RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379565.7

RPS6KA3-201, Transcript of ribosomal protein S6 kinase A3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RPS6KA3, Length 7,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA3-201ENST00000379565 CGNL1Q0VF96 1302 aa21.46■■□□□ 1.03
RPS6KA3-201ENST00000379565 CCDC27Q2M243 656 aa21.46■■□□□ 1.03
RPS6KA3-201ENST00000379565 USP35Q9P2H5 1018 aa21.46■■□□□ 1.03
RPS6KA3-201ENST00000379565 PANK3Q9H999 370 aa21.45■■□□□ 1.02
RPS6KA3-201ENST00000379565 TRDNQ13061 729 aa21.45■■□□□ 1.02
RPS6KA3-201ENST00000379565 NUTM2GQ5VZR2 741 aa21.45■■□□□ 1.02
RPS6KA3-201ENST00000379565 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
RPS6KA3-201ENST00000379565 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP21.45■■□□□ 1.022e-6■■■■■ 125.6
RPS6KA3-201ENST00000379565 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa21.45■■□□□ 1.02
RPS6KA3-201ENST00000379565 ERICH2A1L162 156 aa21.45■■□□□ 1.02
RPS6KA3-201ENST00000379565 DDX58O95786 925 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
RPS6KA3-201ENST00000379565 NLRP13Q86W25 1043 aa21.45■■□□□ 1.02
RPS6KA3-201ENST00000379565 ANO2Q9NQ90 1003 aa21.44■■□□□ 1.02
RPS6KA3-201ENST00000379565 JPH4Q96JJ6 628 aa21.44■■□□□ 1.02
RPS6KA3-201ENST00000379565 CHMP4CQ96CF2 233 aa21.43■■□□□ 1.02
RPS6KA3-201ENST00000379565 RSPH4AQ5TD94 716 aa21.43■■□□□ 1.02
RPS6KA3-201ENST00000379565 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
RPS6KA3-201ENST00000379565 FAM177BA6PVY3 158 aa21.43■■□□□ 1.02
RPS6KA3-201ENST00000379565 PLIN1O60240 522 aa21.43■■□□□ 1.02
RPS6KA3-201ENST00000379565 FOSBP53539 338 aa21.43■■□□□ 1.02
RPS6KA3-201ENST00000379565 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
RPS6KA3-201ENST00000379565 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa21.42■■□□□ 1.02
RPS6KA3-201ENST00000379565 IKQ13123 557 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
RPS6KA3-201ENST00000379565 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
RPS6KA3-201ENST00000379565 SLC4A3P48751 1232 aa21.42■■□□□ 1.02
RPS6KA3-201ENST00000379565 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
RPS6KA3-201ENST00000379565 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP21.41■■□□□ 1.022e-7■■■■□ 24.3
RPS6KA3-201ENST00000379565 NLRP2Q9NX02 1062 aa21.41■■□□□ 1.02
RPS6KA3-201ENST00000379565 RUFY2Q8WXA3 655 aa21.4■■□□□ 1.02
RPS6KA3-201ENST00000379565 CCDC144AA2RUR9 1427 aa21.4■■□□□ 1.02
RPS6KA3-201ENST00000379565 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
RPS6KA3-201ENST00000379565 FAM69CQ0P6D2 419 aa21.39■■□□□ 1.01
RPS6KA3-201ENST00000379565 CCDC18Q5T9S5 1454 aa21.38■■□□□ 1.01
RPS6KA3-201ENST00000379565 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
RPS6KA3-201ENST00000379565 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
RPS6KA3-201ENST00000379565 NEUROD6Q96NK8 337 aa21.38■■□□□ 1.01
RPS6KA3-201ENST00000379565 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa21.38■■□□□ 1.01
RPS6KA3-201ENST00000379565 CCDC70Q6NSX1 233 aa21.38■■□□□ 1.01
RPS6KA3-201ENST00000379565 UACAQ9BZF9 1416 aa21.37■■□□□ 1.01
RPS6KA3-201ENST00000379565 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
RPS6KA3-201ENST00000379565 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa21.37■■□□□ 1.01
RPS6KA3-201ENST00000379565 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa21.37■■□□□ 1.01
RPS6KA3-201ENST00000379565 RIC3Q7Z5B4 369 aa21.37■■□□□ 1.01
RPS6KA3-201ENST00000379565 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
RPS6KA3-201ENST00000379565 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa21.36■■□□□ 1.01
RPS6KA3-201ENST00000379565 OSCARQ8IYS5 282 aa21.36■■□□□ 1.01
RPS6KA3-201ENST00000379565 TMEM132AQ24JP5 1023 aa21.36■■□□□ 1.01
