RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320225.9

RNPS1-202, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RNPS1, Length 2,241 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPS1-202ENST00000320225 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa22.96■■□□□ 1.27
RNPS1-202ENST00000320225 RGL3Q3MIN7 710 aa22.96■■□□□ 1.27
RNPS1-202ENST00000320225 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa22.95■■□□□ 1.26
RNPS1-202ENST00000320225 NLRP1Q9C000 1473 aa22.94■■□□□ 1.26
RNPS1-202ENST00000320225 IGHDP01880 384 aa22.94■■□□□ 1.26
RNPS1-202ENST00000320225 SEC24BO95487 1268 aa22.93■■□□□ 1.26
RNPS1-202ENST00000320225 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
RNPS1-202ENST00000320225 TMF1P82094 1093 aa22.93■■□□□ 1.26
RNPS1-202ENST00000320225 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
RNPS1-202ENST00000320225 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
RNPS1-202ENST00000320225 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
RNPS1-202ENST00000320225 CCDC141Q6ZP82 1450 aa22.92■■□□□ 1.26
RNPS1-202ENST00000320225 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
RNPS1-202ENST00000320225 PREX2Q70Z35 1606 aa22.9■■□□□ 1.26
RNPS1-202ENST00000320225 UNC13BO14795 1591 aa22.89■■□□□ 1.26
RNPS1-202ENST00000320225 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP22.89■■□□□ 1.26
RNPS1-202ENST00000320225 BCAR3O75815 825 aa22.89■■□□□ 1.25
RNPS1-202ENST00000320225 ANTXR1Q9H6X2 564 aa22.89■■□□□ 1.25
RNPS1-202ENST00000320225 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
RNPS1-202ENST00000320225 PIK3C2GO75747 1445 aa22.86■■□□□ 1.25
RNPS1-202ENST00000320225 ABCC2Q92887 1545 aa22.84■■□□□ 1.25
RNPS1-202ENST00000320225 SYCP2Q9BX26 1530 aa22.83■■□□□ 1.25
RNPS1-202ENST00000320225 IQGAP1P46940 1657 aa22.83■■□□□ 1.24
RNPS1-202ENST00000320225 KNSTRNQ9Y448 316 aa22.82■■□□□ 1.24
RNPS1-202ENST00000320225 SYNMO15061 1565 aa22.81■■□□□ 1.24
RNPS1-202ENST00000320225 CCDC146Q8IYE0 955 aa22.81■■□□□ 1.24
RNPS1-202ENST00000320225 IQGAP3Q86VI3 1631 aa22.81■■□□□ 1.24
RNPS1-202ENST00000320225 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
RNPS1-202ENST00000320225 DMRT2Q9Y5R5 561 aa22.81■■□□□ 1.24
RNPS1-202ENST00000320225 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa22.8■■□□□ 1.24
RNPS1-202ENST00000320225 RSPH4AQ5TD94 716 aa22.8■■□□□ 1.24
RNPS1-202ENST00000320225 TTC37Q6PGP7 1564 aa22.8■■□□□ 1.24
RNPS1-202ENST00000320225 MYOM1P52179 1685 aa22.8■■□□□ 1.24
RNPS1-202ENST00000320225 MAST1Q9Y2H9 1570 aa22.79■■□□□ 1.24
RNPS1-202ENST00000320225 ATP10AO60312 1499 aa22.79■■□□□ 1.24
RNPS1-202ENST00000320225 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa22.79■■□□□ 1.24
RNPS1-202ENST00000320225 BECN1Q14457 450 aa22.79■■□□□ 1.24
RNPS1-202ENST00000320225 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
RNPS1-202ENST00000320225 APAF1O14727 1248 aa22.78■■□□□ 1.24
RNPS1-202ENST00000320225 PDE3AQ14432 1141 aa22.77■■□□□ 1.24
RNPS1-202ENST00000320225 CGNL1Q0VF96 1302 aa22.77■■□□□ 1.24
RNPS1-202ENST00000320225 PLXNC1O60486 1568 aa22.76■■□□□ 1.23
RNPS1-202ENST00000320225 CLUAP1Q96AJ1 413 aa22.76■■□□□ 1.23
RNPS1-202ENST00000320225 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP22.76■■□□□ 1.231e-6■■■■■ 28.8
RNPS1-202ENST00000320225 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa22.75■■□□□ 1.23
RNPS1-202ENST00000320225 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP22.75■■□□□ 1.239e-7■■□□□ 14
RNPS1-202ENST00000320225 FSD2A1L4K1 749 aa22.75■■□□□ 1.23
RNPS1-202ENST00000320225 E9PSI1 815 aa22.75■■□□□ 1.23
RNPS1-202ENST00000320225 MADDQ8WXG6 1647 aa22.75■■□□□ 1.23
RNPS1-202ENST00000320225 ARHGAP5Q13017 1502 aa22.74■■□□□ 1.23
