RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345716.8

NISCH-201, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 5,238 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-201ENST00000345716 GPATCH3Q96I76 525 aa25.86■■□□□ 1.73
NISCH-201ENST00000345716 ANKRD45Q5TZF3 282 aa25.86■■□□□ 1.73
NISCH-201ENST00000345716 NAIPQ13075 1403 aa25.86■■□□□ 1.73
NISCH-201ENST00000345716 GGNBP2Q9H3C7 697 aa25.86■■□□□ 1.73
NISCH-201ENST00000345716 CHMP3Q9Y3E7 222 aa25.85■■□□□ 1.73
NISCH-201ENST00000345716 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
NISCH-201ENST00000345716 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa25.84■■□□□ 1.73
NISCH-201ENST00000345716 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
NISCH-201ENST00000345716 DDX19BQ9UMR2 479 aa25.82■■□□□ 1.72
NISCH-201ENST00000345716 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa25.82■■□□□ 1.72
NISCH-201ENST00000345716 WDR97A6NE52 1622 aa25.82■■□□□ 1.72
NISCH-201ENST00000345716 FOXD4L1Q9NU39 408 aa25.81■■□□□ 1.72
NISCH-201ENST00000345716 PPP2R1AP30153 589 aa25.8■■□□□ 1.72
NISCH-201ENST00000345716 GORABQ5T7V8 394 aa25.8■■□□□ 1.72
NISCH-201ENST00000345716 SLC4A3P48751 1232 aa25.79■■□□□ 1.72
NISCH-201ENST00000345716 IQGAP2Q13576 1575 aa25.78■■□□□ 1.72
NISCH-201ENST00000345716 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.78■■□□□ 1.72
NISCH-201ENST00000345716 SCAPERQ9BY12 1400 aa25.78■■□□□ 1.72
NISCH-201ENST00000345716 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.78■■□□□ 1.72
NISCH-201ENST00000345716 MTHFSP49914 203 aa25.78■■□□□ 1.72
NISCH-201ENST00000345716 MSNP26038 577 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
NISCH-201ENST00000345716 CDCA7LQ96GN5 454 aa25.77■■□□□ 1.72
NISCH-201ENST00000345716 TEFQ10587 303 aa25.76■■□□□ 1.71
NISCH-201ENST00000345716 C1orf141Q5JVX7 400 aa25.76■■□□□ 1.71
NISCH-201ENST00000345716 ROCK1Q13464 1354 aa25.76■■□□□ 1.71
NISCH-201ENST00000345716 TAF7LQ5H9L4 462 aa25.76■■□□□ 1.71
NISCH-201ENST00000345716 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
NISCH-201ENST00000345716 HMOX1P09601 288 aa25.75■■□□□ 1.71
NISCH-201ENST00000345716 NRDCO43847 1150 aa25.75■■□□□ 1.71
NISCH-201ENST00000345716 FANCIQ9NVI1 1328 aa25.75■■□□□ 1.71
NISCH-201ENST00000345716 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.75■■□□□ 1.71
NISCH-201ENST00000345716 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
NISCH-201ENST00000345716 CUL7Q14999 1698 aa25.74■■□□□ 1.71
NISCH-201ENST00000345716 ST18O60284 1047 aa25.73■■□□□ 1.71
NISCH-201ENST00000345716 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
NISCH-201ENST00000345716 MAP3K1Q13233 1512 aa25.71■■□□□ 1.71
NISCH-201ENST00000345716 GNAI1P63096 354 aa25.71■■□□□ 1.71
NISCH-201ENST00000345716 TCP11L2Q8N4U5 519 aa25.71■■□□□ 1.71
NISCH-201ENST00000345716 RILPL2Q969X0 211 aa25.7■■□□□ 1.7
NISCH-201ENST00000345716 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.7
NISCH-201ENST00000345716 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa25.7■■□□□ 1.7
NISCH-201ENST00000345716 PANK1Q8TE04 598 aa25.7■■□□□ 1.7
NISCH-201ENST00000345716 KIF16BQ96L93 1317 aa25.69■■□□□ 1.7
NISCH-201ENST00000345716 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
NISCH-201ENST00000345716 DRC7Q8IY82 874 aa25.69■■□□□ 1.7
NISCH-201ENST00000345716 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
NISCH-201ENST00000345716 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP25.68■■□□□ 1.7
NISCH-201ENST00000345716 PSME1Q06323 249 aa25.67■■□□□ 1.7
NISCH-201ENST00000345716 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa25.67■■□□□ 1.7
NISCH-201ENST00000345716 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP25.67■■□□□ 1.7
