RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376504.3

PTF1A-201, Transcript of pancreas associated transcription factor 1a, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTF1A, Length 1,537 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1A-201ENST00000376504 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa45.75■■■■■ 4.91
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PTF1A-201ENST00000376504 STAC3Q96MF2 364 aa45.7■■■■■ 4.91
PTF1A-201ENST00000376504 PRAG1Q86YV5 1406 aa45.69■■■■■ 4.9
PTF1A-201ENST00000376504 ZFYVE9O95405 1425 aa45.67■■■■■ 4.9
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PTF1A-201ENST00000376504 TMEM2Q9UHN6 1383 aa45.64■■■■■ 4.9
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PTF1A-201ENST00000376504 SLIT1O75093 1534 aa45.62■■■■■ 4.89
PTF1A-201ENST00000376504 ARHGAP23Q9P227 1491 aa45.61■■■■■ 4.89
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PTF1A-201ENST00000376504 CFAP70Q5T0N1 1121 aa45.36■■■■■ 4.85
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PTF1A-201ENST00000376504 ADGRB1O14514 1584 aa45.26■■■■■ 4.84
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PTF1A-201ENST00000376504 MED14O60244 1454 aa45.18■■■■■ 4.82
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PTF1A-201ENST00000376504 BCANQ96GW7 911 aa45.14■■■■■ 4.82
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PTF1A-201ENST00000376504 TECPR2O15040 1411 aa44.86■■■■■ 4.77
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PTF1A-201ENST00000376504 POGKQ9P215 609 aa44.65■■■■■ 4.74
PTF1A-201ENST00000376504 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP44.62■■■■■ 4.73
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PTF1A-201ENST00000376504 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP44.57■■■■■ 4.73
PTF1A-201ENST00000376504 WASHC2AQ641Q2 1341 aa44.55■■■■■ 4.72
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