RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000371417.3

ARRDC1-AS1-201, ARRDC1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ARRDC1-AS1, Length 1,409 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa31.63■■■□□ 2.65
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ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 IFT172Q9UG01 1749 aa31.59■■■□□ 2.65
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 DCAF11Q8TEB1 546 aa31.58■■■□□ 2.65
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ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 LTKP29376 864 aa31.56■■■□□ 2.64
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ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 ANKLE2Q86XL3 938 aa31.53■■■□□ 2.64
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ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP31.46■■■□□ 2.63
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa31.44■■■□□ 2.62
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ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 MED14O60244 1454 aa31.41■■■□□ 2.62
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ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP31.38■■■□□ 2.61
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ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa31.37■■■□□ 2.61
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ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 ROBO2Q9HCK4 1378 aa30.97■■■□□ 2.55
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ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 USP47Q96K76 1375 aa30.94■■■□□ 2.54
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ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP30.91■■■□□ 2.54
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 PRAM1Q96QH2 718 aa30.91■■■□□ 2.54
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ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa30.9■■■□□ 2.54
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ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 POGKQ9P215 609 aa30.88■■■□□ 2.53
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 LTBP4Q8N2S1 1624 aa30.87■■■□□ 2.53
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP30.86■■■□□ 2.53
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa30.85■■■□□ 2.53
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP30.84■■■□□ 2.53
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP30.84■■■□□ 2.53
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP30.84■■■□□ 2.53
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 LRRC7Q96NW7 1537 aa30.84■■■□□ 2.53
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 TMEM94Q12767 1356 aa30.81■■■□□ 2.52
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 QRICH2Q9H0J4 1663 aa30.8■■■□□ 2.52
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP30.79■■■□□ 2.52
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