RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000340994.4

PKHD1-201, Transcript of PKHD1, fibrocystin/polyductin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PKHD1, Length 11,589 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1-201ENST00000340994 KAT6BQ8WYB5 2073 aa9.94□□□□□ -0.82
PKHD1-201ENST00000340994 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
PKHD1-201ENST00000340994 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa9.94□□□□□ -0.82
PKHD1-201ENST00000340994 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
PKHD1-201ENST00000340994 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa9.93□□□□□ -0.82
PKHD1-201ENST00000340994 CCDC18Q5T9S5 1454 aa9.93□□□□□ -0.82
PKHD1-201ENST00000340994 BICD2Q8TD16 824 aa9.93□□□□□ -0.82
PKHD1-201ENST00000340994 OLFM4Q6UX06 510 aa9.93□□□□□ -0.82
PKHD1-201ENST00000340994 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
PKHD1-201ENST00000340994 TERF2IPQ9NYB0 399 aa9.93□□□□□ -0.82
PKHD1-201ENST00000340994 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
PKHD1-201ENST00000340994 SMARCE1Q969G3 411 aa9.92□□□□□ -0.82
PKHD1-201ENST00000340994 TSPY26PQ9H489 355 aa9.92□□□□□ -0.82
PKHD1-201ENST00000340994 CUX1P39880 1505 aa9.92□□□□□ -0.82
PKHD1-201ENST00000340994 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa9.92□□□□□ -0.82
PKHD1-201ENST00000340994 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
PKHD1-201ENST00000340994 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
PKHD1-201ENST00000340994 WWC1Q8IX03 1113 aa9.92□□□□□ -0.82
PKHD1-201ENST00000340994 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP9.92□□□□□ -0.82
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PKHD1-201ENST00000340994 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa9.91□□□□□ -0.82
PKHD1-201ENST00000340994 FOXD4L1Q9NU39 408 aa9.91□□□□□ -0.82
PKHD1-201ENST00000340994 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa9.91□□□□□ -0.82
PKHD1-201ENST00000340994 GIMAP7Q8NHV1 300 aa9.91□□□□□ -0.82
PKHD1-201ENST00000340994 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
PKHD1-201ENST00000340994 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
PKHD1-201ENST00000340994 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa9.91□□□□□ -0.82
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PKHD1-201ENST00000340994 MCTP1Q6DN14 999 aa9.91□□□□□ -0.82
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PKHD1-201ENST00000340994 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
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PKHD1-201ENST00000340994 C22orf23Q9BZE7 217 aa9.9□□□□□ -0.82
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PKHD1-201ENST00000340994 UQCRHP07919 91 aa9.9□□□□□ -0.83
PKHD1-201ENST00000340994 MCM3P25205 808 aa9.89□□□□□ -0.83
PKHD1-201ENST00000340994 PDCL3Q9H2J4 239 aa9.89□□□□□ -0.83
PKHD1-201ENST00000340994 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
PKHD1-201ENST00000340994 TRIM5Q9C035 493 aa9.89□□□□□ -0.83
PKHD1-201ENST00000340994 CPLX1O14810 134 aa9.89□□□□□ -0.83
PKHD1-201ENST00000340994 TRAK2O60296 914 aa9.89□□□□□ -0.83
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PKHD1-201ENST00000340994 SMC3Q9UQE7 1217 aa9.88□□□□□ -0.83
PKHD1-201ENST00000340994 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
PKHD1-201ENST00000340994 MARCH6O60337 910 aa9.88□□□□□ -0.83
PKHD1-201ENST00000340994 EZRP15311 586 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
PKHD1-201ENST00000340994 CCDC192P0DO97 292 aa9.88□□□□□ -0.83
PKHD1-201ENST00000340994 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP9.88□□□□□ -0.83
