RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000405333.5

ODC1-202, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ODC1, Length 1,943 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-202ENST00000405333 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa28.49■■■□□ 2.15
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ODC1-202ENST00000405333 STAG3Q9UJ98 1225 aa28.44■■■□□ 2.14
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ODC1-202ENST00000405333 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa28.18■■■□□ 2.1
ODC1-202ENST00000405333 TESK2Q96S53 571 aa28.18■■■□□ 2.1
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ODC1-202ENST00000405333 TBX22Q9Y458 520 aa27.82■■■□□ 2.04
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ODC1-202ENST00000405333 DIP2AQ14689 1571 aa27.8■■■□□ 2.04
ODC1-202ENST00000405333 CPS1P31327 1500 aa27.8■■■□□ 2.04
ODC1-202ENST00000405333 ROBO2Q9HCK4 1378 aa27.8■■■□□ 2.04
ODC1-202ENST00000405333 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP27.79■■■□□ 2.04
ODC1-202ENST00000405333 SLC24A1O60721 1099 aa27.78■■■□□ 2.04
ODC1-202ENST00000405333 HSPA2P54652 639 aa27.77■■■□□ 2.04
ODC1-202ENST00000405333 PANK3Q9H999 370 aa27.77■■■□□ 2.04
ODC1-202ENST00000405333 EVC2Q86UK5 1308 aa27.76■■■□□ 2.03
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