RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393193.6

NME1-NME2-202, Transcript of NME1-NME2 readthrough, humanhuman

APPRIS P2 TSL 2 BASIC

Gene NME1-NME2, Length 1,021 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1-NME2-202ENST00000393193 NWD1Q149M9 1564 aa24.64■■□□□ 1.54
NME1-NME2-202ENST00000393193 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa24.62■■□□□ 1.53
NME1-NME2-202ENST00000393193 KIF1BO60333 1816 aa24.61■■□□□ 1.53
NME1-NME2-202ENST00000393193 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
NME1-NME2-202ENST00000393193 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa24.6■■□□□ 1.53
NME1-NME2-202ENST00000393193 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa24.58■■□□□ 1.53
NME1-NME2-202ENST00000393193 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa24.57■■□□□ 1.52
NME1-NME2-202ENST00000393193 DIP2AQ14689 1571 aa24.55■■□□□ 1.52
NME1-NME2-202ENST00000393193 SETD5Q9C0A6 1442 aa24.55■■□□□ 1.52
NME1-NME2-202ENST00000393193 TRIM52Q96A61 297 aa24.54■■□□□ 1.52
NME1-NME2-202ENST00000393193 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa24.53■■□□□ 1.52
NME1-NME2-202ENST00000393193 SLC26A8Q96RN1 970 aa24.52■■□□□ 1.52
NME1-NME2-202ENST00000393193 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
NME1-NME2-202ENST00000393193 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
NME1-NME2-202ENST00000393193 CHGAP10645 457 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
NME1-NME2-202ENST00000393193 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP24.5■■□□□ 1.51
NME1-NME2-202ENST00000393193 KCNA6P17658 529 aa24.49■■□□□ 1.51
NME1-NME2-202ENST00000393193 PPLO60437 1756 aa24.49■■□□□ 1.51
NME1-NME2-202ENST00000393193 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa24.48■■□□□ 1.51
NME1-NME2-202ENST00000393193 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
NME1-NME2-202ENST00000393193 UBAP1LF5GYI3 381 aa24.47■■□□□ 1.51
NME1-NME2-202ENST00000393193 HDGFP51858 240 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
NME1-NME2-202ENST00000393193 TBX22Q9Y458 520 aa24.47■■□□□ 1.51
NME1-NME2-202ENST00000393193 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
NME1-NME2-202ENST00000393193 IFT172Q9UG01 1749 aa24.45■■□□□ 1.5
NME1-NME2-202ENST00000393193 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
NME1-NME2-202ENST00000393193 MPHOSPH9Q99550 1183 aa24.45■■□□□ 1.5
NME1-NME2-202ENST00000393193 FOXD1Q16676 465 aa24.44■■□□□ 1.5
NME1-NME2-202ENST00000393193 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
NME1-NME2-202ENST00000393193 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa24.43■■□□□ 1.5
NME1-NME2-202ENST00000393193 PIK3R4Q99570 1358 aa24.42■■□□□ 1.5
NME1-NME2-202ENST00000393193 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
NME1-NME2-202ENST00000393193 TMEM94Q12767 1356 aa24.42■■□□□ 1.5
NME1-NME2-202ENST00000393193 PTPRUQ92729 1446 aa24.41■■□□□ 1.5
NME1-NME2-202ENST00000393193 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
NME1-NME2-202ENST00000393193 TOM1O60784 492 aa24.37■■□□□ 1.49
NME1-NME2-202ENST00000393193 CCDC144AA2RUR9 1427 aa24.36■■□□□ 1.49
NME1-NME2-202ENST00000393193 HRCP23327 699 aa24.35■■□□□ 1.49
NME1-NME2-202ENST00000393193 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
NME1-NME2-202ENST00000393193 BCANQ96GW7 911 aa24.34■■□□□ 1.49
NME1-NME2-202ENST00000393193 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa24.34■■□□□ 1.49
NME1-NME2-202ENST00000393193 METP08581 1390 aa24.33■■□□□ 1.49
NME1-NME2-202ENST00000393193 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa24.33■■□□□ 1.49
NME1-NME2-202ENST00000393193 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
NME1-NME2-202ENST00000393193 PRAG1Q86YV5 1406 aa24.3■■□□□ 1.48
NME1-NME2-202ENST00000393193 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
NME1-NME2-202ENST00000393193 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