PKHD1-201ENST00000340994 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
PKHD1-201ENST00000340994 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
PKHD1-201ENST00000340994 CNTLNQ9NXG0 1405 aa9.87□□□□□ -0.83
PKHD1-201ENST00000340994 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
PKHD1-201ENST00000340994 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
PKHD1-201ENST00000340994 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
PKHD1-201ENST00000340994 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
PKHD1-201ENST00000340994 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
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PKHD1-201ENST00000340994 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
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PKHD1-201ENST00000340994 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
PKHD1-201ENST00000340994 GBP3Q9H0R5 595 aa9.87□□□□□ -0.83
PKHD1-201ENST00000340994 MAP9Q49MG5 647 aa9.87□□□□□ -0.83
PKHD1-201ENST00000340994 PSMA5P28066 241 aa9.86□□□□□ -0.83
PKHD1-201ENST00000340994 SCAPERQ9BY12 1400 aa9.86□□□□□ -0.83
PKHD1-201ENST00000340994 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa9.86□□□□□ -0.83
PKHD1-201ENST00000340994 SLC26A8Q96RN1 970 aa9.86□□□□□ -0.83
PKHD1-201ENST00000340994 MCM5P33992 734 aa9.86□□□□□ -0.83
PKHD1-201ENST00000340994 EPS15P42566 896 aa9.86□□□□□ -0.83
PKHD1-201ENST00000340994 ODF2Q5BJF6 829 aa9.86□□□□□ -0.83
PKHD1-201ENST00000340994 BRMS1Q9HCU9 246 aa9.86□□□□□ -0.83
PKHD1-201ENST00000340994 LUZP1Q86V48 1076 aa9.85□□□□□ -0.83
PKHD1-201ENST00000340994 ZSCAN30Q86W11 494 aa9.85□□□□□ -0.83
PKHD1-201ENST00000340994 BRPF3Q9ULD4 1205 aa9.85□□□□□ -0.83
PKHD1-201ENST00000340994 ERC2O15083 957 aa9.85□□□□□ -0.83
PKHD1-201ENST00000340994 PDE4CQ08493 712 aa9.85□□□□□ -0.83
PKHD1-201ENST00000340994 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa9.85□□□□□ -0.83
PKHD1-201ENST00000340994 CDC45O75419 566 aa9.85□□□□□ -0.83
PKHD1-201ENST00000340994 AMOTL1Q8IY63 956 aa9.85□□□□□ -0.83
PKHD1-201ENST00000340994 USP47Q96K76 1375 aa9.85□□□□□ -0.83
PKHD1-201ENST00000340994 LRRCC1Q9C099 1032 aa9.85□□□□□ -0.83
PKHD1-201ENST00000340994 CBFA2T2O43439 604 aa9.84□□□□□ -0.83
PKHD1-201ENST00000340994 GRPEL1Q9HAV7 217 aa9.84□□□□□ -0.83
PKHD1-201ENST00000340994 FILIP1LQ4L180 1135 aa9.84□□□□□ -0.83
PKHD1-201ENST00000340994 ANO2Q9NQ90 1003 aa9.84□□□□□ -0.83
PKHD1-201ENST00000340994 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa9.84□□□□□ -0.83
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PKHD1-201ENST00000340994 JMYQ8N9B5 988 aa9.84□□□□□ -0.83
PKHD1-201ENST00000340994 SMARCA2P51531 1590 aa9.84□□□□□ -0.83
PKHD1-201ENST00000340994 SHTN1A0MZ66 631 aa9.84□□□□□ -0.83
PKHD1-201ENST00000340994 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
PKHD1-201ENST00000340994 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
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PKHD1-201ENST00000340994 TRDNQ13061 729 aa9.83□□□□□ -0.84
PKHD1-201ENST00000340994 CCDC144AA2RUR9 1427 aa9.83□□□□□ -0.84
PKHD1-201ENST00000340994 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
PKHD1-201ENST00000340994 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
PKHD1-201ENST00000340994 DACH1Q9UI36 760 aa9.83□□□□□ -0.84
PKHD1-201ENST00000340994 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
PKHD1-201ENST00000340994 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa9.83□□□□□ -0.84
PKHD1-201ENST00000340994 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
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