RPS6KA3-201ENST00000379565 FHOD3Q2V2M9 1422 aa21.35■■□□□ 1.01
RPS6KA3-201ENST00000379565 ODF2Q5BJF6 829 aa21.35■■□□□ 1.01
RPS6KA3-201ENST00000379565 KDM4AO75164 1064 aa21.35■■□□□ 1.01
RPS6KA3-201ENST00000379565 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
RPS6KA3-201ENST00000379565 ABCC8Q09428 1581 aa21.34■■□□□ 1.01
RPS6KA3-201ENST00000379565 WASHC4Q2M389 1173 aa21.34■■□□□ 1.01
RPS6KA3-201ENST00000379565 PAF1Q8N7H5 531 aa21.33■■□□□ 1.01
RPS6KA3-201ENST00000379565 VPS8Q8N3P4 1428 aa21.33■■□□□ 1.01
RPS6KA3-201ENST00000379565 ZNF592Q92610 1267 aa21.33■■□□□ 1
RPS6KA3-201ENST00000379565 TSPYL4Q9UJ04 414 aa21.32■■□□□ 1
RPS6KA3-201ENST00000379565 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa21.32■■□□□ 1
RPS6KA3-201ENST00000379565 RIPK4P57078 832 aa21.32■■□□□ 1
RPS6KA3-201ENST00000379565 KIF15Q9NS87 1388 aa21.32■■□□□ 1
RPS6KA3-201ENST00000379565 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
RPS6KA3-201ENST00000379565 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
RPS6KA3-201ENST00000379565 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
RPS6KA3-201ENST00000379565 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
RPS6KA3-201ENST00000379565 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
RPS6KA3-201ENST00000379565 COG6Q9Y2V7 657 aa21.3■■□□□ 1
RPS6KA3-201ENST00000379565 BICD2Q8TD16 824 aa21.3■■□□□ 1
RPS6KA3-201ENST00000379565 STRN4Q9NRL3 753 aa21.3■■□□□ 1
RPS6KA3-201ENST00000379565 HMOX1P09601 288 aa21.3■■□□□ 1
RPS6KA3-201ENST00000379565 PHLDB1Q86UU1 1377 aa21.3■■□□□ 1
RPS6KA3-201ENST00000379565 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
RPS6KA3-201ENST00000379565 RNF20Q5VTR2 975 aa21.29■■□□□ 1
RPS6KA3-201ENST00000379565 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
RPS6KA3-201ENST00000379565 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
RPS6KA3-201ENST00000379565 PDE3BQ13370 1112 aa21.28■■□□□ 1
RPS6KA3-201ENST00000379565 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP21.27■■□□□ 12e-6■■■■□ 20.6
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RPS6KA3-201ENST00000379565 E9PSI1 815 aa21.26■□□□□ 0.99
RPS6KA3-201ENST00000379565 DDX11L8A8MPP1 907 aa21.26■□□□□ 0.99
RPS6KA3-201ENST00000379565 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP21.26■□□□□ 0.99
RPS6KA3-201ENST00000379565 WASHC2AQ641Q2 1341 aa21.26■□□□□ 0.99
RPS6KA3-201ENST00000379565 EPS15P42566 896 aa21.26■□□□□ 0.99
RPS6KA3-201ENST00000379565 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP21.26■□□□□ 0.99
RPS6KA3-201ENST00000379565 WWC2Q6AWC2 1192 aa21.25■□□□□ 0.99
RPS6KA3-201ENST00000379565 SETQ01105 290 aaPredicted RBP21.24■□□□□ 0.99
RPS6KA3-201ENST00000379565 APAF1O14727 1248 aa21.24■□□□□ 0.99
RPS6KA3-201ENST00000379565 REC8O95072 547 aa21.24■□□□□ 0.99
RPS6KA3-201ENST00000379565 PTPRGP23470 1445 aa21.24■□□□□ 0.99
RPS6KA3-201ENST00000379565 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP21.22■□□□□ 0.99
RPS6KA3-201ENST00000379565 ESCO1Q5FWF5 840 aa21.22■□□□□ 0.99
RPS6KA3-201ENST00000379565 NLRP6P59044 892 aa21.21■□□□□ 0.99
RPS6KA3-201ENST00000379565 HOMER1Q86YM7 354 aa21.21■□□□□ 0.99
RPS6KA3-201ENST00000379565 ATP2B2Q01814 1243 aa21.21■□□□□ 0.99
RPS6KA3-201ENST00000379565 BRMS1Q9HCU9 246 aa21.21■□□□□ 0.99
RPS6KA3-201ENST00000379565 KIF6Q6ZMV9 814 aa21.2■□□□□ 0.99
RPS6KA3-201ENST00000379565 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP21.2■□□□□ 0.99
RPS6KA3-201ENST00000379565 CCDC88BA6NC98 1476 aa21.2■□□□□ 0.98
RPS6KA3-201ENST00000379565 PIP4K2BP78356 416 aa21.2■□□□□ 0.98
RPS6KA3-201ENST00000379565 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP21.19■□□□□ 0.98
RPS6KA3-201ENST00000379565 CRBNQ96SW2 442 aa21.19■□□□□ 0.98
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