NME1-NME2-202ENST00000393193 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa24.28■■□□□ 1.48
NME1-NME2-202ENST00000393193 PIP4K2BP78356 416 aa24.27■■□□□ 1.48
NME1-NME2-202ENST00000393193 HSPA1LP34931 641 aa24.26■■□□□ 1.47
NME1-NME2-202ENST00000393193 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa24.25■■□□□ 1.47
NME1-NME2-202ENST00000393193 VGFO15240 615 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
NME1-NME2-202ENST00000393193 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa24.25■■□□□ 1.47
NME1-NME2-202ENST00000393193 FAM135BQ49AJ0 1406 aa24.25■■□□□ 1.47
NME1-NME2-202ENST00000393193 NRXN1Q9ULB1 1477 aa24.24■■□□□ 1.47
NME1-NME2-202ENST00000393193 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa24.23■■□□□ 1.47
NME1-NME2-202ENST00000393193 NALCNQ8IZF0 1738 aa24.23■■□□□ 1.47
NME1-NME2-202ENST00000393193 MSH6P52701 1360 aa24.22■■□□□ 1.47
NME1-NME2-202ENST00000393193 PIK3C2GO75747 1445 aa24.21■■□□□ 1.47
NME1-NME2-202ENST00000393193 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa24.21■■□□□ 1.47
NME1-NME2-202ENST00000393193 PTCH1Q13635 1447 aa24.2■■□□□ 1.46
NME1-NME2-202ENST00000393193 MYOM2P54296 1465 aa24.19■■□□□ 1.46
NME1-NME2-202ENST00000393193 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
NME1-NME2-202ENST00000393193 DCCP43146 1447 aa24.18■■□□□ 1.46
NME1-NME2-202ENST00000393193 KNDC1Q76NI1 1749 aa24.17■■□□□ 1.46
NME1-NME2-202ENST00000393193 RGL3Q3MIN7 710 aa24.15■■□□□ 1.46
NME1-NME2-202ENST00000393193 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa24.15■■□□□ 1.46
NME1-NME2-202ENST00000393193 TECPR2O15040 1411 aa24.14■■□□□ 1.45
NME1-NME2-202ENST00000393193 ROBO2Q9HCK4 1378 aa24.14■■□□□ 1.45
NME1-NME2-202ENST00000393193 C19orf44Q9H6X5 657 aa24.13■■□□□ 1.45
NME1-NME2-202ENST00000393193 LAMC1P11047 1609 aa24.13■■□□□ 1.45
NME1-NME2-202ENST00000393193 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
NME1-NME2-202ENST00000393193 SLAIN2Q9P270 581 aa24.11■■□□□ 1.45
NME1-NME2-202ENST00000393193 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
NME1-NME2-202ENST00000393193 MST1RQ04912 1400 aa24.1■■□□□ 1.45
NME1-NME2-202ENST00000393193 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
NME1-NME2-202ENST00000393193 PHLPP1O60346 1717 aa24.07■■□□□ 1.44
NME1-NME2-202ENST00000393193 CADPS2Q86UW7 1296 aa24.07■■□□□ 1.44
NME1-NME2-202ENST00000393193 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
NME1-NME2-202ENST00000393193 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
NME1-NME2-202ENST00000393193 ADGRB1O14514 1584 aa24.05■■□□□ 1.44
NME1-NME2-202ENST00000393193 NHSL1Q5SYE7 1610 aa24.05■■□□□ 1.44
NME1-NME2-202ENST00000393193 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
NME1-NME2-202ENST00000393193 ABCC11Q96J66 1382 aa24.03■■□□□ 1.44
NME1-NME2-202ENST00000393193 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa24.03■■□□□ 1.44
NME1-NME2-202ENST00000393193 C14orf37Q86TY3 774 aa24.02■■□□□ 1.44
NME1-NME2-202ENST00000393193 DISP3Q9P2K9 1392 aa24.02■■□□□ 1.44
NME1-NME2-202ENST00000393193 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
NME1-NME2-202ENST00000393193 ATF3P18847 181 aa24.01■■□□□ 1.43
NME1-NME2-202ENST00000393193 TMEM132EQ6IEE7 984 aa23.98■■□□□ 1.43
NME1-NME2-202ENST00000393193 CFAP70Q5T0N1 1121 aa23.97■■□□□ 1.43
NME1-NME2-202ENST00000393193 BRINP3Q76B58 766 aa23.97■■□□□ 1.43
NME1-NME2-202ENST00000393193 DLC1Q96QB1 1528 aa23.96■■□□□ 1.43
NME1-NME2-202ENST00000393193 C1orf167Q5SNV9 1468 aa23.96■■□□□ 1.43
NME1-NME2-202ENST00000393193 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa23.96■■□□□ 1.43
NME1-NME2-202ENST00000393193 SHPRHQ149N8 1683 aa23.95■■□□□ 1.43
NME1-NME2-202ENST00000393193 FMN2Q9NZ56 1722 aa23.94■■□□□ 1.42
NME1-NME2-202ENST00000393193 SIRT1Q96EB6 747 aa23.93■■□□□ 1.42
NME1-NME2-202ENST00000393193 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa23.93■■□□□ 1.42
NME1-NME2-202ENST00000393193 STAC3Q96MF2 364 aa23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.9 ms