RNPS1-202ENST00000320225 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP22.74■■□□□ 1.236e-26■■■■□ 21.8
RNPS1-202ENST00000320225 TBC1D32Q96NH3 1257 aa22.73■■□□□ 1.23
RNPS1-202ENST00000320225 PANK1Q8TE04 598 aa22.73■■□□□ 1.23
RNPS1-202ENST00000320225 TBC1D2Q9BYX2 928 aa22.73■■□□□ 1.23
RNPS1-202ENST00000320225 COG6Q9Y2V7 657 aa22.72■■□□□ 1.23
RNPS1-202ENST00000320225 NINLQ9Y2I6 1382 aa22.71■■□□□ 1.23
RNPS1-202ENST00000320225 ZMYM3Q14202 1370 aa22.68■■□□□ 1.22
RNPS1-202ENST00000320225 PANK2Q9BZ23 570 aa22.66■■□□□ 1.22
RNPS1-202ENST00000320225 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa22.66■■□□□ 1.22
RNPS1-202ENST00000320225 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
RNPS1-202ENST00000320225 MCM4P33991 863 aa22.65■■□□□ 1.22
RNPS1-202ENST00000320225 CLCN1P35523 988 aa22.65■■□□□ 1.22
RNPS1-202ENST00000320225 SCAPERQ9BY12 1400 aa22.64■■□□□ 1.22
RNPS1-202ENST00000320225 CHD1O14646 1710 aa22.64■■□□□ 1.21
RNPS1-202ENST00000320225 DUOX2Q9NRD8 1548 aa22.64■■□□□ 1.21
RNPS1-202ENST00000320225 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
RNPS1-202ENST00000320225 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa22.63■■□□□ 1.21
RNPS1-202ENST00000320225 NGEFQ8N5V2 710 aa22.63■■□□□ 1.21
RNPS1-202ENST00000320225 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa22.63■■□□□ 1.21
RNPS1-202ENST00000320225 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa22.63■■□□□ 1.21
RNPS1-202ENST00000320225 SHROOM2Q13796 1616 aa22.63■■□□□ 1.21
RNPS1-202ENST00000320225 CEP152O94986 1710 aa22.63■■□□□ 1.21
RNPS1-202ENST00000320225 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.62■■□□□ 1.21
RNPS1-202ENST00000320225 CDCA8Q53HL2 280 aa22.62■■□□□ 1.21
RNPS1-202ENST00000320225 WWC1Q8IX03 1113 aa22.62■■□□□ 1.21
RNPS1-202ENST00000320225 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa22.62■■□□□ 1.21
RNPS1-202ENST00000320225 RLBP1P12271 317 aa22.61■■□□□ 1.21
RNPS1-202ENST00000320225 TNNQ9UQP3 1299 aa22.61■■□□□ 1.21
RNPS1-202ENST00000320225 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
RNPS1-202ENST00000320225 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa22.59■■□□□ 1.21
RNPS1-202ENST00000320225 RARSP54136 660 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
RNPS1-202ENST00000320225 ARXQ96QS3 562 aa22.58■■□□□ 1.21
RNPS1-202ENST00000320225 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.2
RNPS1-202ENST00000320225 SHPRHQ149N8 1683 aa22.57■■□□□ 1.2
RNPS1-202ENST00000320225 CANXP27824 592 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
RNPS1-202ENST00000320225 AAMPQ13685 434 aa22.57■■□□□ 1.2
RNPS1-202ENST00000320225 CARD14Q9BXL6 1004 aa22.56■■□□□ 1.2
RNPS1-202ENST00000320225 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
RNPS1-202ENST00000320225 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
RNPS1-202ENST00000320225 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa22.55■■□□□ 1.2
RNPS1-202ENST00000320225 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
RNPS1-202ENST00000320225 TRAK2O60296 914 aa22.54■■□□□ 1.2
RNPS1-202ENST00000320225 PLCH2O75038 1416 aa22.53■■□□□ 1.2
RNPS1-202ENST00000320225 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
RNPS1-202ENST00000320225 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
RNPS1-202ENST00000320225 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
RNPS1-202ENST00000320225 IQSEC2Q5JU85 1478 aa22.52■■□□□ 1.2
RNPS1-202ENST00000320225 CHMP5Q9NZZ3 219 aa22.52■■□□□ 1.2
RNPS1-202ENST00000320225 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa22.52■■□□□ 1.2
RNPS1-202ENST00000320225 ERVK-7P63135 1459 aa22.52■■□□□ 1.2
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