RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 MBD3O95983 291 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRD-201ENST00000355233 DCTN1Q14203 1278 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRD-201ENST00000355233 TUBB4AP04350 444 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRD-201ENST00000355233 GSE1Q14687 1217 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRD-201ENST00000355233 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRD-201ENST00000355233 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
PTPRD-201ENST00000355233 PES1O00541 588 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
PTPRD-201ENST00000355233 MCM5P33992 734 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRD-201ENST00000355233 FAM43AQ8N2R8 423 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRD-201ENST00000355233 E9PSI1 815 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRD-201ENST00000355233 DCAF11Q8TEB1 546 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRD-201ENST00000355233 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRD-201ENST00000355233 RDXP35241 583 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
PTPRD-201ENST00000355233 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRD-201ENST00000355233 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
PTPRD-201ENST00000355233 ZMYM3Q14202 1370 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRD-201ENST00000355233 FAM184AQ8NB25 1140 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRD-201ENST00000355233 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRD-201ENST00000355233 NPHP1O15259 732 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRD-201ENST00000355233 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
PTPRD-201ENST00000355233 CCDC39Q9UFE4 941 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRD-201ENST00000355233 GCC2Q8IWJ2 1684 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRD-201ENST00000355233 CAVIN2O95810 425 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRD-201ENST00000355233 MRE11P49959 708 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRD-201ENST00000355233 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRD-201ENST00000355233 MCM3P25205 808 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRD-201ENST00000355233 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
PTPRD-201ENST00000355233 SYNJ1O43426 1573 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRD-201ENST00000355233 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
PTPRD-201ENST00000355233 RUFY2Q8WXA3 655 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRD-201ENST00000355233 DNMBPQ6XZF7 1577 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRD-201ENST00000355233 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRD-201ENST00000355233 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRD-201ENST00000355233 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
PTPRD-201ENST00000355233 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
PTPRD-201ENST00000355233 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP6.01□□□□□ -1.45
PTPRD-201ENST00000355233 AK7Q96M32 723 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRD-201ENST00000355233 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRD-201ENST00000355233 CREBRFQ8IUR6 639 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRD-201ENST00000355233 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
PTPRD-201ENST00000355233 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
PTPRD-201ENST00000355233 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
PTPRD-201ENST00000355233 TOPBP1Q92547 1522 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRD-201ENST00000355233 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRD-201ENST00000355233 MORC1Q86VD1 984 aa6□□□□□ -1.45
PTPRD-201ENST00000355233 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
PTPRD-201ENST00000355233 KIF14Q15058 1648 aa6□□□□□ -1.45
PTPRD-201ENST00000355233 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa6□□□□□ -1.45
PTPRD-201ENST00000355233 IQCEQ6IPM2 695 aa6□□□□□ -1.45
PTPRD-201ENST00000355233 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
PTPRD-201ENST00000355233 DRC7Q8IY82 874 aa6□□□□□ -1.45
PTPRD-201ENST00000355233 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa6□□□□□ -1.45
PTPRD-201ENST00000355233 HIP1O00291 1037 aa6□□□□□ -1.45
PTPRD-201ENST00000355233 PDCP20941 246 aa6□□□□□ -1.45
PTPRD-201ENST00000355233 CHMP5Q9NZZ3 219 aa6□□□□□ -1.45
PTPRD-201ENST00000355233 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa6□□□□□ -1.45
PTPRD-201ENST00000355233 GOLGA2Q08379 1002 aa6□□□□□ -1.45
PTPRD-201ENST00000355233 CCDC173Q0VFZ6 552 aa6□□□□□ -1.45
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PTPRD-201ENST00000355233 MPHOSPH9Q99550 1183 aa5.99□□□□□ -1.45
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PTPRD-201ENST00000355233 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
PTPRD-201ENST00000355233 DDX19BQ9UMR2 479 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRD-201ENST00000355233 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
PTPRD-201ENST00000355233 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
PTPRD-201ENST00000355233 CFAP74Q9C0B2 1584 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRD-201ENST00000355233 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
PTPRD-201ENST00000355233 PTPN23Q9H3S7 1636 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRD-201ENST00000355233 FGD1P98174 961 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRD-201ENST00000355233 RABEP1Q15276 862 aa5.98□□□□□ -1.45
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PTPRD-201ENST00000355233 AEBP1Q8IUX7 1158 aa5.98□□□□□ -1.45
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PTPRD-201ENST00000355233 FGD6Q6ZV73 1430 aa5.97□□□□□ -1.45
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PTPRD-201ENST00000355233 KCNJ4P48050 445 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRD-201ENST00000355233 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
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PTPRD-201ENST00000355233 CTR9Q6PD62 1173 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRD-201ENST00000355233 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa5.96□□□□□ -1.45
PTPRD-201ENST00000355233 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa5.96□□□□□ -1.45
PTPRD-201ENST00000355233 ARXQ96QS3 562 aa5.96□□□□□ -1.45
PTPRD-201ENST00000355233 TUBBP07437 444 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRD-201ENST00000355233 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRD-201ENST00000355233 A6NNZ2 444 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRD-201ENST00000355233 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
PTPRD-201ENST00000355233 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
PTPRD-201ENST00000355233 TUBB8Q3ZCM7 444 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRD-201ENST00000355233 NEMFO60524 1076 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRD-201ENST00000355233 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
PTPRD-201ENST00000355233 STK26Q9P289 416 aa5.96□□□□□ -1.46
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