NISCH-201ENST00000345716 CCDC184Q52MB2 194 aa25.66■■□□□ 1.7
NISCH-201ENST00000345716 NECTIN2Q92692 538 aa25.66■■□□□ 1.7
NISCH-201ENST00000345716 USP35Q9P2H5 1018 aa25.66■■□□□ 1.7
NISCH-201ENST00000345716 ARHGEF11O15085 1522 aa25.65■■□□□ 1.7
NISCH-201ENST00000345716 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
NISCH-201ENST00000345716 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
NISCH-201ENST00000345716 PRAM1Q96QH2 718 aa25.65■■□□□ 1.7
NISCH-201ENST00000345716 ERBINQ96RT1 1412 aa25.64■■□□□ 1.69
NISCH-201ENST00000345716 PLB1Q6P1J6 1458 aa25.64■■□□□ 1.69
NISCH-201ENST00000345716 PTPN23Q9H3S7 1636 aa25.64■■□□□ 1.69
NISCH-201ENST00000345716 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
NISCH-201ENST00000345716 ABCC5O15440 1437 aa25.63■■□□□ 1.69
NISCH-201ENST00000345716 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
NISCH-201ENST00000345716 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.62■■□□□ 1.69
NISCH-201ENST00000345716 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
NISCH-201ENST00000345716 TSPYL4Q9UJ04 414 aa25.61■■□□□ 1.69
NISCH-201ENST00000345716 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa25.61■■□□□ 1.69
NISCH-201ENST00000345716 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa25.61■■□□□ 1.69
NISCH-201ENST00000345716 AAMPQ13685 434 aa25.6■■□□□ 1.69
NISCH-201ENST00000345716 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
NISCH-201ENST00000345716 CCDC141Q6ZP82 1450 aa25.59■■□□□ 1.69
NISCH-201ENST00000345716 RAPGEF3O95398 923 aa25.59■■□□□ 1.69
NISCH-201ENST00000345716 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP25.59■■□□□ 1.69
NISCH-201ENST00000345716 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP25.59■■□□□ 1.69
NISCH-201ENST00000345716 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP25.59■■□□□ 1.69
NISCH-201ENST00000345716 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
NISCH-201ENST00000345716 GRIN2AQ12879 1464 aa25.58■■□□□ 1.69
NISCH-201ENST00000345716 DDX11L8A8MPP1 907 aa25.58■■□□□ 1.68
NISCH-201ENST00000345716 TTC5Q8N0Z6 440 aa25.58■■□□□ 1.68
NISCH-201ENST00000345716 SLC52A1Q9NWF4 448 aa25.58■■□□□ 1.68
NISCH-201ENST00000345716 NEXNQ0ZGT2 675 aa25.57■■□□□ 1.68
NISCH-201ENST00000345716 LNPKQ9C0E8 428 aa25.57■■□□□ 1.68
NISCH-201ENST00000345716 AKNAQ7Z591 1439 aa25.56■■□□□ 1.68
NISCH-201ENST00000345716 NLRP6P59044 892 aa25.55■■□□□ 1.68
NISCH-201ENST00000345716 NUTM2GQ5VZR2 741 aa25.55■■□□□ 1.68
NISCH-201ENST00000345716 PRKAR2BP31323 418 aa25.55■■□□□ 1.68
NISCH-201ENST00000345716 REC8O95072 547 aa25.54■■□□□ 1.68
NISCH-201ENST00000345716 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa25.54■■□□□ 1.68
NISCH-201ENST00000345716 EVA1CP58658 441 aa25.53■■□□□ 1.68
NISCH-201ENST00000345716 TXNDC2Q86VQ3 553 aa25.53■■□□□ 1.68
NISCH-201ENST00000345716 KIAA2012Q0VF49 1180 aa25.53■■□□□ 1.68
NISCH-201ENST00000345716 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
NISCH-201ENST00000345716 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa25.52■■□□□ 1.68
NISCH-201ENST00000345716 CDK19Q9BWU1 502 aa25.51■■□□□ 1.68
NISCH-201ENST00000345716 UNC13AQ9UPW8 1703 aa25.51■■□□□ 1.67
NISCH-201ENST00000345716 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
NISCH-201ENST00000345716 CABP1Q9NZU7 370 aa25.51■■□□□ 1.67
NISCH-201ENST00000345716 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa25.5■■□□□ 1.67
NISCH-201ENST00000345716 DDX58O95786 925 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
NISCH-201ENST00000345716 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
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