417497 LAMC1P11047 1609 aa19.32■□□□□ 0.68
TTC28-AS1-202ENST00000417497 BRINP3Q76B58 766 aa19.3■□□□□ 0.68
TTC28-AS1-202ENST00000417497 NEUROD1Q13562 356 aa19.28■□□□□ 0.68
TTC28-AS1-202ENST00000417497 KNDC1Q76NI1 1749 aa19.28■□□□□ 0.68
TTC28-AS1-202ENST00000417497 ADGRB1O14514 1584 aa19.27■□□□□ 0.68
TTC28-AS1-202ENST00000417497 STAC3Q96MF2 364 aa19.27■□□□□ 0.68
TTC28-AS1-202ENST00000417497 PHLPP1O60346 1717 aa19.27■□□□□ 0.68
TTC28-AS1-202ENST00000417497 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP19.26■□□□□ 0.67
TTC28-AS1-202ENST00000417497 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP19.26■□□□□ 0.67
TTC28-AS1-202ENST00000417497 C1orf167Q5SNV9 1468 aa19.25■□□□□ 0.67
TTC28-AS1-202ENST00000417497 PRAM1Q96QH2 718 aa19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.3 ms